Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G099600.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RD62
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g34520.1 : ulp1 protease family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G128400 WRKY115, expressed -
2 Sobic.009G162401 - -
3 Sobic.001G271000 - -
4 Sobic.005G085100 - -
5 Sobic.005G148400 OsFBX404 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
7 Sobic.006G099501 - -
8 Sobic.010G143400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
9 Sobic.005G221550 - -
10 Sobic.001G246300 MBTB2 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.002G212700 - -
12 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -
13 Sobic.004G173400 expressed protein -
14 Sobic.009G101600 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
15 Sobic.008G106400 - -
16 Sobic.010G116800 DNA topoisomerase I family protein, expressed -
17 Sobic.001G355400 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
18 Sobic.006G235650 - -
19 Sobic.010G100432 - -
20 Sobic.005G148500 OsFBX402 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G099600 Sobic006G099600 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic006G099600--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic006G099600--Sobic009G162401 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic006G099600--Sobic001G271000 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic006G099600--Sobic005G085100 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic006G099600--Sobic005G148400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic006G099600--Sobic005G043400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic006G099600--Sobic006G099501 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099600--Sobic010G143400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic006G099600--Sobic005G221550 Sobic002G128400--Sobic005G085100 Sobic002G128400--Sobic010G143400 Sobic002G128400--Sobic009G162401 Sobic002G128400--Sobic005G148400 Sobic002G128400--Sobic005G043400 Sobic001G246200 Sobic001G246200 Sobic002G128400--Sobic001G246200 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic002G128400--Sobic005G148500 Sobic002G128400--Sobic005G221550 Sobic002G212700 Sobic002G212700 Sobic002G128400--Sobic002G212700 Sobic009G162401--Sobic005G085100 Sobic009G162401--Sobic002G128400 Sobic009G162401--Sobic010G143400 Sobic009G162401--Sobic005G148400 Sobic009G162401--Sobic001G246200 Sobic009G162401--Sobic001G271000 Sobic009G162401--Sobic005G148500 Sobic005G170800 Sobic005G170800 Sobic009G162401--Sobic005G170800 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic009G162401--Sobic008G013900 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic001G271000--Sobic005G210300 Sobic001G271000--Sobic005G085100 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic001G271000--Sobic009G101600 Sobic005G054300 Sobic005G054300 Sobic001G271000--Sobic005G054300 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic001G271000--Sobic005G142200 Sobic001G271000--Sobic005G043400 Sobic001G271000--Sobic005G148400 Sobic001G271000--Sobic005G221550 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic001G271000--Sobic002G060500 Sobic005G085100--Sobic005G148500 Sobic005G085100--Sobic005G148400 Sobic005G085100--Sobic005G043400 Sobic005G085100--Sobic005G221550 Sobic005G085100--Sobic002G128400 Sobic005G085100--Sobic009G162401 Sobic005G085100--Sobic005G170800 Sobic005G085100--Sobic001G271000 Sobic005G085100--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G085100 Sobic005G148400--Sobic005G148500 Sobic005G148400--Sobic005G043400 Sobic005G148400--Sobic005G221550 Sobic005G148400--Sobic002G060500 Sobic005G148400--Sobic009G101600 Sobic005G148400--Sobic005G170800 Sobic005G148400--Sobic005G142200 Sobic005G148400--Sobic002G128400 Sobic005G043400--Sobic002G060500 Sobic005G043400--Sobic009G101600 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G043400--Sobic009G026400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G043400--Sobic004G196500 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G043400--Sobic007G129401 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G043400--SobicK010000 Sobic005G043400--Sobic005G085100 Sobic005G043400--Sobic005G142200 Sobic003G201850 Sobic003G201850 Sobic005G043400--Sobic003G201850 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic007G131200 Sobic007G131200 Sobic010G143400--Sobic007G131200 Sobic009G197000 Sobic009G197000 Sobic010G143400--Sobic009G197000 Sobic010G143400--Sobic002G128400 Sobic010G143400--Sobic008G013900 Sobic010G143400--Sobic009G162401 Sobic010G270900 Sobic010G270900 Sobic010G143400--Sobic010G270900 Sobic010G143400--Sobic001G246200 Sobic004G315100 Sobic004G315100 Sobic010G143400--Sobic004G315100 Sobic010G143400--Sobic006G099501 Sobic005G221550--Sobic005G085100 Sobic005G134501 Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G134501 Sobic005G221550--Sobic005G148400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic008G045600 Sobic005G221550--Sobic005G170800 Sobic005G221550--Sobic008G106400 Sobic005G221550--Sobic005G148500 Sobic005G221550--Sobic005G142200 Sobic006G190800 Sobic006G190800 Sobic005G221550--Sobic006G190800
Octagon: transcription factors


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