Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G166000.2
Synonym Sb01g014500
Functional annotation B3 DNA binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5S6I7
Pfam PF02362
Panther DB PTHR31391:SF23 PTHR31391
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33280 : AP2/B3-like transcriptional factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g42280.1 : B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G023400 expressed protein -
2 Sobic.005G218100 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed -
3 Sobic.005G101850 - -
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8 Sobic.002G047100 - -
9 Sobic.002G316000 expressed protein -
10 Sobic.005G203600 - -
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12 Sobic.002G216801 - -
13 Sobic.005G162300 cytochrome P450 51, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
14 Sobic.007G123200 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G358900 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
16 Sobic.001G229500 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.003G219000 integral membrane protein TmpA, putative, expressed -
18 Sobic.010G202700 AP2 domain containing protein, expressed K09284: AP2-like factor, euAP2 lineage
19 Sobic.004G298400 WRKY36, expressed -
20 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G166000 Sobic001G166000 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic001G166000--Sobic002G023400 Sobic005G218100 Sobic005G218100 Sobic001G166000--Sobic005G218100 Sobic005G101850 Sobic005G101850 Sobic001G166000--Sobic005G101850 Sobic001G275800 Sobic001G275800 Sobic001G166000--Sobic001G275800 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic001G166000--Sobic002G144025 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic001G166000--Sobic008G167100 Sobic007G037700 Sobic007G037700 Sobic001G166000--Sobic007G037700 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic001G166000--Sobic002G047100 Sobic002G316000 Sobic002G316000 Sobic001G166000--Sobic002G316000 Sobic002G023400--Sobic008G167100 Sobic002G023400--Sobic005G218100 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic002G023400--Sobic005G162300 Sobic002G023400--Sobic002G144025 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic002G023400--Sobic002G216801 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic002G023400--Sobic007G104300 Sobic002G023400--Sobic001G166000 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic010G161900 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic002G023400--Sobic004G166301 Sobic005G218100--Sobic002G023400 Sobic005G218100--Sobic001G275800 Sobic001G229500 Sobic001G229500 Sobic005G218100--Sobic001G229500 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic005G218100--Sobic002G007600 Sobic005G218100--Sobic008G167100 Sobic005G218100--Sobic005G162300 Sobic005G218100--Sobic001G166000 Sobic005G142900 Sobic005G142900 Sobic005G218100--Sobic005G142900 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic005G218100--Sobic002G017000 Sobic005G101850--Sobic001G166000 Sobic001G310166 Sobic001G310166 Sobic005G101850--Sobic001G310166 Sobic005G101850--Sobic005G218100 Sobic004G161650 Sobic004G161650 Sobic005G101850--Sobic004G161650 Sobic005G203600 Sobic005G203600 Sobic005G101850--Sobic005G203600 Sobic002G099401 Sobic002G099401 Sobic005G101850--Sobic002G099401 Sobic005G112900 Sobic005G112900 Sobic005G101850--Sobic005G112900 Sobic005G101850--Sobic002G023400 Sobic004G298400 Sobic004G298400 Sobic005G101850--Sobic004G298400 Sobic001G275800--Sobic005G203600 Sobic007G090415 Sobic007G090415 Sobic001G275800--Sobic007G090415 Sobic007G123200 Sobic007G123200 Sobic001G275800--Sobic007G123200 Sobic001G275800--Sobic001G229500 Sobic008G130700 Sobic008G130700 Sobic001G275800--Sobic008G130700 Sobic005G020200 Sobic005G020200 Sobic001G275800--Sobic005G020200 Sobic001G275800--Sobic005G218100 Sobic003G176200 Sobic003G176200 Sobic001G275800--Sobic003G176200 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic001G275800--Sobic006G001400 Sobic002G144025--Sobic008G167100 Sobic002G144025--Sobic007G104300 Sobic002G144025--Sobic002G023400 Sobic006G268700 Sobic006G268700 Sobic002G144025--Sobic006G268700 Sobic001G181900 Sobic001G181900 Sobic002G144025--Sobic001G181900 Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic002G144025--Sobic010G160100 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic002G144025--Sobic008G049000 Sobic002G144025--Sobic004G166301 Sobic002G144025--Sobic002G047100 Sobic008G167100--Sobic002G023400 Sobic008G167100--Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic007G104300 Sobic008G167100--Sobic002G144025 Sobic008G167100--Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic004G166301 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic008G167100--Sobic003G090500 Sobic008G167100--Sobic002G216801 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic008G167100--Sobic003G219000 Sobic007G037700--Sobic006G001400 Sobic005G196500 Sobic005G196500 Sobic007G037700--Sobic005G196500 Sobic010G202700 Sobic010G202700 Sobic007G037700--Sobic010G202700 Sobic007G037700--Sobic001G275800 Sobic006G233600 Sobic006G233600 Sobic007G037700--Sobic006G233600 Sobic005G209900 Sobic005G209900 Sobic007G037700--Sobic005G209900 Sobic009G196200 Sobic009G196200 Sobic007G037700--Sobic009G196200 Sobic007G037700--Sobic007G090415 Sobic010G124200 Sobic010G124200 Sobic007G037700--Sobic010G124200 Sobic002G047100--Sobic008G049000 Sobic001G132500 Sobic001G132500 Sobic002G047100--Sobic001G132500 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic002G047100--Sobic006G132200 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic002G047100--Sobic003G038000 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic002G047100--Sobic007G066050 Sobic002G047100--Sobic003G219000 Sobic002G318900 Sobic002G318900 Sobic002G047100--Sobic002G318900 Sobic002G047100--Sobic008G167100 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic002G047100--Sobic008G091900 Sobic010G208500 Sobic010G208500 Sobic002G316000--Sobic010G208500 Sobic002G316000--Sobic002G047100 Sobic004G154600 Sobic004G154600 Sobic002G316000--Sobic004G154600 Sobic002G316000--Sobic003G038000 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic002G316000--Sobic007G115000 Sobic001G184400 Sobic001G184400 Sobic002G316000--Sobic001G184400 Sobic010G091700 Sobic010G091700 Sobic002G316000--Sobic010G091700 Sobic004G193800 Sobic004G193800 Sobic002G316000--Sobic004G193800 Sobic003G424100 Sobic003G424100 Sobic002G316000--Sobic003G424100
Octagon: transcription factors


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