Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G055366.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R626
Pfam PF00102
Panther DB PTHR19134 PTHR19134:SF317
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006470; protein dephosphorylation GO:0004725protein tyrosine phosphatase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G71860 : protein tyrosine phosphatase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g07590.1 : Protein-tyrosine phosphatase domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025719
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G055432 - -
2 Sobic.010G120700 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
3 Sobic.007G071950 - -
4 Sobic.001G388250 - -
5 Sobic.010G173201 - -
6 Sobic.007G072000 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
7 Sobic.008G027000 rp1, putative, expressed -
8 Sobic.005G141801 - -
9 Sobic.003G113200 5-nucleotidase domain-containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.001G272532 - -
11 Sobic.009G104201 - -
12 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
13 Sobic.001G271100 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
14 Sobic.010G057700 - -
15 Sobic.007G226600 homeobox associated leucine zipper, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
16 Sobic.005G013000 OsFBX181 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G164350 - -
18 Sobic.002G324200 translation initiation factor SUI1, putative, expressed K03113: EIF1, translation initiation factor 1
19 Sobic.010G225226 - -
20 Sobic.008G101000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -


Gene co-expression network
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