Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G168700.2
Synonym Sb01g014750
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S641
Pfam PF04484
Panther DB PTHR31807 PTHR31807:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G30710 : Family of unknown function (DUF566)
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g11440.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007415
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G057050 - -
2 Sobic.009G063450 - -
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16 Sobic.002G128750 - -
17 Sobic.007G208400 pentatricopeptide, putative, expressed -
18 Sobic.001G152500 OsFBX387 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G106300 fanconi anemia L, putative, expressed K10606: FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL
20 Sobic.002G267300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G168700 Sobic001G168700 Sobic002G057050 Sobic002G057050 Sobic001G168700--Sobic002G057050 Sobic009G063450 Sobic009G063450 Sobic001G168700--Sobic009G063450 Sobic004G290400 Sobic004G290400 Sobic001G168700--Sobic004G290400 Sobic004G173400 Sobic004G173400 Sobic001G168700--Sobic004G173400 Sobic004G159600 Sobic004G159600 Sobic001G168700--Sobic004G159600 Sobic007G193500 Sobic007G193500 Sobic001G168700--Sobic007G193500 Sobic001G327400 Sobic001G327400 Sobic001G168700--Sobic001G327400 Sobic010G135800 Sobic010G135800 Sobic001G168700--Sobic010G135800 Sobic003G342800 Sobic003G342800 Sobic001G168700--Sobic003G342800 Sobic001G106300 Sobic001G106300 Sobic002G057050--Sobic001G106300 Sobic002G057050--Sobic009G063450 Sobic001G443300 Sobic001G443300 Sobic002G057050--Sobic001G443300 Sobic002G057050--Sobic004G290400 Sobic008G038700 Sobic008G038700 Sobic002G057050--Sobic008G038700 Sobic002G267300 Sobic002G267300 Sobic002G057050--Sobic002G267300 Sobic009G031450 Sobic009G031450 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Octagon: transcription factors


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