Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G159600.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YQ35
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G521900 CHCH domain containing protein, expressed K18183: cytochrome c oxidase assembly protein subunit 19
2 Sobic.004G133301 - -
3 Sobic.002G289350 - -
4 Sobic.004G290400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
5 Sobic.002G252600 pob, putative, expressed -
6 Sobic.001G327400 - -
7 Sobic.004G233900 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G349800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Phospholipase dalpha 1(PubMedID : 26320239)@phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
9 Sobic.002G384800 pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.001G393600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G128750 - -
12 Sobic.006G062200 DNA cross-link repair 1A protein, putative, expressed K15340: DCLRE1A, SNM1A, DNA cross-link repair 1A protein
13 Sobic.001G444100 peptide transporter, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
14 Sobic.009G067200 expressed protein -
15 Sobic.009G133100 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
16 Sobic.008G097000 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed K17744: L-galactose dehydrogenase
17 Sobic.001G482500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
18 Sobic.003G154800 expressed protein -
19 Sobic.002G013500 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.005G019900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G159600 Sobic004G159600 Sobic001G521900 Sobic001G521900 Sobic004G159600--Sobic001G521900 Sobic004G133301 Sobic004G133301 Sobic004G159600--Sobic004G133301 Sobic002G289350 Sobic002G289350 Sobic004G159600--Sobic002G289350 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic004G159600--Sobic004G290400 Sobic002G252600 Sobic002G252600 Sobic004G159600--Sobic002G252600 Sobic001G327400 Sobic001G327400 Sobic004G159600--Sobic001G327400 Sobic004G233900 Sobic004G233900 Sobic004G159600--Sobic004G233900 Sobic001G349800 Sobic001G349800 Sobic004G159600--Sobic001G349800 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic004G159600--Sobic002G384800 Sobic001G521900--Sobic004G159600 Sobic001G521900--Sobic004G133301 Sobic001G521900--Sobic002G252600 Sobic006G062200 Sobic006G062200 Sobic001G521900--Sobic006G062200 Sobic001G521900--Sobic004G233900 Sobic001G521900--Sobic004G290400 Sobic001G393600 Sobic001G393600 Sobic001G521900--Sobic001G393600 Sobic005G183000 Sobic005G183000 Sobic001G521900--Sobic005G183000 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic001G521900--Sobic009G133100 Sobic004G133301--Sobic001G393600 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic004G133301--Sobic001G364200 Sobic002G156700 Sobic002G156700 Sobic004G133301--Sobic002G156700 Sobic004G133301--Sobic002G252600 Sobic005G190700 Sobic005G190700 Sobic004G133301--Sobic005G190700 Sobic001G044100 Sobic001G044100 Sobic004G133301--Sobic001G044100 Sobic005G019900 Sobic005G019900 Sobic004G133301--Sobic005G019900 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic004G133301--Sobic002G070400 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic004G133301--Sobic003G407400 Sobic002G289350--Sobic004G159600 Sobic002G289350--Sobic002G384800 Sobic008G006900 Sobic008G006900 Sobic002G289350--Sobic008G006900 Sobic003G318650 Sobic003G318650 Sobic002G289350--Sobic003G318650 Sobic001G370100 Sobic001G370100 Sobic002G289350--Sobic001G370100 Sobic002G013500 Sobic002G013500 Sobic002G289350--Sobic002G013500 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic002G289350--Sobic001G482500 Sobic002G289350--Sobic001G327400 Sobic002G128750 Sobic002G128750 Sobic002G289350--Sobic002G128750 Sobic002G044900 Sobic002G044900 Sobic004G290400--Sobic002G044900 Sobic009G067200 Sobic009G067200 Sobic004G290400--Sobic009G067200 Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic004G290400--Sobic006G088500 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic004G290400--Sobic002G401301 Sobic002G312100 Sobic002G312100 Sobic004G290400--Sobic002G312100 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic004G290400--Sobic003G326100 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic004G290400--Sobic008G053000 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic004G290400--Sobic007G007650 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic004G290400--Sobic004G274000 Sobic002G252600--Sobic004G133301 Sobic002G252600--Sobic001G393600 Sobic002G252600--Sobic001G521900 Sobic002G252600--Sobic001G370100 Sobic002G252600--Sobic004G159600 Sobic001G177500 Sobic001G177500 Sobic002G252600--Sobic001G177500 Sobic004G327100 Sobic004G327100 Sobic002G252600--Sobic004G327100 Sobic008G097000 Sobic008G097000 Sobic002G252600--Sobic008G097000 Sobic002G252600--Sobic002G156700 Sobic001G327400--Sobic004G290400 Sobic001G327400--Sobic002G384800 Sobic001G327400--Sobic001G482500 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic001G327400--Sobic002G289701 Sobic001G327400--Sobic002G013500 Sobic001G327400--Sobic008G006900 Sobic001G327400--Sobic001G177500 Sobic001G189800 Sobic001G189800 Sobic001G327400--Sobic001G189800 Sobic001G327400--Sobic001G370100 Sobic004G233900--Sobic009G133100 Sobic004G072400 Sobic004G072400 Sobic004G233900--Sobic004G072400 Sobic001G058000 Sobic001G058000 Sobic004G233900--Sobic001G058000 Sobic004G101100 Sobic004G101100 Sobic004G233900--Sobic004G101100 Sobic004G233900--Sobic001G364200 Sobic007G131300 Sobic007G131300 Sobic004G233900--Sobic007G131300 Sobic004G233900--Sobic004G133301 Sobic001G270200 Sobic001G270200 Sobic004G233900--Sobic001G270200 Sobic004G233900--Sobic001G393600 Sobic003G154800 Sobic003G154800 Sobic001G349800--Sobic003G154800 Sobic003G046200 Sobic003G046200 Sobic001G349800--Sobic003G046200 Sobic001G349800--Sobic001G393600 Sobic009G194100 Sobic009G194100 Sobic001G349800--Sobic009G194100 Sobic008G147800 Sobic008G147800 Sobic001G349800--Sobic008G147800 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic001G349800--Sobic007G100900 Sobic003G298500 Sobic003G298500 Sobic001G349800--Sobic003G298500 Sobic009G190900 Sobic009G190900 Sobic001G349800--Sobic009G190900 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic001G349800--Sobic005G030200 Sobic002G384800--Sobic001G482500 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic002G384800--Sobic005G201800 Sobic001G200400 Sobic001G200400 Sobic002G384800--Sobic001G200400 Sobic001G406600 Sobic001G406600 Sobic002G384800--Sobic001G406600 Sobic005G120433 Sobic005G120433 Sobic002G384800--Sobic005G120433 Sobic005G029866 Sobic005G029866 Sobic002G384800--Sobic005G029866 Sobic002G384800--Sobic002G289701 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic002G384800--Sobic008G045100 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic002G384800--Sobic003G190701
Octagon: transcription factors


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