Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G023400.1
Synonym Sb02g002160
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q8T1
Pfam PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g24240.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
2 Sobic.005G218100 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed -
3 Sobic.005G162300 cytochrome P450 51, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
4 Sobic.002G144025 - -
5 Sobic.002G216801 - -
6 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
7 Sobic.001G166000 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
8 Sobic.010G161900 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
9 Sobic.004G166301 - -
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11 Sobic.002G007600 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.005G161800 - -
16 Sobic.005G123900 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
17 Sobic.002G047100 - -
18 Sobic.001G275800 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
19 Sobic.002G120501 - -
20 Sobic.010G100432 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic002G023400--Sobic008G167100 Sobic005G218100 Sobic005G218100 Sobic002G023400--Sobic005G218100 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic002G023400--Sobic005G162300 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic002G023400--Sobic002G144025 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic002G023400--Sobic002G216801 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic002G023400--Sobic007G104300 Sobic001G166000 Sobic001G166000 Sobic002G023400--Sobic001G166000 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic010G161900 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic002G023400--Sobic004G166301 Sobic008G167100--Sobic002G023400 Sobic008G167100--Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic007G104300 Sobic008G167100--Sobic002G144025 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic004G166301 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic008G167100--Sobic003G090500 Sobic008G167100--Sobic002G216801 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic008G167100--Sobic003G219000 Sobic005G218100--Sobic002G023400 Sobic001G275800 Sobic001G275800 Sobic005G218100--Sobic001G275800 Sobic001G229500 Sobic001G229500 Sobic005G218100--Sobic001G229500 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic005G218100--Sobic002G007600 Sobic005G218100--Sobic008G167100 Sobic005G218100--Sobic005G162300 Sobic005G218100--Sobic001G166000 Sobic005G142900 Sobic005G142900 Sobic005G218100--Sobic005G142900 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic005G218100--Sobic002G017000 Sobic005G162300--Sobic008G167100 Sobic005G162300--Sobic002G023400 Sobic005G162300--Sobic002G017000 Sobic005G162300--Sobic002G007600 Sobic005G162300--Sobic003G090500 Sobic005G162300--Sobic002G216801 Sobic005G162300--Sobic005G218100 Sobic002G144025--Sobic008G167100 Sobic002G144025--Sobic007G104300 Sobic002G144025--Sobic002G023400 Sobic006G268700 Sobic006G268700 Sobic002G144025--Sobic006G268700 Sobic001G181900 Sobic001G181900 Sobic002G144025--Sobic001G181900 Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic002G144025--Sobic010G160100 Sobic002G144025--Sobic008G049000 Sobic002G144025--Sobic004G166301 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic002G144025--Sobic002G047100 Sobic002G216801--Sobic008G167100 Sobic002G216801--Sobic002G023400 Sobic002G216801--Sobic002G017000 Sobic002G216801--Sobic005G162300 Sobic002G216801--Sobic002G007600 Sobic002G216801--Sobic005G218100 Sobic002G216801--Sobic002G144025 Sobic007G104300--Sobic004G166301 Sobic007G104300--Sobic008G167100 Sobic007G104300--Sobic002G144025 Sobic007G104300--Sobic001G181900 Sobic007G104300--Sobic002G023400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic007G104300--Sobic005G148400 Sobic007G104300--Sobic008G049000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic007G104300--Sobic008G013900 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic007G104300--Sobic002G128400 Sobic001G166000--Sobic002G023400 Sobic001G166000--Sobic005G218100 Sobic005G101850 Sobic005G101850 Sobic001G166000--Sobic005G101850 Sobic001G166000--Sobic001G275800 Sobic001G166000--Sobic002G144025 Sobic001G166000--Sobic008G167100 Sobic007G037700 Sobic007G037700 Sobic001G166000--Sobic007G037700 Sobic001G166000--Sobic002G047100 Sobic002G316000 Sobic002G316000 Sobic001G166000--Sobic002G316000 Sobic010G161900--Sobic002G023400 Sobic005G123900 Sobic005G123900 Sobic010G161900--Sobic005G123900 Sobic004G325300 Sobic004G325300 Sobic010G161900--Sobic004G325300 Sobic010G161900--Sobic008G167100 Sobic005G054700 Sobic005G054700 Sobic010G161900--Sobic005G054700 Sobic004G247300 Sobic004G247300 Sobic010G161900--Sobic004G247300 Sobic003G103000 Sobic003G103000 Sobic010G161900--Sobic003G103000 Sobic003G320500 Sobic003G320500 Sobic010G161900--Sobic003G320500 Sobic007G187400 Sobic007G187400 Sobic010G161900--Sobic007G187400 Sobic006G235650 Sobic006G235650 Sobic004G166301--Sobic006G235650 Sobic010G100432 Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic007G104300 Sobic006G033380 Sobic006G033380 Sobic004G166301--Sobic006G033380 Sobic004G166301--Sobic008G167100 Sobic004G166301--Sobic002G023400 Sobic004G166301--Sobic002G128400 Sobic004G166301--Sobic005G148400 Sobic004G166301--Sobic002G144025
Octagon: transcription factors


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