Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G173400.1
Synonym Sb04g022405
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YRC7
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g20310.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020618
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G099600 - -
2 Sobic.001G535300 - -
3 Sobic.005G031800 - -
4 Sobic.009G063450 - -
5 Sobic.006G045200 - -
6 Sobic.007G022400 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR31 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
7 Sobic.002G128750 - -
8 Sobic.004G159600 - -
9 Sobic.007G202700 exo70 exocyst complex subunit, putative, expressed -
10 Sobic.001G327400 - -
11 Sobic.001G489225 - -
12 Sobic.009G031450 - -
13 Sobic.001G168700 expressed protein -
14 Sobic.002G013500 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.009G162401 - -
16 Sobic.002G289350 - -
17 Sobic.010G143400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
18 Sobic.002G088800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
19 Sobic.005G108300 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14506: jasmonic acid-amino synthetase
20 Sobic.005G019900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G173400 Sobic004G173400 Sobic006G099600 Sobic006G099600 Sobic004G173400--Sobic006G099600 Sobic001G535300 Sobic001G535300 Sobic004G173400--Sobic001G535300 Sobic005G031800 Sobic005G031800 Sobic004G173400--Sobic005G031800 Sobic009G063450 Sobic009G063450 Sobic004G173400--Sobic009G063450 Sobic006G045200 Sobic006G045200 Sobic004G173400--Sobic006G045200 Sobic007G022400 Sobic007G022400 Sobic004G173400--Sobic007G022400 Sobic002G128750 Sobic002G128750 Sobic004G173400--Sobic002G128750 Sobic004G159600 Sobic004G159600 Sobic004G173400--Sobic004G159600 Sobic007G202700 Sobic007G202700 Sobic004G173400--Sobic007G202700 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic006G099600--Sobic002G128400 Sobic009G162401 Sobic009G162401 Sobic006G099600--Sobic009G162401 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic006G099600--Sobic001G271000 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic006G099600--Sobic005G085100 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic006G099600--Sobic005G148400 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic006G099600--Sobic005G043400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic006G099600--Sobic006G099501 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099600--Sobic010G143400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic006G099600--Sobic005G221550 Sobic001G535300--Sobic002G128750 Sobic001G535300--Sobic007G022400 Sobic001G535300--Sobic009G063450 Sobic003G073700 Sobic003G073700 Sobic001G535300--Sobic003G073700 Sobic001G535300--Sobic006G045200 Sobic010G187201 Sobic010G187201 Sobic001G535300--Sobic010G187201 Sobic001G177500 Sobic001G177500 Sobic001G535300--Sobic001G177500 Sobic002G013500 Sobic002G013500 Sobic001G535300--Sobic002G013500 Sobic002G085700 Sobic002G085700 Sobic001G535300--Sobic002G085700 Sobic005G031800--Sobic002G128750 Sobic005G031800--Sobic004G173400 Sobic005G031800--Sobic007G022400 Sobic005G031800--Sobic001G535300 Sobic002G289350 Sobic002G289350 Sobic005G031800--Sobic002G289350 Sobic005G031800--Sobic006G045200 Sobic004G143100 Sobic004G143100 Sobic005G031800--Sobic004G143100 Sobic005G135500 Sobic005G135500 Sobic005G031800--Sobic005G135500 Sobic002G227800 Sobic002G227800 Sobic005G031800--Sobic002G227800 Sobic009G063450--Sobic001G535300 Sobic009G063450--Sobic002G128750 Sobic002G057050 Sobic002G057050 Sobic009G063450--Sobic002G057050 Sobic009G031450 Sobic009G031450 Sobic009G063450--Sobic009G031450 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic009G063450--Sobic004G290400 Sobic009G063450--Sobic002G085700 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic009G063450--Sobic001G482500 Sobic001G327400 Sobic001G327400 Sobic009G063450--Sobic001G327400 Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic009G063450--Sobic002G267300 Sobic006G045200--Sobic001G535300 Sobic006G045200--Sobic002G128750 Sobic006G045200--Sobic007G022400 Sobic004G193200 Sobic004G193200 Sobic006G045200--Sobic004G193200 Sobic001G242350 Sobic001G242350 Sobic006G045200--Sobic001G242350 Sobic001G444100 Sobic001G444100 Sobic006G045200--Sobic001G444100 Sobic006G045200--Sobic001G177500 Sobic006G045200--Sobic002G013500 Sobic005G204400 Sobic005G204400 Sobic006G045200--Sobic005G204400 Sobic007G022400--Sobic001G535300 Sobic007G022400--Sobic002G128750 Sobic007G022400--Sobic006G045200 Sobic008G038700 Sobic008G038700 Sobic007G022400--Sobic008G038700 Sobic007G022400--Sobic003G073700 Sobic007G022400--Sobic009G063450 Sobic007G022400--Sobic005G031800 Sobic005G108300 Sobic005G108300 Sobic007G022400--Sobic005G108300 Sobic006G062200 Sobic006G062200 Sobic007G022400--Sobic006G062200 Sobic002G128750--Sobic001G177500 Sobic001G370100 Sobic001G370100 Sobic002G128750--Sobic001G370100 Sobic002G128750--Sobic002G227800 Sobic002G128750--Sobic002G013500 Sobic002G128750--Sobic002G085700 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic002G128750--Sobic007G100900 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic002G128750--Sobic002G289701 Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic002G128750--Sobic006G088500 Sobic002G128750--Sobic001G535300 Sobic001G521900 Sobic001G521900 Sobic004G159600--Sobic001G521900 Sobic004G133301 Sobic004G133301 Sobic004G159600--Sobic004G133301 Sobic004G159600--Sobic002G289350 Sobic004G159600--Sobic004G290400 Sobic002G252600 Sobic002G252600 Sobic004G159600--Sobic002G252600 Sobic004G159600--Sobic001G327400 Sobic004G233900 Sobic004G233900 Sobic004G159600--Sobic004G233900 Sobic001G349800 Sobic001G349800 Sobic004G159600--Sobic001G349800 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic004G159600--Sobic002G384800 Sobic003G298500 Sobic003G298500 Sobic007G202700--Sobic003G298500 Sobic007G202700--Sobic002G013500 Sobic010G266000 Sobic010G266000 Sobic007G202700--Sobic010G266000 Sobic001G489225 Sobic001G489225 Sobic007G202700--Sobic001G489225 Sobic003G432600 Sobic003G432600 Sobic007G202700--Sobic003G432600 Sobic002G277900 Sobic002G277900 Sobic007G202700--Sobic002G277900 Sobic007G202700--Sobic001G482500 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic007G202700--Sobic008G024000 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic007G202700--Sobic010G091750
Octagon: transcription factors


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