Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G268700.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PNV5
Pfam PF13968 PF04578
Panther DB PTHR31325:SF33 PTHR31325
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45470 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g42340.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G144025 - -
2 Sobic.010G160100 - -
3 Sobic.004G164650 - -
4 Sobic.004G043400 DNA binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.002G002900 - -
6 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
7 Sobic.007G115000 - -
8 Sobic.004G195700 heavy metal associated domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G221700 - -
10 Sobic.003G208700 OsWAK90 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
11 Sobic.007G151200 Cupin domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G166301 - -
13 Sobic.002G065600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@terpene synthase, putative, expressed -
14 Sobic.003G328800 tubulin/FtsZ domain containing protein, putative, expressed K07375: tubulin beta
15 Sobic.004G197100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
16 Sobic.001G181900 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.002G065500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@terpene synthase, putative, expressed -
18 Sobic.001G247800 - -
19 Sobic.010G048350 - -
20 Sobic.005G222700 OsWAK104 - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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