Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G237600.1
Synonym Sb02g027540, FAR1
Functional annotation male sterility protein, putative, expressed
UniProt C5X353
Pfam PF03015 PF07993
Panther DB PTHR11011 PTHR11011:SF25
NCBI CDD KOG1221; Acyl-CoA reductase
KEGG Orthology K13356; alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22500 : fatty acid reductase 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20200.1 : male sterility protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G087500 hypothetical protein -
2 Sobic.003G021401 - -
3 Sobic.001G452300 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.008G008601 - -
5 Sobic.010G091750 - -
6 Sobic.004G184900 pentatricopeptide repeat domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.004G013400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
8 Sobic.006G004700 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed K15919: glyoxylate/hydroxypyruvate reductase
9 Sobic.008G053700 - -
10 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
11 Sobic.008G069901 - -
12 Sobic.003G120050 - -
13 Sobic.002G103400 - -
14 Sobic.010G273200 3-ketoacyl-CoA synthase, putative, expressed K15397: 3-ketoacyl-CoA synthase
15 Sobic.001G152240 - -
16 Sobic.003G046000 - -
17 Sobic.004G122700 UDP-glucoronosyl/UDP-glucosyl transferase, putative, expressed -
18 Sobic.005G025500 expressed protein -
19 Sobic.005G014600 OsMan09 - Endo-Beta-Mannanase, expressed K19355: mannan endo-1,4-beta-mannosidase
20 Sobic.005G144101 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G237600 Sobic002G237600 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic002G237600--Sobic007G087500 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic002G237600--Sobic003G021401 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic002G237600--Sobic001G452300 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic002G237600--Sobic008G008601 Sobic010G091750 Sobic010G091750 Sobic002G237600--Sobic010G091750 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G237600--Sobic004G184900 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic002G237600--Sobic004G013400 Sobic006G004700 Sobic006G004700 Sobic002G237600--Sobic006G004700 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic002G237600--Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic006G004700 Sobic007G087500--Sobic008G053700 Sobic007G087500--Sobic001G452300 Sobic007G087500--Sobic008G008601 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic007G087500--Sobic002G063500 Sobic007G087500--Sobic004G184900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic007G087500--Sobic008G069901 Sobic007G087500--Sobic010G091750 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic007G087500--Sobic003G046000 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic003G021401--Sobic003G120050 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic003G021401--Sobic003G023100 Sobic002G277366 Sobic002G277366 Sobic003G021401--Sobic002G277366 Sobic003G021401--Sobic001G452300 Sobic003G021401--Sobic008G008601 Sobic003G021401--Sobic004G013400 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic003G021401--Sobic006G137900 Sobic003G021401--Sobic007G087500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic003G021401--Sobic001G190600 Sobic001G452300--Sobic008G008601 Sobic001G452300--Sobic007G087500 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic001G452300--Sobic004G122700 Sobic001G452300--Sobic008G069901 Sobic001G452300--Sobic002G063500 Sobic001G452300--Sobic004G184900 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic001G452300--Sobic008G008701 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic001G452300--Sobic004G090900 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic001G452300--Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic004G184900 Sobic002G103400 Sobic002G103400 Sobic010G091750--Sobic002G103400 Sobic010G273200 Sobic010G273200 Sobic010G091750--Sobic010G273200 Sobic010G091750--Sobic007G087500 Sobic005G144101 Sobic005G144101 Sobic010G091750--Sobic005G144101 Sobic001G152240 Sobic001G152240 Sobic010G091750--Sobic001G152240 Sobic010G091750--Sobic006G004700 Sobic010G091750--Sobic008G053700 Sobic004G173800 Sobic004G173800 Sobic010G091750--Sobic004G173800 Sobic010G091750--Sobic001G452300 Sobic004G184900--Sobic008G069901 Sobic004G184900--Sobic003G046000 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic004G184900--Sobic009G113300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic004G184900--Sobic010G081500 Sobic002G289601 Sobic002G289601 Sobic004G184900--Sobic002G289601 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic004G184900--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic004G184900--Sobic001G160300 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic004G184900--Sobic006G076700 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic004G184900--Sobic005G014600 Sobic004G013400--Sobic001G190600 Sobic004G013400--Sobic008G008601 Sobic004G013400--Sobic004G122700 Sobic004G013400--Sobic006G137900 Sobic004G013400--Sobic001G452300 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic004G013400--Sobic001G138500 Sobic004G013400--Sobic008G008701 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic004G013400--Sobic005G207550 Sobic004G013400--Sobic003G120050 Sobic006G004700--Sobic008G053700 Sobic006G004700--Sobic003G046000 Sobic006G004700--Sobic007G087500 Sobic006G004700--Sobic002G063500 Sobic006G004700--Sobic008G069901 Sobic006G004700--Sobic004G184900 Sobic006G004700--Sobic004G173800 Sobic006G004700--Sobic001G160300 Sobic006G004700--Sobic006G076700 Sobic008G053700--Sobic006G004700 Sobic008G053700--Sobic003G046000 Sobic008G053700--Sobic008G069901 Sobic008G053700--Sobic004G184900 Sobic008G053700--Sobic006G076700 Sobic008G053700--Sobic007G087500 Sobic008G053700--Sobic002G063500 Sobic008G053700--Sobic001G160300 Sobic008G053700--Sobic004G173800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.