Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G252600.2,Sobic.002G252600.1
Synonym Sb02g028830
Functional annotation pob, putative, expressed
UniProt A0A1B6QDF0 , A0A1B6QDE8
Pfam PF01956
Panther DB PTHR13116
NCBI CDD KOG3188; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G12590 : Protein of unknown function DUF106, transmembrane
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g32220.1 : pob, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014257
Brachypodium KQJ90838 , KQJ90839 , KQJ90837
Barley HORVU5Hr1G074770.2 , HORVU5Hr1G074770.1
Wheat TraesCS5D02G282400 , TraesCS5D02G282400 , TraesCS5B02G274500 , TraesCS5B02G274500 , TraesCS5B02G274500 , TraesCS5A02G274800 , TraesCS5A02G274800
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cDNA sequences
Sobic.002G252600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.003G245201 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G252600 Sobic002G252600 Sobic004G133301 Sobic004G133301 Sobic002G252600--Sobic004G133301 Sobic001G393600 Sobic001G393600 Sobic002G252600--Sobic001G393600 Sobic001G521900 Sobic001G521900 Sobic002G252600--Sobic001G521900 Sobic001G370100 Sobic001G370100 Sobic002G252600--Sobic001G370100 Sobic004G159600 Sobic004G159600 Sobic002G252600--Sobic004G159600 Sobic001G177500 Sobic001G177500 Sobic002G252600--Sobic001G177500 Sobic004G327100 Sobic004G327100 Sobic002G252600--Sobic004G327100 Sobic008G097000 Sobic008G097000 Sobic002G252600--Sobic008G097000 Sobic002G156700 Sobic002G156700 Sobic002G252600--Sobic002G156700 Sobic004G133301--Sobic001G393600 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic004G133301--Sobic001G364200 Sobic004G133301--Sobic002G156700 Sobic004G133301--Sobic002G252600 Sobic005G190700 Sobic005G190700 Sobic004G133301--Sobic005G190700 Sobic001G044100 Sobic001G044100 Sobic004G133301--Sobic001G044100 Sobic005G019900 Sobic005G019900 Sobic004G133301--Sobic005G019900 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic004G133301--Sobic002G070400 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic004G133301--Sobic003G407400 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic001G393600--Sobic010G065500 Sobic001G393600--Sobic004G327100 Sobic001G393600--Sobic002G070400 Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic001G393600--Sobic006G088500 Sobic004G082050 Sobic004G082050 Sobic001G393600--Sobic004G082050 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic001G393600--Sobic007G100900 Sobic001G393600--Sobic003G407400 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic001G393600--Sobic005G013700 Sobic003G066250 Sobic003G066250 Sobic001G393600--Sobic003G066250 Sobic001G521900--Sobic004G159600 Sobic001G521900--Sobic004G133301 Sobic001G521900--Sobic002G252600 Sobic006G062200 Sobic006G062200 Sobic001G521900--Sobic006G062200 Sobic004G233900 Sobic004G233900 Sobic001G521900--Sobic004G233900 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic001G521900--Sobic004G290400 Sobic001G521900--Sobic001G393600 Sobic005G183000 Sobic005G183000 Sobic001G521900--Sobic005G183000 Sobic009G133100 Sobic009G133100 Sobic001G521900--Sobic009G133100 Sobic001G370100--Sobic001G177500 Sobic001G370100--Sobic004G327100 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic001G370100--Sobic007G027400 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic001G370100--Sobic001G045300 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic001G370100--Sobic001G358101 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic001G370100--Sobic002G046500 Sobic003G190701 Sobic003G190701 Sobic001G370100--Sobic003G190701 Sobic010G140800 Sobic010G140800 Sobic001G370100--Sobic010G140800 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic001G370100--Sobic004G162800 Sobic004G159600--Sobic001G521900 Sobic004G159600--Sobic004G133301 Sobic002G289350 Sobic002G289350 Sobic004G159600--Sobic002G289350 Sobic004G159600--Sobic004G290400 Sobic004G159600--Sobic002G252600 Sobic001G327400 Sobic001G327400 Sobic004G159600--Sobic001G327400 Sobic004G159600--Sobic004G233900 Sobic001G349800 Sobic001G349800 Sobic004G159600--Sobic001G349800 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic004G159600--Sobic002G384800 Sobic001G177500--Sobic001G370100 Sobic001G177500--Sobic010G140800 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic001G177500--Sobic006G076700 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic001G177500--Sobic009G159800 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic001G177500--Sobic001G234700 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic004G327100--Sobic004G122700 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic004G327100--Sobic005G207550 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic004G327100--Sobic006G137900 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic004G327100--Sobic008G008701 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic004G327100--Sobic001G138500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic004G327100--Sobic008G008601 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic004G327100--Sobic001G190600 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic004G327100--Sobic001G452300 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic004G327100--Sobic004G090900 Sobic002G192700 Sobic002G192700 Sobic008G097000--Sobic002G192700 Sobic003G064150 Sobic003G064150 Sobic008G097000--Sobic003G064150 Sobic002G277900 Sobic002G277900 Sobic008G097000--Sobic002G277900 Sobic005G050900 Sobic005G050900 Sobic008G097000--Sobic005G050900 Sobic002G312100 Sobic002G312100 Sobic008G097000--Sobic002G312100 Sobic003G008100 Sobic003G008100 Sobic008G097000--Sobic003G008100 Sobic008G097000--Sobic001G370100 Sobic001G158966 Sobic001G158966 Sobic008G097000--Sobic001G158966 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic008G097000--Sobic001G001000 Sobic002G156700--Sobic005G013700 Sobic002G156700--Sobic002G070400 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic002G156700--Sobic004G325150 Sobic002G156700--Sobic003G407400 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic002G156700--Sobic008G045100 Sobic002G156700--Sobic006G137900 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic002G156700--Sobic002G046400 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic002G156700--Sobic005G005100 Sobic002G156700--Sobic001G045300
Octagon: transcription factors


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