Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G063450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R1X5
Pfam PF07714
Panther DB PTHR27005 PTHR27005:SF8
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G53840 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g39220.1 : OsWAK75 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G535300 - -
2 Sobic.002G128750 - -
3 Sobic.002G057050 - -
4 Sobic.009G031450 - -
5 Sobic.004G290400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
6 Sobic.002G085700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G482500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
8 Sobic.001G327400 - -
9 Sobic.002G267300 expressed protein -
10 Sobic.002G384800 pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.002G289701 - -
12 Sobic.007G193500 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@"GW8/OsPL16(Ortholog in rice:Wang et al., 2012)"(PubMedID : 31659910)@OsSPL16 - SBP-box gene family member, expressed -
13 Sobic.005G085800 expressed protein -
14 Sobic.002G013500 pentatricopeptide, putative, expressed -
15 Sobic.008G053000 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.001G177500 - -
17 Sobic.004G130001 - K08775: BRCA2, breast cancer 2 susceptibility protein
18 Sobic.006G062200 DNA cross-link repair 1A protein, putative, expressed K15340: DCLRE1A, SNM1A, DNA cross-link repair 1A protein
19 Sobic.005G205000 F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
20 Sobic.001G242350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G063450 Sobic009G063450 Sobic001G535300 Sobic001G535300 Sobic009G063450--Sobic001G535300 Sobic002G128750 Sobic002G128750 Sobic009G063450--Sobic002G128750 Sobic002G057050 Sobic002G057050 Sobic009G063450--Sobic002G057050 Sobic009G031450 Sobic009G031450 Sobic009G063450--Sobic009G031450 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic009G063450--Sobic004G290400 Sobic002G085700 Sobic002G085700 Sobic009G063450--Sobic002G085700 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic009G063450--Sobic001G482500 Sobic001G327400 Sobic001G327400 Sobic009G063450--Sobic001G327400 Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic009G063450--Sobic002G267300 Sobic001G535300--Sobic002G128750 Sobic007G022400 Sobic007G022400 Sobic001G535300--Sobic007G022400 Sobic001G535300--Sobic009G063450 Sobic003G073700 Sobic003G073700 Sobic001G535300--Sobic003G073700 Sobic006G045200 Sobic006G045200 Sobic001G535300--Sobic006G045200 Sobic010G187201 Sobic010G187201 Sobic001G535300--Sobic010G187201 Sobic001G177500 Sobic001G177500 Sobic001G535300--Sobic001G177500 Sobic002G013500 Sobic002G013500 Sobic001G535300--Sobic002G013500 Sobic001G535300--Sobic002G085700 Sobic002G128750--Sobic001G177500 Sobic001G370100 Sobic001G370100 Sobic002G128750--Sobic001G370100 Sobic002G227800 Sobic002G227800 Sobic002G128750--Sobic002G227800 Sobic002G128750--Sobic002G013500 Sobic002G128750--Sobic002G085700 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic002G128750--Sobic007G100900 Sobic002G289701 Sobic002G289701 Sobic002G128750--Sobic002G289701 Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic002G128750--Sobic006G088500 Sobic002G128750--Sobic001G535300 Sobic001G106300 Sobic001G106300 Sobic002G057050--Sobic001G106300 Sobic002G057050--Sobic009G063450 Sobic001G443300 Sobic001G443300 Sobic002G057050--Sobic001G443300 Sobic002G057050--Sobic004G290400 Sobic008G038700 Sobic008G038700 Sobic002G057050--Sobic008G038700 Sobic002G057050--Sobic002G267300 Sobic002G057050--Sobic009G031450 Sobic010G042700 Sobic010G042700 Sobic002G057050--Sobic010G042700 Sobic001G162900 Sobic001G162900 Sobic002G057050--Sobic001G162900 Sobic009G031450--Sobic009G063450 Sobic009G031450--Sobic002G085700 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic009G031450--Sobic002G384800 Sobic009G031450--Sobic001G482500 Sobic002G319700 Sobic002G319700 Sobic009G031450--Sobic002G319700 Sobic003G154800 Sobic003G154800 Sobic009G031450--Sobic003G154800 Sobic009G031450--Sobic004G290400 Sobic004G159600 Sobic004G159600 Sobic009G031450--Sobic004G159600 Sobic009G031450--Sobic002G013500 Sobic002G044900 Sobic002G044900 Sobic004G290400--Sobic002G044900 Sobic009G067200 Sobic009G067200 Sobic004G290400--Sobic009G067200 Sobic004G290400--Sobic006G088500 Sobic002G401301 Sobic002G401301 Sobic004G290400--Sobic002G401301 Sobic002G312100 Sobic002G312100 Sobic004G290400--Sobic002G312100 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic004G290400--Sobic003G326100 Sobic008G053000 Sobic008G053000 Sobic004G290400--Sobic008G053000 Sobic007G007650 Sobic007G007650 Sobic004G290400--Sobic007G007650 Sobic004G274000 Sobic004G274000 Sobic004G290400--Sobic004G274000 Sobic002G085700--Sobic001G177500 Sobic010G140800 Sobic010G140800 Sobic002G085700--Sobic010G140800 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic002G085700--Sobic006G258200 Sobic009G159800 Sobic009G159800 Sobic002G085700--Sobic009G159800 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic002G085700--Sobic010G081500 Sobic002G085700--Sobic007G100900 Sobic002G191300 Sobic002G191300 Sobic002G085700--Sobic002G191300 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic002G085700--Sobic006G076700 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic002G085700--Sobic002G289601 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic001G482500--Sobic004G173800 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic001G482500--Sobic001G152240 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic001G482500--Sobic008G053700 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic001G482500--Sobic006G004700 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic001G482500--Sobic002G103400 Sobic001G482500--Sobic006G076700 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic001G482500--Sobic003G046000 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic001G482500--Sobic004G184900 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic001G482500--Sobic005G144101 Sobic001G327400--Sobic004G290400 Sobic001G327400--Sobic002G384800 Sobic001G327400--Sobic001G482500 Sobic001G327400--Sobic002G289701 Sobic001G327400--Sobic002G013500 Sobic008G006900 Sobic008G006900 Sobic001G327400--Sobic008G006900 Sobic001G327400--Sobic001G177500 Sobic001G189800 Sobic001G189800 Sobic001G327400--Sobic001G189800 Sobic001G327400--Sobic001G370100 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic002G267300--Sobic001G022000 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic002G267300--Sobic008G024000 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic002G267300--Sobic005G205000 Sobic002G267300--Sobic001G482500 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic002G267300--Sobic007G090418 Sobic002G267300--Sobic002G384800 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic002G267300--Sobic007G193900 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic002G267300--Sobic007G193500 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic002G267300--Sobic002G067050
Octagon: transcription factors


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