Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G130001.2,Sobic.004G130001.1,Sobic.004G130001.3
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C6JSM3 , A0A120GUR3 , C6JSR4 , A0A1Z5RMC6 , A0A120GUR1 , C6JRX1 , C6JSM4 , C6JSU0 , A0A109NDP4 , A0A1Z5RM84 , A0A109NDI8 , A0A1Z5RN65
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology K08775; BRCA2, breast cancer 2 susceptibility protein
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g07110.1 : BRCA2 repeat family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055537
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G188200 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G003300 ABC-2 type transporter, putative, expressed -
3 Sobic.010G196200 OsSub51 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
4 Sobic.008G045300 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
5 Sobic.004G328800 transferase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.002G237600 male sterility protein, putative, expressed K13356: alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase
7 Sobic.008G175933 - -
8 Sobic.002G289701 - -
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11 Sobic.008G045232 - -
12 Sobic.005G030200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
13 Sobic.009G142600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cysteine-rich receptor-like protein kinase 6 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.002G191300 expressed protein -
15 Sobic.005G201800 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G173900 - -
17 Sobic.009G174833 - -
18 Sobic.005G025500 expressed protein -
19 Sobic.002G345100 expressed protein -
20 Sobic.004G200501 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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