Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G188200.1
Synonym Sb02g023600
Functional annotation RING-H2 finger protein, putative, expressed
UniProt C5XBE7
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF142
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G40250 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g20980.1 : RING-H2 finger protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013835 , Zm00025a046820
Brachypodium KQJ90087 , KQJ99700
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G328800 transferase family protein, putative, expressed -
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20 Sobic.001G033701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G188200 Sobic002G188200 Sobic004G328800 Sobic004G328800 Sobic002G188200--Sobic004G328800 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic002G188200--Sobic008G175933 Sobic001G003300 Sobic001G003300 Sobic002G188200--Sobic001G003300 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic002G188200--Sobic010G196200 Sobic006G044466 Sobic006G044466 Sobic002G188200--Sobic006G044466 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic002G188200--Sobic008G045300 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic002G188200--Sobic009G142600 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic002G188200--Sobic005G025500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic002G188200--Sobic008G008601 Sobic004G328800--Sobic002G188200 Sobic004G328800--Sobic008G175933 Sobic004G328800--Sobic001G003300 Sobic004G328800--Sobic005G025500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic004G328800--Sobic001G190600 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic004G328800--Sobic004G013400 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic004G328800--Sobic004G122700 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic004G328800--Sobic005G207550 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic004G328800--Sobic001G138500 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic008G175933--Sobic004G090900 Sobic008G175933--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic008G175933--Sobic008G008701 Sobic001G033701 Sobic001G033701 Sobic008G175933--Sobic001G033701 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic008G175933--Sobic002G046500 Sobic001G045300 Sobic001G045300 Sobic008G175933--Sobic001G045300 Sobic007G027400 Sobic007G027400 Sobic008G175933--Sobic007G027400 Sobic008G175933--Sobic009G142600 Sobic002G084100 Sobic002G084100 Sobic008G175933--Sobic002G084100 Sobic001G003300--Sobic002G188200 Sobic001G003300--Sobic004G328800 Sobic001G003300--Sobic008G175933 Sobic001G003300--Sobic006G044466 Sobic001G003300--Sobic010G196200 Sobic001G003300--Sobic001G190600 Sobic001G003300--Sobic005G025500 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic001G003300--Sobic005G207600 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic001G003300--Sobic010G146350 Sobic010G196200--Sobic002G188200 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic010G196200--Sobic003G250340 Sobic010G196200--Sobic008G045300 Sobic010G196200--Sobic004G328800 Sobic010G196200--Sobic006G044466 Sobic004G325832 Sobic004G325832 Sobic010G196200--Sobic004G325832 Sobic010G196200--Sobic001G003300 Sobic010G196200--Sobic008G175933 Sobic002G152000 Sobic002G152000 Sobic010G196200--Sobic002G152000 Sobic006G044466--Sobic002G188200 Sobic006G044466--Sobic004G325832 Sobic006G044466--Sobic010G196200 Sobic006G044466--Sobic001G003300 Sobic006G044466--Sobic008G175933 Sobic006G044466--Sobic004G328800 Sobic008G005700 Sobic008G005700 Sobic006G044466--Sobic008G005700 Sobic006G044466--Sobic002G152000 Sobic006G044466--Sobic008G045300 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic008G045300--Sobic003G333150 Sobic008G045300--Sobic002G188200 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic008G045300--Sobic004G293600 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic008G045300--Sobic009G203600 Sobic008G045300--Sobic010G196200 Sobic008G045300--Sobic004G328800 Sobic008G045300--Sobic008G175933 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic008G045300--Sobic002G345100 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic008G045300--Sobic006G144900 Sobic008G045900 Sobic008G045900 Sobic009G142600--Sobic008G045900 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic009G142600--Sobic008G053700 Sobic006G258200 Sobic006G258200 Sobic009G142600--Sobic006G258200 Sobic001G160300 Sobic001G160300 Sobic009G142600--Sobic001G160300 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic009G142600--Sobic008G069901 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic009G142600--Sobic003G046000 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic009G142600--Sobic009G113300 Sobic010G081500 Sobic010G081500 Sobic009G142600--Sobic010G081500 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic009G142600--Sobic004G184900 Sobic005G025500--Sobic008G008601 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic005G025500--Sobic005G014600 Sobic005G025500--Sobic004G122700 Sobic005G025500--Sobic004G090900 Sobic005G025500--Sobic008G069901 Sobic005G025500--Sobic008G008701 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G025500--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic005G025500--Sobic001G452300 Sobic005G025500--Sobic002G046500 Sobic008G008601--Sobic001G452300 Sobic008G008601--Sobic004G122700 Sobic008G008601--Sobic008G008701 Sobic008G008601--Sobic002G063500 Sobic008G008601--Sobic004G090900 Sobic008G008601--Sobic008G069901 Sobic007G087500 Sobic007G087500 Sobic008G008601--Sobic007G087500 Sobic008G008601--Sobic001G033701 Sobic008G008601--Sobic004G184900
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