Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G183000.1
Synonym
Functional annotation resistance protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RJU2
Pfam PF00931
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF402
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G58807 : Disease resistance protein (CC-NBS-LRR class) family
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g14850.1 : resistance protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052054
Brachypodium KQJ85931
Barley -
Wheat TraesCS5B02G563600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G066250 - -
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14 Sobic.001G060001 - -
15 Sobic.004G181100 expressed protein -
16 Sobic.006G042800 expressed protein -
17 Sobic.003G120050 - -
18 Sobic.002G159400 expressed protein -
19 Sobic.002G063201 - -
20 Sobic.004G274000 STE_MEK_ste7_MAP2K.4 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G183000 Sobic005G183000 Sobic003G066250 Sobic003G066250 Sobic005G183000--Sobic003G066250 Sobic006G077900 Sobic006G077900 Sobic005G183000--Sobic006G077900 Sobic002G277366 Sobic002G277366 Sobic005G183000--Sobic002G277366 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic005G183000--Sobic010G267651 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic005G183000--Sobic002G188800 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic005G183000--Sobic003G023100 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic005G183000--Sobic007G120600 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic005G183000--Sobic003G021401 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic005G183000--Sobic002G401301 Sobic003G066250--Sobic010G267651 Sobic003G066250--Sobic007G120600 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic003G066250--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic003G066250--Sobic008G096401 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic003G066250--Sobic001G060001 Sobic003G066250--Sobic002G188800 Sobic003G066250--Sobic003G023100 Sobic003G066250--Sobic006G077900 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic003G066250--Sobic010G146350 Sobic006G077900--Sobic010G267651 Sobic006G077900--Sobic002G188800 Sobic006G077900--Sobic002G401301 Sobic006G077900--Sobic002G277366 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic006G077900--Sobic004G181100 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic006G077900--Sobic004G274000 Sobic006G077900--Sobic003G066250 Sobic006G077900--Sobic007G120600 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic006G077900--Sobic006G042800 Sobic002G277366--Sobic003G021401 Sobic002G277366--Sobic003G023100 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic002G277366--Sobic003G120050 Sobic003G323750 Sobic003G323750 Sobic002G277366--Sobic003G323750 Sobic002G063201 Sobic002G063201 Sobic002G277366--Sobic002G063201 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic002G277366--Sobic010G091750 Sobic002G277366--Sobic006G077900 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic002G277366--Sobic001G452300 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic002G277366--Sobic007G087500 Sobic010G267651--Sobic002G188800 Sobic010G267651--Sobic007G120600 Sobic010G267651--Sobic008G096401 Sobic010G267651--Sobic004G052700 Sobic010G267651--Sobic004G181100 Sobic010G267651--Sobic001G060001 Sobic010G267651--Sobic006G042800 Sobic010G267651--Sobic006G077900 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic010G267651--Sobic002G159400 Sobic002G188800--Sobic004G181100 Sobic002G188800--Sobic010G267651 Sobic002G188800--Sobic006G042800 Sobic002G188800--Sobic002G159400 Sobic002G188800--Sobic008G096401 Sobic002G188800--Sobic004G052700 Sobic002G188800--Sobic004G274000 Sobic002G188800--Sobic007G120600 Sobic002G188800--Sobic002G401301 Sobic003G023100--Sobic003G120050 Sobic003G023100--Sobic003G021401 Sobic004G200501 Sobic004G200501 Sobic003G023100--Sobic004G200501 Sobic003G023100--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic003G023100--Sobic005G207600 Sobic003G023100--Sobic002G277366 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic003G023100--Sobic010G228200 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic003G023100--Sobic006G137900 Sobic003G023100--Sobic007G120600 Sobic007G120600--Sobic004G052700 Sobic007G120600--Sobic008G096401 Sobic007G120600--Sobic001G060001 Sobic007G120600--Sobic010G146350 Sobic007G120600--Sobic005G207600 Sobic007G120600--Sobic010G267651 Sobic007G120600--Sobic004G181100 Sobic007G120600--Sobic010G228200 Sobic007G120600--Sobic002G188800 Sobic003G021401--Sobic003G120050 Sobic003G021401--Sobic003G023100 Sobic003G021401--Sobic002G277366 Sobic003G021401--Sobic001G452300 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic003G021401--Sobic008G008601 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic003G021401--Sobic004G013400 Sobic003G021401--Sobic006G137900 Sobic003G021401--Sobic007G087500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic003G021401--Sobic001G190600 Sobic002G401301--Sobic004G274000 Sobic002G401301--Sobic002G188800 Sobic002G401301--Sobic004G181100 Sobic002G401301--Sobic010G267651 Sobic002G401301--Sobic006G042800 Sobic002G401301--Sobic002G159400 Sobic002G401301--Sobic008G096401 Sobic002G401301--Sobic004G052700 Sobic007G035100 Sobic007G035100 Sobic002G401301--Sobic007G035100
Octagon: transcription factors


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