Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G160100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YJH8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G115000 - -
2 Sobic.008G108900 GRF zinc finger family protein, expressed -
3 Sobic.008G049000 diacylglycerol O-acyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.006G132200 CHIT3 - Chitinase family protein precursor, expressed K01183: chitinase
5 Sobic.002G047100 - -
6 Sobic.005G212600 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G031750 - -
8 Sobic.008G091900 - -
9 Sobic.002G221200 zinc knuckle domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G219000 integral membrane protein TmpA, putative, expressed -
11 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.003G208700 OsWAK90 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
13 Sobic.007G066050 - -
14 Sobic.002G062300 expressed protein -
15 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
16 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.006G268700 expressed protein -
18 Sobic.010G028950 - -
19 Sobic.005G043400 XRN 5-3 exonuclease N-terminus family protein, expressed -
20 Sobic.002G144025 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic007G115000 Sobic007G115000 Sobic010G160100--Sobic007G115000 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic010G160100--Sobic008G108900 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic010G160100--Sobic008G049000 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic010G160100--Sobic006G132200 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic010G160100--Sobic002G047100 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic010G160100--Sobic005G212600 Sobic003G031750 Sobic003G031750 Sobic010G160100--Sobic003G031750 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic010G160100--Sobic008G091900 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G160100--Sobic002G221200 Sobic007G115000--Sobic005G212600 Sobic002G285200 Sobic002G285200 Sobic007G115000--Sobic002G285200 Sobic001G253100 Sobic001G253100 Sobic007G115000--Sobic001G253100 Sobic007G115000--Sobic008G091900 Sobic007G115000--Sobic006G132200 Sobic002G062300 Sobic002G062300 Sobic007G115000--Sobic002G062300 Sobic004G164650 Sobic004G164650 Sobic007G115000--Sobic004G164650 Sobic008G036500 Sobic008G036500 Sobic007G115000--Sobic008G036500 Sobic005G117801 Sobic005G117801 Sobic007G115000--Sobic005G117801 Sobic008G108900--Sobic006G132200 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic008G108900--Sobic009G196700 Sobic008G108900--Sobic002G062300 Sobic009G113600 Sobic009G113600 Sobic008G108900--Sobic009G113600 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic008G108900--Sobic007G059300 Sobic008G108900--Sobic005G212600 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic008G108900--Sobic003G176100 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic008G108900--Sobic002G051400 Sobic008G108900--Sobic003G031750 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic008G049000--Sobic003G219000 Sobic008G049000--Sobic006G132200 Sobic008G049000--Sobic008G108900 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic008G049000--Sobic001G164200 Sobic008G049000--Sobic002G047100 Sobic008G049000--Sobic009G196700 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic008G049000--Sobic008G013900 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic008G049000--Sobic002G094500 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic008G049000--Sobic007G066050 Sobic006G132200--Sobic008G108900 Sobic006G132200--Sobic009G196700 Sobic006G132200--Sobic002G062300 Sobic006G132200--Sobic009G113600 Sobic006G132200--Sobic005G212600 Sobic006G132200--Sobic007G059300 Sobic006G132200--Sobic003G031750 Sobic006G132200--Sobic008G091900 Sobic008G031350 Sobic008G031350 Sobic006G132200--Sobic008G031350 Sobic002G047100--Sobic008G049000 Sobic001G132500 Sobic001G132500 Sobic002G047100--Sobic001G132500 Sobic002G047100--Sobic006G132200 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic002G047100--Sobic003G038000 Sobic002G047100--Sobic007G066050 Sobic002G047100--Sobic003G219000 Sobic002G318900 Sobic002G318900 Sobic002G047100--Sobic002G318900 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic002G047100--Sobic008G167100 Sobic002G047100--Sobic008G091900 Sobic005G212600--Sobic002G062300 Sobic005G212600--Sobic001G253100 Sobic005G212600--Sobic009G113600 Sobic005G212600--Sobic006G132200 Sobic005G212600--Sobic008G108900 Sobic005G212600--Sobic008G091900 Sobic005G212600--Sobic002G221200 Sobic008G009500 Sobic008G009500 Sobic005G212600--Sobic008G009500 SobicK024000 SobicK024000 Sobic005G212600--SobicK024000 Sobic003G031750--Sobic002G062300 Sobic003G031750--Sobic007G059300 Sobic003G031750--Sobic008G091900 Sobic003G031750--Sobic009G113600 Sobic003G031750--SobicK024000 Sobic003G031750--Sobic002G221200 Sobic003G031750--Sobic009G196700 Sobic003G031750--Sobic001G253100 Sobic008G079100 Sobic008G079100 Sobic003G031750--Sobic008G079100 Sobic008G091900--Sobic005G117801 Sobic008G091900--Sobic002G221200 Sobic008G091900--Sobic001G253100 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic001G305400 Sobic008G091900--Sobic003G031750 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic001G240400 Sobic008G091900--Sobic002G062300 Sobic005G110430 Sobic005G110430 Sobic008G091900--Sobic005G110430 Sobic008G091900--Sobic005G212600 Sobic002G221200--Sobic001G305400 Sobic002G221200--Sobic008G091900 Sobic002G221200--Sobic001G240400 Sobic002G221200--Sobic005G117801 Sobic002G221200--Sobic001G253100 Sobic009G209800 Sobic009G209800 Sobic002G221200--Sobic009G209800 Sobic002G221200--Sobic008G036500 Sobic002G221200--Sobic002G062300 Sobic002G221200--Sobic003G031750
Octagon: transcription factors


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