Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G019900.2
Synonym Sb05g001700
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RGQ5
Pfam PF12274
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g49630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK11898 , KQJ85537 , KQJ85538
Barley -
Wheat TraesCS2B02G479500 , TraesCS2A02G457000 , TraesCS4B02G336300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G407400 - -
2 Sobic.009G196100 dof zinc finger domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.005G013700 - -
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7 Sobic.005G025500 expressed protein -
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9 Sobic.001G138500 expressed protein -
10 Sobic.001G045300 ubiquitin family protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G190600 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
12 Sobic.005G207550 - -
13 Sobic.008G008701 - -
14 Sobic.002G046400 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed K18054: 2'-deoxymugineic-acid 2'-dioxygenase / mugineic-acid 3-dioxygenase
15 Sobic.007G027400 MBTB16 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
16 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
17 Sobic.004G090900 nuclear ribonuclease Z, putative, expressed K00784: ribonuclease Z
18 Sobic.005G005100 PMR5, putative, expressed -
19 Sobic.002G046500 gibberellin 20 oxidase 1-B, putative, expressed -
20 Sobic.004G327100 atATG18b, putative, expressed K17908: WIPI1_2, autophagy-related protein 18


Gene co-expression network
sample Sobic005G019900 Sobic005G019900 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic005G019900--Sobic003G407400 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic005G019900--Sobic009G196100 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic005G019900--Sobic005G013700 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic005G019900--Sobic004G325150 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic005G019900--Sobic008G045100 Sobic008G078966 Sobic008G078966 Sobic005G019900--Sobic008G078966 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic005G019900--Sobic005G025500 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic005G019900--Sobic006G137900 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic005G019900--Sobic001G138500 Sobic003G407400--Sobic004G325150 Sobic003G407400--Sobic006G137900 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic003G407400--Sobic005G207550 Sobic003G407400--Sobic001G138500 Sobic003G407400--Sobic005G013700 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic003G407400--Sobic001G190600 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic003G407400--Sobic005G207600 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic003G407400--Sobic010G146350 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic003G407400--Sobic004G122700 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic009G196100--Sobic001G060001 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic009G196100--Sobic007G120600 Sobic002G078600 Sobic002G078600 Sobic009G196100--Sobic002G078600 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic009G196100--Sobic007G007650 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic009G196100--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic009G196100--Sobic008G096401 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic009G196100--Sobic003G326100 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic009G196100--Sobic010G267651 Sobic009G196100--Sobic010G146350 Sobic005G013700--Sobic006G137900 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic005G013700--Sobic008G008601 Sobic005G013700--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic005G013700--Sobic008G008701 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic005G013700--Sobic004G090900 Sobic005G013700--Sobic004G325150 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G013700--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic005G013700--Sobic001G452300 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic005G013700--Sobic008G069901 Sobic004G325150--Sobic006G137900 Sobic004G325150--Sobic005G013700 Sobic004G325150--Sobic008G008701 Sobic004G325150--Sobic003G407400 Sobic004G325150--Sobic004G122700 Sobic004G325150--Sobic001G138500 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic004G325150--Sobic001G045300 Sobic004G325150--Sobic005G207550 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic004G325150--Sobic007G027400 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic008G045100--Sobic001G358101 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic008G045100--Sobic003G190701 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic008G045100--Sobic004G162800 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic008G045100--Sobic001G234700 Sobic008G078966--Sobic005G207550 Sobic008G078966--Sobic007G027400 Sobic008G078966--Sobic008G008701 Sobic008G078966--Sobic001G045300 Sobic008G078966--Sobic004G090900 Sobic008G078966--Sobic004G122700 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G078966--Sobic002G046500 Sobic008G078966--Sobic001G138500 Sobic005G041700 Sobic005G041700 Sobic008G078966--Sobic005G041700 Sobic005G025500--Sobic008G008601 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic005G025500--Sobic005G014600 Sobic005G025500--Sobic004G122700 Sobic005G025500--Sobic004G090900 Sobic005G025500--Sobic008G069901 Sobic005G025500--Sobic008G008701 Sobic005G025500--Sobic002G063500 Sobic005G025500--Sobic001G452300 Sobic005G025500--Sobic002G046500 Sobic006G137900--Sobic005G207550 Sobic006G137900--Sobic004G122700 Sobic006G137900--Sobic001G138500 Sobic006G137900--Sobic001G190600 Sobic006G137900--Sobic008G008701 Sobic006G137900--Sobic008G008601 Sobic006G137900--Sobic005G013700 Sobic006G137900--Sobic004G325150 Sobic006G137900--Sobic004G090900 Sobic001G138500--Sobic005G207550 Sobic001G138500--Sobic008G008701 Sobic001G138500--Sobic004G122700 Sobic001G138500--Sobic001G190600 Sobic001G138500--Sobic006G137900 Sobic001G138500--Sobic004G090900 Sobic001G138500--Sobic001G045300 Sobic001G138500--Sobic007G027400 Sobic001G138500--Sobic002G046500
Octagon: transcription factors


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