Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G112900.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YJJ1
Pfam -
Panther DB PTHR33033 PTHR33033:SF23
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g13430.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
2 Sobic.002G120501 - -
3 Sobic.010G120700 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
4 Sobic.006G099501 - -
5 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -
6 Sobic.010G068200 flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase, putative, expressed -
7 Sobic.010G116800 DNA topoisomerase I family protein, expressed -
8 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
9 Sobic.005G072000 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
10 Sobic.004G196500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
11 Sobic.005G134501 - -
12 Sobic.001G246200 MBTB49 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
13 Sobic.002G094500 cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.004G152601 - -
15 Sobic.003G090500 expressed protein K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
16 Sobic.010G173201 - -
17 Sobic.008G101000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
18 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.007G129401 - -
20 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G112900 Sobic010G112900 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic010G112900--Sobic005G043400 Sobic002G120501 Sobic002G120501 Sobic010G112900--Sobic002G120501 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic010G112900--Sobic010G120700 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic010G112900--Sobic006G099501 Sobic010G106800 Sobic010G106800 Sobic010G112900--Sobic010G106800 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic010G112900--Sobic010G068200 Sobic010G116800 Sobic010G116800 Sobic010G112900--Sobic010G116800 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic010G112900--Sobic002G128400 Sobic005G072000 Sobic005G072000 Sobic010G112900--Sobic005G072000 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic010G100432 Sobic010G100432 Sobic002G120501--Sobic010G100432 Sobic006G235650 Sobic006G235650 Sobic002G120501--Sobic006G235650 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic002G120501--Sobic003G090500 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic002G120501--Sobic004G166301 Sobic002G120501--Sobic002G128400 Sobic002G120501--Sobic006G099501 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic002G120501--Sobic008G167100 Sobic002G120501--Sobic010G112900 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic002G120501--Sobic002G023400 Sobic010G173201 Sobic010G173201 Sobic010G120700--Sobic010G173201 Sobic010G120700--Sobic010G068200 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic010G120700--Sobic005G173366 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic010G120700--Sobic008G055366 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic010G120700--Sobic008G055432 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic010G120700--Sobic003G416100 Sobic010G120700--Sobic007G129401 Sobic010G120700--Sobic004G196500 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic010G120700--Sobic010G164350 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic010G106800--Sobic005G043400 Sobic010G106800--Sobic009G101600 Sobic010G106800--Sobic010G068200 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic010G106800--Sobic001G271000 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic010G106800--Sobic005G043800 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic010G106800--Sobic005G148400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic010G106800--Sobic008G045600 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic010G106800--Sobic005G210300 Sobic010G106800--Sobic004G196500 Sobic010G068200--Sobic010G173201 Sobic010G068200--Sobic007G129401 Sobic010G068200--Sobic004G196500 Sobic010G068200--Sobic010G120700 Sobic010G068200--Sobic005G173366 Sobic010G068200--Sobic009G026400 Sobic010G068200--Sobic005G043400 Sobic010G068200--Sobic003G416100 Sobic010G068200--Sobic002G060500 Sobic010G116800--Sobic008G106400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic010G116800--Sobic005G221550 Sobic010G116800--Sobic008G045600 Sobic008G043900 Sobic008G043900 Sobic010G116800--Sobic008G043900 Sobic005G094200 Sobic005G094200 Sobic010G116800--Sobic005G094200 Sobic006G099600 Sobic006G099600 Sobic010G116800--Sobic006G099600 Sobic003G266700 Sobic003G266700 Sobic010G116800--Sobic003G266700 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic010G116800--Sobic007G005000 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic010G116800--Sobic006G190800 Sobic002G128400--Sobic005G085100 Sobic002G128400--Sobic010G143400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic005G148400 Sobic002G128400--Sobic005G043400 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic005G148500 Sobic002G128400--Sobic005G221550 Sobic002G212700 Sobic002G212700 Sobic002G128400--Sobic002G212700 Sobic007G071700 Sobic007G071700 Sobic005G072000--Sobic007G071700 Sobic010G184900 Sobic010G184900 Sobic005G072000--Sobic010G184900 Sobic007G020000 Sobic007G020000 Sobic005G072000--Sobic007G020000 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G072000--Sobic010G144000 Sobic008G101000 Sobic008G101000 Sobic005G072000--Sobic008G101000 Sobic009G221000 Sobic009G221000 Sobic005G072000--Sobic009G221000 Sobic005G072000--Sobic010G106800 Sobic007G071950 Sobic007G071950 Sobic005G072000--Sobic007G071950 Sobic009G092800 Sobic009G092800 Sobic005G072000--Sobic009G092800
Octagon: transcription factors


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