Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G267300.1
Synonym Sb02g030130
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X608
Pfam -
Panther DB PTHR34380 PTHR34380:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G53220 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g12180.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022881
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G022000 hydrolase, putative, expressed K14664: IAA-amino acid hydrolase
2 Sobic.008G024000 expressed protein -
3 Sobic.005G205000 F-box/LRR-repeat protein 3, putative, expressed K10268: F-box and leucine-rich repeat protein 2/20
4 Sobic.001G482500 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase, family 1, putative, expressed -
5 Sobic.007G090418 - -
6 Sobic.002G384800 pentatricopeptide, putative, expressed -
7 Sobic.007G193900 expressed protein -
8 Sobic.007G193500 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@"GW8/OsPL16(Ortholog in rice:Wang et al., 2012)"(PubMedID : 31659910)@OsSPL16 - SBP-box gene family member, expressed -
9 Sobic.002G067050 - -
10 Sobic.008G053000 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G237600 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
12 Sobic.009G258200 - -
13 Sobic.003G339400 RING-H2 finger protein ATL5G, putative, expressed -
14 Sobic.002G085700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G289701 - -
16 Sobic.001G152500 OsFBX387 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G201800 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G216100 cysteine proteinase inhibitor precursor, putative, expressed -
19 Sobic.009G142600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine-rich receptor-like protein kinase 6 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.003G326100 nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic001G022000 Sobic001G022000 Sobic002G267300--Sobic001G022000 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic002G267300--Sobic008G024000 Sobic005G205000 Sobic005G205000 Sobic002G267300--Sobic005G205000 Sobic001G482500 Sobic001G482500 Sobic002G267300--Sobic001G482500 Sobic007G090418 Sobic007G090418 Sobic002G267300--Sobic007G090418 Sobic002G384800 Sobic002G384800 Sobic002G267300--Sobic002G384800 Sobic007G193900 Sobic007G193900 Sobic002G267300--Sobic007G193900 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic002G267300--Sobic007G193500 Sobic002G067050 Sobic002G067050 Sobic002G267300--Sobic002G067050 Sobic003G391700 Sobic003G391700 Sobic001G022000--Sobic003G391700 Sobic001G022000--Sobic008G024000 Sobic001G022000--Sobic007G090418 Sobic002G237600 Sobic002G237600 Sobic001G022000--Sobic002G237600 Sobic006G163066 Sobic006G163066 Sobic001G022000--Sobic006G163066 Sobic003G326100 Sobic003G326100 Sobic001G022000--Sobic003G326100 Sobic008G078966 Sobic008G078966 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Sobic002G067050--Sobic007G027400 Sobic002G067050--Sobic003G210701 Sobic002G067050--Sobic004G090900
Octagon: transcription factors


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