Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G120501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W3F5
Pfam PF00098 PF14111
Panther DB PTHR33170
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0003676nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g18260.1 : zinc knuckle domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G100432 - -
2 Sobic.006G235650 - -
3 Sobic.003G090500 expressed protein K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
4 Sobic.004G166301 - -
5 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
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7 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
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9 Sobic.002G023400 expressed protein -
10 Sobic.003G164000 - -
11 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G017000 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.005G123900 ATP binding protein, putative, expressed K17592: sacsin
15 Sobic.002G007600 3-5 exonuclease domain-containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G162300 cytochrome P450 51, putative, expressed K05917: sterol 14alpha-demethylase
17 Sobic.008G106400 - -
18 Sobic.009G253200 RNA polymerase sigma factor, putative, expressed -
19 Sobic.005G134501 - -
20 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G120501 Sobic002G120501 Sobic010G100432 Sobic010G100432 Sobic002G120501--Sobic010G100432 Sobic006G235650 Sobic006G235650 Sobic002G120501--Sobic006G235650 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic002G120501--Sobic003G090500 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic002G120501--Sobic004G166301 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic002G120501--Sobic002G128400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic002G120501--Sobic006G099501 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic002G120501--Sobic008G167100 Sobic010G112900 Sobic010G112900 Sobic002G120501--Sobic010G112900 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic002G120501--Sobic002G023400 Sobic010G100432--Sobic006G235650 Sobic010G100432--Sobic004G166301 Sobic006G033380 Sobic006G033380 Sobic010G100432--Sobic006G033380 Sobic010G100432--Sobic002G120501 Sobic010G100432--Sobic002G128400 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic010G100432--Sobic007G104300 Sobic003G164000 Sobic003G164000 Sobic010G100432--Sobic003G164000 Sobic010G100432--Sobic008G167100 Sobic010G100432--Sobic003G090500 Sobic006G235650--Sobic010G100432 Sobic006G235650--Sobic004G166301 Sobic006G235650--Sobic006G033380 Sobic006G235650--Sobic002G120501 Sobic006G235650--Sobic002G128400 Sobic006G235650--Sobic007G104300 Sobic006G235650--Sobic003G164000 Sobic006G235650--Sobic008G167100 Sobic006G235650--Sobic003G090500 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic003G090500--Sobic002G017000 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic003G090500--Sobic002G007600 Sobic003G090500--Sobic008G167100 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic003G090500--Sobic005G162300 Sobic003G090500--Sobic002G023400 Sobic003G090500--Sobic002G120501 Sobic006G085200 Sobic006G085200 Sobic003G090500--Sobic006G085200 Sobic004G166301--Sobic006G235650 Sobic004G166301--Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic007G104300 Sobic004G166301--Sobic006G033380 Sobic004G166301--Sobic008G167100 Sobic004G166301--Sobic002G023400 Sobic004G166301--Sobic002G128400 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic004G166301--Sobic005G148400 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic004G166301--Sobic002G144025 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic002G128400--Sobic005G085100 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic010G143400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic005G148400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic002G128400--Sobic005G043400 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic001G246200 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic002G128400--Sobic005G148500 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic002G128400--Sobic005G221550 Sobic002G212700 Sobic002G212700 Sobic002G128400--Sobic002G212700 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic008G167100--Sobic002G023400 Sobic008G167100--Sobic005G162300 Sobic008G167100--Sobic007G104300 Sobic008G167100--Sobic002G144025 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic008G049000 Sobic008G167100--Sobic004G166301 Sobic008G167100--Sobic003G090500 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic008G167100--Sobic002G216801 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic008G167100--Sobic003G219000 Sobic010G112900--Sobic005G043400 Sobic010G112900--Sobic002G120501 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic010G112900--Sobic010G120700 Sobic010G112900--Sobic006G099501 Sobic010G106800 Sobic010G106800 Sobic010G112900--Sobic010G106800 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic010G112900--Sobic010G068200 Sobic010G116800 Sobic010G116800 Sobic010G112900--Sobic010G116800 Sobic010G112900--Sobic002G128400 Sobic005G072000 Sobic005G072000 Sobic010G112900--Sobic005G072000 Sobic002G023400--Sobic008G167100 Sobic005G218100 Sobic005G218100 Sobic002G023400--Sobic005G218100 Sobic002G023400--Sobic005G162300 Sobic002G023400--Sobic002G144025 Sobic002G023400--Sobic002G216801 Sobic002G023400--Sobic007G104300 Sobic001G166000 Sobic001G166000 Sobic002G023400--Sobic001G166000 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic004G166301
Octagon: transcription factors


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