Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G164000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q3J8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G100432 - -
2 Sobic.006G235650 - -
3 Sobic.002G120501 - -
4 Sobic.004G166301 - -
5 Sobic.003G090500 expressed protein K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
6 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
7 Sobic.006G099501 - -
8 Sobic.002G023400 expressed protein -
9 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
13 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
14 Sobic.002G007600 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.005G218100 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed -
16 Sobic.001G001200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.010G143400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.006G033380 - -
19 Sobic.005G162300 cytochrome P450 51, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
20 Sobic.009G116400 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G164000 Sobic003G164000 Sobic010G100432 Sobic010G100432 Sobic003G164000--Sobic010G100432 Sobic006G235650 Sobic006G235650 Sobic003G164000--Sobic006G235650 Sobic002G120501 Sobic002G120501 Sobic003G164000--Sobic002G120501 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic003G164000--Sobic004G166301 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic003G164000--Sobic003G090500 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic003G164000--Sobic008G167100 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic003G164000--Sobic006G099501 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic003G164000--Sobic002G023400 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic003G164000--Sobic002G017000 Sobic010G100432--Sobic006G235650 Sobic010G100432--Sobic004G166301 Sobic006G033380 Sobic006G033380 Sobic010G100432--Sobic006G033380 Sobic010G100432--Sobic002G120501 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic010G100432--Sobic002G128400 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic010G100432--Sobic007G104300 Sobic010G100432--Sobic003G164000 Sobic010G100432--Sobic008G167100 Sobic010G100432--Sobic003G090500 Sobic006G235650--Sobic010G100432 Sobic006G235650--Sobic004G166301 Sobic006G235650--Sobic006G033380 Sobic006G235650--Sobic002G120501 Sobic006G235650--Sobic002G128400 Sobic006G235650--Sobic007G104300 Sobic006G235650--Sobic003G164000 Sobic006G235650--Sobic008G167100 Sobic006G235650--Sobic003G090500 Sobic002G120501--Sobic010G100432 Sobic002G120501--Sobic006G235650 Sobic002G120501--Sobic003G090500 Sobic002G120501--Sobic004G166301 Sobic002G120501--Sobic002G128400 Sobic002G120501--Sobic006G099501 Sobic002G120501--Sobic008G167100 Sobic010G112900 Sobic010G112900 Sobic002G120501--Sobic010G112900 Sobic002G120501--Sobic002G023400 Sobic004G166301--Sobic006G235650 Sobic004G166301--Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic007G104300 Sobic004G166301--Sobic006G033380 Sobic004G166301--Sobic008G167100 Sobic004G166301--Sobic002G023400 Sobic004G166301--Sobic002G128400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic004G166301--Sobic005G148400 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic004G166301--Sobic002G144025 Sobic003G090500--Sobic002G017000 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic003G090500--Sobic002G007600 Sobic003G090500--Sobic008G167100 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic003G090500--Sobic005G162300 Sobic003G090500--Sobic002G023400 Sobic003G090500--Sobic002G120501 Sobic006G085200 Sobic006G085200 Sobic003G090500--Sobic006G085200 Sobic008G167100--Sobic002G023400 Sobic008G167100--Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic007G104300 Sobic008G167100--Sobic002G144025 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic004G166301 Sobic008G167100--Sobic003G090500 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic008G167100--Sobic002G216801 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic008G167100--Sobic003G219000 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic002G023400--Sobic008G167100 Sobic005G218100 Sobic005G218100 Sobic002G023400--Sobic005G218100 Sobic002G023400--Sobic005G162300 Sobic002G023400--Sobic002G144025 Sobic002G023400--Sobic002G216801 Sobic002G023400--Sobic007G104300 Sobic001G166000 Sobic001G166000 Sobic002G023400--Sobic001G166000 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic004G166301 Sobic002G017000--Sobic002G017000 Sobic002G017000--Sobic002G007600 Sobic002G017000--Sobic006G085200 Sobic002G017000--Sobic003G090500 Sobic004G136800 Sobic004G136800 Sobic002G017000--Sobic004G136800 Sobic002G017000--Sobic005G162300 Sobic002G017000--Sobic002G216801 Sobic005G161800 Sobic005G161800 Sobic002G017000--Sobic005G161800
Octagon: transcription factors


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