Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G133301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RM69
Pfam PF06842
Panther DB PTHR13229 PTHR13229:SF8
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G20165 : -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019773
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G393600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G364200 cytochrome P450, putative, expressed -
3 Sobic.002G156700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
4 Sobic.002G252600 pob, putative, expressed -
5 Sobic.005G190700 IQ calmodulin-binding and BAG domain containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G044100 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.005G019900 expressed protein -
8 Sobic.002G070400 - -
9 Sobic.003G407400 - -
10 Sobic.004G327100 atATG18b, putative, expressed K17908: WIPI1_2, autophagy-related protein 18
11 Sobic.009G133100 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
12 Sobic.003G161950 - -
13 Sobic.004G082050 - K02935: RP-L7, MRPL12, large subunit ribosomal protein L7/L12
14 Sobic.005G183000 resistance protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G078000 - -
16 Sobic.004G325150 - -
17 Sobic.002G046400 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed K18054: 2'-deoxymugineic-acid 2'-dioxygenase / mugineic-acid 3-dioxygenase
18 Sobic.010G065500 BHLH transcription factor, putative, expressed -
19 Sobic.005G013700 - -
20 Sobic.002G384800 pentatricopeptide, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G133301 Sobic004G133301 Sobic001G393600 Sobic001G393600 Sobic004G133301--Sobic001G393600 Sobic001G364200 Sobic001G364200 Sobic004G133301--Sobic001G364200 Sobic002G156700 Sobic002G156700 Sobic004G133301--Sobic002G156700 Sobic002G252600 Sobic002G252600 Sobic004G133301--Sobic002G252600 Sobic005G190700 Sobic005G190700 Sobic004G133301--Sobic005G190700 Sobic001G044100 Sobic001G044100 Sobic004G133301--Sobic001G044100 Sobic005G019900 Sobic005G019900 Sobic004G133301--Sobic005G019900 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic004G133301--Sobic002G070400 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic004G133301--Sobic003G407400 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic001G393600--Sobic010G065500 Sobic004G327100 Sobic004G327100 Sobic001G393600--Sobic004G327100 Sobic001G393600--Sobic002G070400 Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic001G393600--Sobic006G088500 Sobic004G082050 Sobic004G082050 Sobic001G393600--Sobic004G082050 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic001G393600--Sobic007G100900 Sobic001G393600--Sobic003G407400 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic001G393600--Sobic005G013700 Sobic003G066250 Sobic003G066250 Sobic001G393600--Sobic003G066250 Sobic001G364200--Sobic002G156700 Sobic001G364200--Sobic002G070400 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic001G364200--Sobic002G046400 Sobic005G005100 Sobic005G005100 Sobic001G364200--Sobic005G005100 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic001G364200--Sobic008G045100 Sobic001G364200--Sobic010G065500 Sobic001G364200--Sobic004G082050 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic001G364200--Sobic001G001000 Sobic002G277900 Sobic002G277900 Sobic001G364200--Sobic002G277900 Sobic002G156700--Sobic005G013700 Sobic002G156700--Sobic002G070400 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic002G156700--Sobic004G325150 Sobic002G156700--Sobic003G407400 Sobic002G156700--Sobic008G045100 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic002G156700--Sobic006G137900 Sobic002G156700--Sobic002G046400 Sobic002G156700--Sobic005G005100 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic002G156700--Sobic001G045300 Sobic002G252600--Sobic004G133301 Sobic002G252600--Sobic001G393600 Sobic001G521900 Sobic001G521900 Sobic002G252600--Sobic001G521900 Sobic001G370100 Sobic001G370100 Sobic002G252600--Sobic001G370100 Sobic004G159600 Sobic004G159600 Sobic002G252600--Sobic004G159600 Sobic001G177500 Sobic001G177500 Sobic002G252600--Sobic001G177500 Sobic002G252600--Sobic004G327100 Sobic008G097000 Sobic008G097000 Sobic002G252600--Sobic008G097000 Sobic002G252600--Sobic002G156700 Sobic005G190700--Sobic002G070400 Sobic005G190700--Sobic008G045100 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic005G190700--Sobic001G234700 Sobic008G009450 Sobic008G009450 Sobic001G044100--Sobic008G009450 Sobic010G088400 Sobic010G088400 Sobic001G044100--Sobic010G088400 Sobic001G015600 Sobic001G015600 Sobic001G044100--Sobic001G015600 Sobic001G044100--Sobic001G393600 Sobic001G044100--Sobic002G156700 Sobic005G183000 Sobic005G183000 Sobic001G044100--Sobic005G183000 Sobic001G270200 Sobic001G270200 Sobic001G044100--Sobic001G270200 Sobic007G165000 Sobic007G165000 Sobic001G044100--Sobic007G165000 Sobic001G044100--Sobic001G364200 Sobic005G019900--Sobic003G407400 Sobic009G196100 Sobic009G196100 Sobic005G019900--Sobic009G196100 Sobic005G019900--Sobic005G013700 Sobic005G019900--Sobic004G325150 Sobic005G019900--Sobic008G045100 Sobic008G078966 Sobic008G078966 Sobic005G019900--Sobic008G078966 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic005G019900--Sobic005G025500 Sobic005G019900--Sobic006G137900 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic005G019900--Sobic001G138500 Sobic002G070400--Sobic005G005100 Sobic002G070400--Sobic005G013700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic002G070400--Sobic002G063500 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic002G070400--Sobic006G004700 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic002G070400--Sobic008G008601 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G070400--Sobic008G069901 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic002G070400--Sobic001G160300 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic002G070400--Sobic003G046000 Sobic002G070400--Sobic005G025500 Sobic003G407400--Sobic004G325150 Sobic003G407400--Sobic006G137900 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic003G407400--Sobic005G207550 Sobic003G407400--Sobic001G138500 Sobic003G407400--Sobic005G013700 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic003G407400--Sobic001G190600 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic003G407400--Sobic005G207600 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic003G407400--Sobic010G146350 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic003G407400--Sobic004G122700
Octagon: transcription factors


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