Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G059800.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q9G8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G106400 - -
2 Sobic.002G431200 - -
3 Sobic.002G344301 - -
4 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
5 Sobic.006G099501 - -
6 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
7 Sobic.009G121750 - -
8 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
9 Sobic.008G007300 HIT zinc finger domain containing protein, expressed K11663: ZNHIT1, zinc finger HIT domain-containing protein 1
10 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
11 Sobic.003G366850 - -
12 Sobic.005G221550 - -
13 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
14 Sobic.004G152601 - -
15 Sobic.001G355400 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
16 Sobic.005G079700 expressed protein -
17 Sobic.008G065400 - -
18 Sobic.005G043100 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed K12619: XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2
19 Sobic.003G429500 - -
20 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic002G059800--Sobic008G106400 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic002G059800--Sobic002G431200 Sobic002G344301 Sobic002G344301 Sobic002G059800--Sobic002G344301 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic002G059800--Sobic005G043400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic002G059800--Sobic006G099501 Sobic007G199300 Sobic007G199300 Sobic002G059800--Sobic007G199300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic002G059800--Sobic009G121750 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic002G059800--Sobic005G127300 Sobic008G007300 Sobic008G007300 Sobic002G059800--Sobic008G007300 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic002G431200--Sobic008G065400 Sobic002G431200--Sobic009G121750 Sobic002G431200--Sobic008G106400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic002G431200--Sobic003G366850 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic002G431200--Sobic003G429500 Sobic002G431200--Sobic005G079700 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G431200--SobicK010000 Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic002G431200--Sobic005G166300 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic002G431200--Sobic002G171400 Sobic002G344301--Sobic002G059800 Sobic002G344301--Sobic005G043400 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic002G344301--Sobic007G129401 Sobic002G344301--Sobic005G127300 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic002G344301--Sobic005G173366 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic002G344301--Sobic001G246200 Sobic002G344301--Sobic006G099501 Sobic005G059200 Sobic005G059200 Sobic002G344301--Sobic005G059200 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic002G344301--Sobic005G148400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic007G129401 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic007G199300--Sobic005G127300 Sobic007G199300--Sobic002G059800 Sobic002G108200 Sobic002G108200 Sobic007G199300--Sobic002G108200 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic007G199300--Sobic004G204400 Sobic007G199300--Sobic008G106400 Sobic007G199300--Sobic005G221550 Sobic007G199300--Sobic002G431200 Sobic007G199300--Sobic009G121750 Sobic007G199300--Sobic005G079700 Sobic009G121750--Sobic002G431200 Sobic009G121750--Sobic008G065400 Sobic009G121750--Sobic005G079700 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic006G249200 Sobic009G121750--Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic008G106400 Sobic009G121750--Sobic002G171400 Sobic009G121750--Sobic003G366850 Sobic005G127300--Sobic009G101600 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic005G127300--Sobic004G200866 Sobic005G127300--SobicK010000 Sobic005G127300--Sobic005G142200 Sobic005G127300--Sobic003G366850 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic005G127300--Sobic001G261480 Sobic005G127300--Sobic009G026400 Sobic005G127300--Sobic002G060500 Sobic003G156766 Sobic003G156766 Sobic005G127300--Sobic003G156766 Sobic008G007300--Sobic002G059800 Sobic008G007300--Sobic005G043400 Sobic008G007300--Sobic005G148400 Sobic008G007300--Sobic006G099501 Sobic008G007300--Sobic005G221550 Sobic008G007300--Sobic005G085100 Sobic008G007300--Sobic005G148500 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic008G007300--Sobic005G134501 Sobic004G253601 Sobic004G253601 Sobic008G007300--Sobic004G253601
Octagon: transcription factors


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