Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G099501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RD79
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK18166
Barley -
Wheat TraesCS7B02G338000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
2 Sobic.002G059800 - -
3 Sobic.010G143400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
4 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
5 Sobic.008G106400 - -
6 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G085100 - -
8 Sobic.001G164200 cytochrome P450, putative, expressed -
9 Sobic.002G094500 cytochrome P450, putative, expressed -
10 Sobic.008G013900 O-methyltransferase, putative, expressed -
11 Sobic.001G246200 MBTB49 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.005G208950 - -
14 Sobic.005G134501 - -
15 Sobic.009G253200 RNA polymerase sigma factor, putative, expressed -
16 Sobic.006G099600 - -
17 Sobic.001G001200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.002G344301 - -
19 Sobic.007G129401 - -
20 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic002G059800--Sobic008G106400 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic002G059800--Sobic002G431200 Sobic002G344301 Sobic002G344301 Sobic002G059800--Sobic002G344301 Sobic002G059800--Sobic005G043400 Sobic002G059800--Sobic006G099501 Sobic007G199300 Sobic007G199300 Sobic002G059800--Sobic007G199300 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic002G059800--Sobic009G121750 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic002G059800--Sobic005G127300 Sobic008G007300 Sobic008G007300 Sobic002G059800--Sobic008G007300 Sobic007G131200 Sobic007G131200 Sobic010G143400--Sobic007G131200 Sobic009G197000 Sobic009G197000 Sobic010G143400--Sobic009G197000 Sobic010G143400--Sobic002G128400 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic010G143400--Sobic008G013900 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic010G143400--Sobic009G162401 Sobic010G270900 Sobic010G270900 Sobic010G143400--Sobic010G270900 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic010G143400--Sobic001G246200 Sobic004G315100 Sobic004G315100 Sobic010G143400--Sobic004G315100 Sobic010G143400--Sobic006G099501 Sobic002G128400--Sobic005G085100 Sobic002G128400--Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic009G162401 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic002G128400--Sobic005G148400 Sobic002G128400--Sobic005G043400 Sobic002G128400--Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic005G148500 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic002G128400--Sobic005G221550 Sobic002G212700 Sobic002G212700 Sobic002G128400--Sobic002G212700 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic005G148500--Sobic005G085100 Sobic005G148500--Sobic005G148400 Sobic005G148500--Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic005G043400 Sobic005G148500--Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic005G142200 Sobic005G148500--Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic005G221550 Sobic005G148500--Sobic009G026400 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic001G164200--Sobic008G013900 Sobic001G182300 Sobic001G182300 Sobic001G164200--Sobic001G182300 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic001G164200--Sobic008G049000 Sobic001G164200--Sobic002G094500 Sobic001G164200--Sobic007G129401 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic001G164200--Sobic003G219000 Sobic001G164200--Sobic009G026400 Sobic001G164200--Sobic002G060500 Sobic001G164200--Sobic005G043400 Sobic002G094500--Sobic001G164200 Sobic002G094500--Sobic001G182300 Sobic002G094500--Sobic008G049000 Sobic002G094500--Sobic008G013900 Sobic002G094500--Sobic003G219000 Sobic002G094500--Sobic005G043400 Sobic002G094500--Sobic007G129401 Sobic002G094500--Sobic009G026400 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic002G094500--Sobic007G066050
Octagon: transcription factors


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