Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G208950.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJY5
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF59
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G29060 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47870.1 : GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029170 , Zm00025a029171
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G099501 - -
2 Sobic.008G106400 - -
3 Sobic.006G099600 - -
4 Sobic.010G116800 DNA topoisomerase I family protein, expressed -
5 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
7 Sobic.001G412600 expressed protein -
8 Sobic.004G136800 - -
9 Sobic.004G174800 expressed protein -
10 Sobic.004G346200 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
11 Sobic.005G123900 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
12 Sobic.002G120501 - -
13 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
14 Sobic.005G166300 Brix domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.002G059800 - -
16 Sobic.002G023400 expressed protein -
17 Sobic.005G134501 - -
18 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G042900 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G208950 Sobic005G208950 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic005G208950--Sobic006G099501 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G208950--Sobic008G106400 Sobic006G099600 Sobic006G099600 Sobic005G208950--Sobic006G099600 Sobic010G116800 Sobic010G116800 Sobic005G208950--Sobic010G116800 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G208950--Sobic008G045600 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G208950--Sobic005G043400 Sobic001G412600 Sobic001G412600 Sobic005G208950--Sobic001G412600 Sobic004G136800 Sobic004G136800 Sobic005G208950--Sobic004G136800 Sobic004G174800 Sobic004G174800 Sobic005G208950--Sobic004G174800 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic006G099600--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic006G099600--Sobic009G162401 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic006G099600--Sobic001G271000 Sobic006G099600--Sobic005G085100 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic006G099600--Sobic005G148400 Sobic006G099600--Sobic005G043400 Sobic006G099600--Sobic006G099501 Sobic006G099600--Sobic010G143400 Sobic006G099600--Sobic005G221550 Sobic010G116800--Sobic008G106400 Sobic010G116800--Sobic005G221550 Sobic010G116800--Sobic008G045600 Sobic008G043900 Sobic008G043900 Sobic010G116800--Sobic008G043900 Sobic005G094200 Sobic005G094200 Sobic010G116800--Sobic005G094200 Sobic010G116800--Sobic006G099600 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic010G116800--Sobic003G266700 Sobic010G116800--Sobic007G005000 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic010G116800--Sobic006G190800 Sobic008G045600--Sobic007G005000 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic008G045600--Sobic005G142200 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic008G045600--Sobic005G061100 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic003G436900 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic008G045600--Sobic004G121000 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic008G045600--Sobic010G144000 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic004G317600 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic009G101600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G045600--Sobic001G305400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic001G412600--Sobic006G249200 Sobic001G412600--Sobic008G106400 Sobic001G412600--Sobic004G136800 Sobic001G412600--Sobic002G059800 Sobic001G412600--Sobic007G005000 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic001G412600--Sobic009G121750 Sobic001G412600--Sobic006G099501 Sobic001G412600--Sobic005G079700 Sobic008G012700 Sobic008G012700 Sobic001G412600--Sobic008G012700 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic004G136800--Sobic002G017000 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic004G136800--Sobic002G007600 Sobic006G085200 Sobic006G085200 Sobic004G136800--Sobic006G085200 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic004G136800--Sobic003G090500 Sobic004G136800--Sobic001G412600 Sobic004G136800--Sobic006G099501 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic004G136800--Sobic005G162300 Sobic003G119100 Sobic003G119100 Sobic004G174800--Sobic003G119100 Sobic001G450300 Sobic001G450300 Sobic004G174800--Sobic001G450300 Sobic008G009000 Sobic008G009000 Sobic004G174800--Sobic008G009000 Sobic004G217900 Sobic004G217900 Sobic004G174800--Sobic004G217900 Sobic008G099900 Sobic008G099900 Sobic004G174800--Sobic008G099900 Sobic005G210700 Sobic005G210700 Sobic004G174800--Sobic005G210700 Sobic004G346200 Sobic004G346200 Sobic004G174800--Sobic004G346200 Sobic008G082800 Sobic008G082800 Sobic004G174800--Sobic008G082800 Sobic008G170600 Sobic008G170600 Sobic004G174800--Sobic008G170600
Octagon: transcription factors


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