Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G104300.2,Sobic.007G104300.1
Synonym RPS2, Sb07g014410
Functional annotation Leucine Rich Repeat family protein, expressed
UniProt A0A1Z5RA17 , A0A1Z5R945
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF498
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45200 : Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g08370.1 : Leucine Rich Repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK07721 , PNT71909
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic007G104300--Sobic004G166301 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic007G104300--Sobic008G167100 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic007G104300--Sobic002G144025 Sobic001G181900 Sobic001G181900 Sobic007G104300--Sobic001G181900 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic007G104300--Sobic002G023400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic007G104300--Sobic005G148400 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic007G104300--Sobic008G049000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic007G104300--Sobic008G013900 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic007G104300--Sobic002G128400 Sobic006G235650 Sobic006G235650 Sobic004G166301--Sobic006G235650 Sobic010G100432 Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic007G104300 Sobic006G033380 Sobic006G033380 Sobic004G166301--Sobic006G033380 Sobic004G166301--Sobic008G167100 Sobic004G166301--Sobic002G023400 Sobic004G166301--Sobic002G128400 Sobic004G166301--Sobic005G148400 Sobic004G166301--Sobic002G144025 Sobic008G167100--Sobic002G023400 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic007G104300 Sobic008G167100--Sobic002G144025 Sobic008G167100--Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic004G166301 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic008G167100--Sobic003G090500 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic008G167100--Sobic002G216801 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic008G167100--Sobic003G219000 Sobic002G144025--Sobic008G167100 Sobic002G144025--Sobic007G104300 Sobic002G144025--Sobic002G023400 Sobic006G268700 Sobic006G268700 Sobic002G144025--Sobic006G268700 Sobic002G144025--Sobic001G181900 Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic002G144025--Sobic010G160100 Sobic002G144025--Sobic008G049000 Sobic002G144025--Sobic004G166301 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic002G144025--Sobic002G047100 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic001G181900--Sobic005G043400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic001G181900--Sobic002G060500 Sobic001G181900--Sobic007G104300 Sobic001G181900--Sobic005G148400 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic001G181900--Sobic005G085100 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic001G181900--Sobic008G045600 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic001G181900--Sobic001G271000 Sobic001G181900--Sobic008G049000 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic001G181900--Sobic009G101600 Sobic002G023400--Sobic008G167100 Sobic005G218100 Sobic005G218100 Sobic002G023400--Sobic005G218100 Sobic002G023400--Sobic005G162300 Sobic002G023400--Sobic002G144025 Sobic002G023400--Sobic002G216801 Sobic002G023400--Sobic007G104300 Sobic001G166000 Sobic001G166000 Sobic002G023400--Sobic001G166000 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic004G166301 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic008G049000--Sobic003G219000 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G049000--Sobic006G132200 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic008G049000--Sobic008G108900 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic008G049000--Sobic001G164200 Sobic008G049000--Sobic002G047100 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic008G049000--Sobic009G196700 Sobic008G049000--Sobic008G013900 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic008G049000--Sobic002G094500 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic008G049000--Sobic007G066050 Sobic008G013900--Sobic001G164200 Sobic001G182300 Sobic001G182300 Sobic008G013900--Sobic001G182300 Sobic008G124100 Sobic008G124100 Sobic008G013900--Sobic008G124100 Sobic008G013900--Sobic003G219000 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic008G013900--Sobic007G129401 Sobic008G013900--Sobic008G049000 Sobic008G013900--Sobic002G094500 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic008G013900--Sobic003G176100 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic008G013900--Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic005G085100 Sobic002G128400--Sobic010G143400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic005G148400 Sobic002G128400--Sobic005G043400 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic005G148500 Sobic002G128400--Sobic005G221550 Sobic002G212700 Sobic002G212700 Sobic002G128400--Sobic002G212700
Octagon: transcription factors


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