Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G235650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RF97
Pfam PF04434 PF03101 PF10551
Panther DB PTHR31669 PTHR31669:SF52
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0006355regulation of transcription, DNA-templated


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G38180 : FAR1-related sequence 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g18370.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G100432 - -
2 Sobic.004G166301 - -
3 Sobic.006G033380 - -
4 Sobic.002G120501 - -
5 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
6 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
7 Sobic.003G164000 - -
8 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
9 Sobic.003G090500 expressed protein K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
10 Sobic.001G246300 MBTB2 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.002G023400 expressed protein -
12 Sobic.006G099600 - -
13 Sobic.002G094500 cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G099501 - -
16 Sobic.010G143400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
17 Sobic.008G075300 RecF/RecN/SMC N terminal domain containing protein, expressed -
18 Sobic.005G123900 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
19 Sobic.005G145950 - -
20 Sobic.004G346200 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G235650 Sobic006G235650 Sobic010G100432 Sobic010G100432 Sobic006G235650--Sobic010G100432 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic006G235650--Sobic004G166301 Sobic006G033380 Sobic006G033380 Sobic006G235650--Sobic006G033380 Sobic002G120501 Sobic002G120501 Sobic006G235650--Sobic002G120501 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic006G235650--Sobic002G128400 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic006G235650--Sobic007G104300 Sobic003G164000 Sobic003G164000 Sobic006G235650--Sobic003G164000 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic006G235650--Sobic008G167100 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic006G235650--Sobic003G090500 Sobic010G100432--Sobic006G235650 Sobic010G100432--Sobic004G166301 Sobic010G100432--Sobic006G033380 Sobic010G100432--Sobic002G120501 Sobic010G100432--Sobic002G128400 Sobic010G100432--Sobic007G104300 Sobic010G100432--Sobic003G164000 Sobic010G100432--Sobic008G167100 Sobic010G100432--Sobic003G090500 Sobic004G166301--Sobic006G235650 Sobic004G166301--Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic007G104300 Sobic004G166301--Sobic006G033380 Sobic004G166301--Sobic008G167100 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic004G166301--Sobic002G023400 Sobic004G166301--Sobic002G128400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic004G166301--Sobic005G148400 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic004G166301--Sobic002G144025 Sobic006G033380--Sobic004G166301 Sobic006G033380--Sobic006G235650 Sobic006G033380--Sobic010G100432 Sobic004G346200 Sobic004G346200 Sobic006G033380--Sobic004G346200 Sobic007G087900 Sobic007G087900 Sobic006G033380--Sobic007G087900 Sobic006G033380--Sobic007G104300 Sobic004G291600 Sobic004G291600 Sobic006G033380--Sobic004G291600 Sobic009G116400 Sobic009G116400 Sobic006G033380--Sobic009G116400 Sobic006G033380--Sobic005G148400 Sobic002G120501--Sobic010G100432 Sobic002G120501--Sobic006G235650 Sobic002G120501--Sobic003G090500 Sobic002G120501--Sobic004G166301 Sobic002G120501--Sobic002G128400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic002G120501--Sobic006G099501 Sobic002G120501--Sobic008G167100 Sobic010G112900 Sobic010G112900 Sobic002G120501--Sobic010G112900 Sobic002G120501--Sobic002G023400 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic002G128400--Sobic005G085100 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic010G143400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic005G148400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic002G128400--Sobic005G043400 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic001G246200 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic002G128400--Sobic005G148500 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic002G128400--Sobic005G221550 Sobic002G212700 Sobic002G212700 Sobic002G128400--Sobic002G212700 Sobic007G104300--Sobic004G166301 Sobic007G104300--Sobic008G167100 Sobic007G104300--Sobic002G144025 Sobic001G181900 Sobic001G181900 Sobic007G104300--Sobic001G181900 Sobic007G104300--Sobic002G023400 Sobic007G104300--Sobic005G148400 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic007G104300--Sobic008G049000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic007G104300--Sobic008G013900 Sobic007G104300--Sobic002G128400 Sobic003G164000--Sobic010G100432 Sobic003G164000--Sobic006G235650 Sobic003G164000--Sobic002G120501 Sobic003G164000--Sobic004G166301 Sobic003G164000--Sobic003G090500 Sobic003G164000--Sobic008G167100 Sobic003G164000--Sobic006G099501 Sobic003G164000--Sobic002G023400 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic003G164000--Sobic002G017000 Sobic008G167100--Sobic002G023400 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic007G104300 Sobic008G167100--Sobic002G144025 Sobic008G167100--Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic004G166301 Sobic008G167100--Sobic003G090500 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic008G167100--Sobic002G216801 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic008G167100--Sobic003G219000 Sobic003G090500--Sobic002G017000 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic003G090500--Sobic002G007600 Sobic003G090500--Sobic008G167100 Sobic003G090500--Sobic005G162300 Sobic003G090500--Sobic002G023400 Sobic003G090500--Sobic002G120501 Sobic006G085200 Sobic006G085200 Sobic003G090500--Sobic006G085200
Octagon: transcription factors


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