Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G144100.5,Sobic.010G144100.12,Sobic.010G144100.3,Sobic.010G144100.10,Sobic.010G144100.2,Sobic.010G144100.1,Sobic.010G144100.9,Sobic.010G144100.14,Sobic.010G144100.8,Sobic.010G144100.13,Sobic.010G144100.15,Sobic.010G144100.7,Sobic.010G144100.4,Sobic.010G144100.6,Sobic.010G144100.11
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VT07 , A0A1W0VT17 , A0A1W0VT25 , A0A1W0VT37 , A0A194YJ90
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G056100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
2 Sobic.003G031750 - -
3 Sobic.001G240400 ENT domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G045700 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
5 Sobic.001G305400 metallothionein family protein, expressed -
6 Sobic.005G141801 - -
7 Sobic.008G091900 - -
8 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
9 Sobic.008G036500 - -
10 Sobic.009G209800 OsFBX49 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.008G068400 - -
12 Sobic.003G089650 - -
13 Sobic.006G262200 - -
14 Sobic.007G094801 - -
15 Sobic.009G113600 - -
16 Sobic.003G416100 flowering promoting factor-like 1, putative, expressed -
17 Sobic.001G454401 - -
18 Sobic.001G253100 3-5 exonuclease family protein, putative, expressed -
19 Sobic.010G074500 -(PubMedID : 26320239)@phosphopantothenoylcysteine decarboxylase, putative, expressed K01598: PPCDC, phosphopantothenoylcysteine decarboxylase
20 Sobic.002G051450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic002G056100 Sobic002G056100 Sobic010G144100--Sobic002G056100 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic010G144100--Sobic003G031750 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic010G144100--Sobic001G240400 Sobic009G045700 Sobic009G045700 Sobic010G144100--Sobic009G045700 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic010G144100--Sobic001G305400 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic010G144100--Sobic005G141801 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic010G144100--Sobic008G091900 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G144100--Sobic002G221200 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic010G144100--Sobic008G036500 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic002G056100--Sobic009G209800 Sobic002G056100--Sobic001G240400 Sobic008G049701 Sobic008G049701 Sobic002G056100--Sobic008G049701 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic002G056100--Sobic001G253100 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic002G056100--Sobic005G117801 Sobic002G056100--Sobic001G305400 Sobic008G042250 Sobic008G042250 Sobic002G056100--Sobic008G042250 Sobic005G221425 Sobic005G221425 Sobic002G056100--Sobic005G221425 Sobic002G056100--Sobic002G221200 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic003G031750--Sobic002G062300 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic003G031750--Sobic007G059300 Sobic003G031750--Sobic008G091900 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic003G031750--Sobic009G113600 SobicK024000 SobicK024000 Sobic003G031750--SobicK024000 Sobic003G031750--Sobic002G221200 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic003G031750--Sobic009G196700 Sobic003G031750--Sobic001G253100 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic003G031750--Sobic008G079100 Sobic001G240400--Sobic009G209800 Sobic001G240400--Sobic002G221200 Sobic001G240400--Sobic001G253100 Sobic001G240400--Sobic005G117801 Sobic001G240400--Sobic002G056100 Sobic001G240400--Sobic008G091900 Sobic001G240400--Sobic008G049701 Sobic001G240400--Sobic001G305400 Sobic001G240400--Sobic005G221425 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic009G045700--Sobic002G051450 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic009G045700--Sobic006G009400 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic009G045700--Sobic006G262200 Sobic009G004700 Sobic009G004700 Sobic009G045700--Sobic009G004700 Sobic010G263800 Sobic010G263800 Sobic009G045700--Sobic010G263800 Sobic009G045700--Sobic010G144100 Sobic008G034600 Sobic008G034600 Sobic009G045700--Sobic008G034600 Sobic002G144966 Sobic002G144966 Sobic009G045700--Sobic002G144966 Sobic008G153600 Sobic008G153600 Sobic009G045700--Sobic008G153600 Sobic001G305400--Sobic002G221200 Sobic001G305400--Sobic008G091900 Sobic001G305400--Sobic001G240400 Sobic001G305400--Sobic005G117801 Sobic001G305400--Sobic002G056100 Sobic001G305400--Sobic009G209800 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic001G305400--Sobic005G142200 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic001G305400--Sobic002G060500 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic001G305400--Sobic001G261480 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic005G141801--Sobic005G055150 Sobic005G141801--Sobic006G009400 Sobic010G074500 Sobic010G074500 Sobic005G141801--Sobic010G074500 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic005G141801--Sobic001G111900 Sobic005G141801--Sobic010G263800 Sobic005G141801--Sobic006G262200 Sobic005G110427 Sobic005G110427 Sobic005G141801--Sobic005G110427 Sobic005G141801--Sobic002G051450 Sobic009G117400 Sobic009G117400 Sobic005G141801--Sobic009G117400 Sobic008G091900--Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic002G221200 Sobic008G091900--Sobic001G253100 Sobic008G091900--Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic003G031750 Sobic008G091900--Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic002G062300 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G091900--Sobic005G110430 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic008G091900--Sobic005G212600 Sobic002G221200--Sobic001G305400 Sobic002G221200--Sobic008G091900 Sobic002G221200--Sobic001G240400 Sobic002G221200--Sobic005G117801 Sobic002G221200--Sobic001G253100 Sobic002G221200--Sobic009G209800 Sobic002G221200--Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic002G062300 Sobic002G221200--Sobic003G031750 Sobic008G036500--Sobic002G221200 Sobic008G036500--Sobic009G209800 Sobic008G036500--Sobic001G240400 Sobic008G036500--Sobic001G253100 Sobic008G036500--Sobic003G031750 Sobic008G036500--Sobic005G117801 Sobic008G036500--Sobic008G091900 Sobic008G036500--Sobic009G196700 Sobic008G036500--Sobic002G056100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.