Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G148500.1
Synonym
Functional annotation OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PSL7
Pfam -
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF90
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g09478.1 : OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G020560.2 , HORVU6Hr1G020560.1 , HORVU6Hr1G020560.3 , HORVU6Hr1G020560.4
Wheat TraesCS6A02G114700 , TraesCS6D02G103200 , TraesCS6B02G142100 , TraesCS6B02G142100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G085100 - -
2 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
5 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G142200 expressed protein -
7 Sobic.001G164200 cytochrome P450, putative, expressed -
8 Sobic.005G221550 - -
9 Sobic.009G026400 - -
10 Sobic.007G129401 - -
11 Sobic.K010000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.005G170800 OsFBDUF55 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G013900 O-methyltransferase, putative, expressed -
14 Sobic.003G436900 OsFBX178 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.004G196500 hydrolase, alpha/beta fold family domain containing protein, expressed -
16 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
17 Sobic.005G061100 - -
18 Sobic.001G271000 - -
19 Sobic.005G054300 pollen signalling protein with adenylyl cyclase activity, putative, expressed -
20 Sobic.002G305500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic005G148500--Sobic005G085100 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic005G148500--Sobic005G148400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G148500--Sobic002G060500 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G148500--Sobic005G043400 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G148500--Sobic009G101600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G148500--Sobic005G142200 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic005G148500--Sobic001G164200 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic005G148500--Sobic005G221550 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G148500--Sobic009G026400 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic002G060500--Sobic009G026400 Sobic002G060500--Sobic009G101600 Sobic002G060500--Sobic005G142200 SobicK010000 SobicK010000 Sobic002G060500--SobicK010000 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic002G060500--Sobic004G196500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic002G060500--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic005G043400 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic002G060500--Sobic007G059300 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic009G101600--Sobic005G142200 Sobic009G101600--Sobic009G026400 Sobic009G101600--Sobic002G060500 Sobic009G101600--SobicK010000 Sobic004G200866 Sobic004G200866 Sobic009G101600--Sobic004G200866 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic009G101600--Sobic005G054300 Sobic009G101600--Sobic004G196500 Sobic009G101600--Sobic005G043400 Sobic005G054600 Sobic005G054600 Sobic009G101600--Sobic005G054600 Sobic005G142200--Sobic009G101600 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G142200--Sobic004G121000 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic003G436900 Sobic005G142200--Sobic002G060500 Sobic005G142200--Sobic004G200866 Sobic005G142200--Sobic009G026400 Sobic005G142200--Sobic001G305400 Sobic005G142200--Sobic002G221200 Sobic005G142200--SobicK010000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic001G164200--Sobic008G013900 Sobic001G182300 Sobic001G182300 Sobic001G164200--Sobic001G182300 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic001G164200--Sobic008G049000 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic001G164200--Sobic002G094500 Sobic001G164200--Sobic007G129401 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic001G164200--Sobic003G219000 Sobic001G164200--Sobic009G026400 Sobic001G164200--Sobic002G060500 Sobic001G164200--Sobic005G043400 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800 Sobic009G026400--Sobic002G060500 Sobic009G026400--Sobic009G101600 Sobic009G026400--Sobic007G059300 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic009G026400--Sobic002G062300 Sobic009G026400--Sobic004G196500 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic009G026400--Sobic009G113600 Sobic009G026400--Sobic005G054600 Sobic009G026400--Sobic005G142200 Sobic009G026400--Sobic005G054300
Octagon: transcription factors


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