Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G393600.1
Synonym Sb01g037290
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
UniProt C5WMF1
Pfam PF03140
Panther DB PTHR31549 PTHR31549:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50170 : Plant protein of unknown function (DUF247)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g19700.1 : plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a002179
Brachypodium KQK21975
Barley HORVU4Hr1G053150.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G393600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G065500 BHLH transcription factor, putative, expressed -
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6 Sobic.007G100900 - -
7 Sobic.003G407400 - -
8 Sobic.005G013700 - -
9 Sobic.003G066250 - -
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11 Sobic.010G146350 - -
12 Sobic.005G207600 - -
13 Sobic.010G228200 expressed protein -
14 Sobic.004G325150 - -
15 Sobic.007G120600 KED, putative, expressed -
16 Sobic.005G207550 - -
17 Sobic.004G052700 hypothetical protein -
18 Sobic.008G096401 - -
19 Sobic.005G183000 resistance protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G156700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G393600 Sobic001G393600 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic001G393600--Sobic010G065500 Sobic004G327100 Sobic004G327100 Sobic001G393600--Sobic004G327100 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic001G393600--Sobic002G070400 Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic001G393600--Sobic006G088500 Sobic004G082050 Sobic004G082050 Sobic001G393600--Sobic004G082050 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic001G393600--Sobic007G100900 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic001G393600--Sobic003G407400 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic001G393600--Sobic005G013700 Sobic003G066250 Sobic003G066250 Sobic001G393600--Sobic003G066250 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic010G065500--Sobic006G137900 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic010G065500--Sobic008G008601 Sobic010G065500--Sobic005G013700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic010G065500--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic010G065500--Sobic001G452300 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic010G065500--Sobic003G120050 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic010G065500--Sobic004G122700 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic010G065500--Sobic004G013400 Sobic010G065500--Sobic002G070400 Sobic004G327100--Sobic004G122700 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic004G327100--Sobic005G207550 Sobic004G327100--Sobic006G137900 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic004G327100--Sobic008G008701 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic004G327100--Sobic001G138500 Sobic004G327100--Sobic008G008601 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic004G327100--Sobic001G190600 Sobic004G327100--Sobic001G452300 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic004G327100--Sobic004G090900 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic002G070400--Sobic005G005100 Sobic002G070400--Sobic005G013700 Sobic002G070400--Sobic002G063500 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic002G070400--Sobic006G004700 Sobic002G070400--Sobic008G008601 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G070400--Sobic008G069901 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic002G070400--Sobic001G160300 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic002G070400--Sobic003G046000 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic002G070400--Sobic005G025500 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic006G088500--Sobic007G120600 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic006G088500--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic006G088500--Sobic008G096401 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic006G088500--Sobic001G060001 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic006G088500--Sobic010G267651 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic006G088500--Sobic004G181100 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic006G088500--Sobic002G188800 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic006G088500--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic006G088500--Sobic005G207600 Sobic004G082050--Sobic010G065500 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic004G082050--Sobic007G087500 Sobic004G082050--Sobic001G452300 Sobic004G082050--Sobic006G004700 Sobic004G082050--Sobic002G070400 Sobic004G082050--Sobic008G008601 Sobic004G082050--Sobic005G013700 Sobic004G082050--Sobic002G063500 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic004G082050--Sobic003G021401 Sobic007G100900--Sobic004G327100 Sobic007G100900--Sobic004G122700 Sobic007G100900--Sobic008G008701 Sobic007G100900--Sobic005G207550 Sobic007G100900--Sobic001G138500 Sobic007G100900--Sobic001G190600 Sobic007G100900--Sobic008G008601 Sobic007G100900--Sobic006G137900 Sobic007G100900--Sobic004G090900 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic003G407400--Sobic004G325150 Sobic003G407400--Sobic006G137900 Sobic003G407400--Sobic005G207550 Sobic003G407400--Sobic001G138500 Sobic003G407400--Sobic005G013700 Sobic003G407400--Sobic001G190600 Sobic003G407400--Sobic005G207600 Sobic003G407400--Sobic010G146350 Sobic003G407400--Sobic004G122700 Sobic005G013700--Sobic006G137900 Sobic005G013700--Sobic008G008601 Sobic005G013700--Sobic004G122700 Sobic005G013700--Sobic008G008701 Sobic005G013700--Sobic004G090900 Sobic005G013700--Sobic004G325150 Sobic005G013700--Sobic002G063500 Sobic005G013700--Sobic001G452300 Sobic005G013700--Sobic008G069901 Sobic003G066250--Sobic010G267651 Sobic003G066250--Sobic007G120600 Sobic003G066250--Sobic004G052700 Sobic003G066250--Sobic008G096401 Sobic003G066250--Sobic001G060001 Sobic003G066250--Sobic002G188800 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic003G066250--Sobic003G023100 Sobic006G077900 Sobic006G077900 Sobic003G066250--Sobic006G077900 Sobic003G066250--Sobic010G146350
Octagon: transcription factors


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