Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G141801.2,Sobic.005G141801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIK0 , A0A1Z5RIM8
Pfam -
Panther DB PTHR36778
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G19070 : Putative membrane lipoprotein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g05040.1 : cadmium-induced protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044996
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G055150 - -
2 Sobic.006G009400 G-patch domain containing protein, expressed -
3 Sobic.010G074500 -(PubMedID : 26320239)@phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
4 Sobic.001G111900 - -
5 Sobic.010G263800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@uncharacterized protein(PubMedID : 28640841)@UPF0183 protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G262200 - -
7 Sobic.005G110427 - -
8 Sobic.002G051450 - -
9 Sobic.009G117400 protein kinase domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G089650 - -
11 Sobic.010G057700 - -
12 Sobic.001G454401 - -
13 Sobic.003G031750 - -
14 Sobic.009G004700 stripe rust resistance protein Yr10, putative, expressed -
15 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G221425 - -
17 Sobic.010G225226 - -
18 Sobic.010G114600 expressed protein -
19 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
20 Sobic.010G144100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic005G141801--Sobic005G055150 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic005G141801--Sobic006G009400 Sobic010G074500 Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic010G074500 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G141801--Sobic001G111900 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic005G141801--Sobic010G263800 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic005G141801--Sobic006G262200 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic005G141801--Sobic005G110427 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic005G141801--Sobic002G051450 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic005G141801--Sobic009G117400 Sobic005G055150--Sobic006G009400 Sobic005G055150--Sobic005G141801 Sobic005G055150--Sobic005G110427 Sobic005G055150--Sobic001G111900 Sobic005G055150--Sobic006G262200 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic005G055150--Sobic009G127900 Sobic002G410200 Sobic002G410200 Sobic005G055150--Sobic002G410200 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic005G055150--Sobic009G209800 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic005G055150--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic010G263800 Sobic006G009400--Sobic005G055150 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic006G009400--Sobic002G313300 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic001G543900 Sobic006G009400--Sobic005G110427 Sobic001G477800 Sobic001G477800 Sobic006G009400--Sobic001G477800 Sobic007G073400 Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G073400 Sobic006G009400--Sobic007G178700 Sobic006G009400--Sobic006G262200 Sobic010G074500--Sobic010G263800 Sobic010G074500--Sobic006G009400 Sobic007G094801 Sobic007G094801 Sobic010G074500--Sobic007G094801 Sobic007G011400 Sobic007G011400 Sobic010G074500--Sobic007G011400 Sobic002G283300 Sobic002G283300 Sobic010G074500--Sobic002G283300 Sobic010G074500--Sobic005G141801 Sobic009G156000 Sobic009G156000 Sobic010G074500--Sobic009G156000 Sobic004G143700 Sobic004G143700 Sobic010G074500--Sobic004G143700 Sobic007G205800 Sobic007G205800 Sobic010G074500--Sobic007G205800 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic001G111900--Sobic010G056000 Sobic009G161600 Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G161600 Sobic001G111900--Sobic009G127900 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic001G454401 Sobic001G111900--Sobic007G178700 Sobic005G077466 Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic005G077466 Sobic001G111900--Sobic006G262200 Sobic003G084900 Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic003G084900 Sobic001G111900--Sobic006G009400 Sobic010G263800--Sobic006G009400 Sobic010G263800--Sobic007G011400 Sobic002G077200 Sobic002G077200 Sobic010G263800--Sobic002G077200 Sobic010G263800--Sobic002G313300 Sobic002G157300 Sobic002G157300 Sobic010G263800--Sobic002G157300 Sobic010G263800--Sobic007G205800 Sobic010G263800--Sobic009G117400 Sobic001G347600 Sobic001G347600 Sobic010G263800--Sobic001G347600 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic010G263800--Sobic008G034600 Sobic006G262200--Sobic005G110427 Sobic006G262200--Sobic006G009400 Sobic006G262200--Sobic002G051450 Sobic006G262200--Sobic001G111900 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic002G144966 Sobic006G262200--Sobic005G055150 Sobic006G262200--Sobic001G454401 Sobic004G005400 Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic004G005400 Sobic006G262200--Sobic005G141801 Sobic005G110427--Sobic006G262200 Sobic001G267233 Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic001G267233 Sobic005G110427--Sobic006G009400 Sobic005G110427--Sobic009G209800 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic005G110427--Sobic008G049701 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic005G110427--Sobic002G056100 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic005G110427--Sobic001G240400 Sobic005G139800 Sobic005G139800 Sobic005G110427--Sobic005G139800 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic005G110427--Sobic005G221425 Sobic002G051450--Sobic006G009400 Sobic002G051450--Sobic006G262200 Sobic005G015100 Sobic005G015100 Sobic002G051450--Sobic005G015100 Sobic002G051450--Sobic010G263800 Sobic002G051450--Sobic008G034600 Sobic004G256600 Sobic004G256600 Sobic002G051450--Sobic004G256600 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic002G051450--Sobic009G045700 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic002G051450--Sobic009G004700 Sobic005G077400 Sobic005G077400 Sobic002G051450--Sobic005G077400 Sobic009G117300 Sobic009G117300 Sobic009G117400--Sobic009G117300 Sobic004G271900 Sobic004G271900 Sobic009G117400--Sobic004G271900 Sobic009G117400--Sobic010G263800 Sobic009G117400--Sobic007G205800 Sobic009G117400--Sobic004G256600 Sobic009G117400--Sobic008G034600 Sobic009G117400--Sobic001G347600 Sobic004G057400 Sobic004G057400 Sobic009G117400--Sobic004G057400 Sobic006G209500 Sobic006G209500 Sobic009G117400--Sobic006G209500
Octagon: transcription factors


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