Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G048350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VRH7
Pfam PF13966
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02650 : Ribonuclease H-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g15410.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G106800 cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.004G197100 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@- -
3 Sobic.007G005000 expressed protein -
4 Sobic.005G043800 transporter family protein, putative, expressed -
5 Sobic.004G166301 - -
6 Sobic.002G144025 - -
7 Sobic.002G065700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
8 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.007G104300 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
10 Sobic.001G181900 MBTB51 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
11 Sobic.009G159500 PSF1 - Putative GINS complex subunit, expressed -
12 Sobic.002G065600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@terpene synthase, putative, expressed -
13 Sobic.006G268700 expressed protein -
14 Sobic.001G271000 - -
15 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -
16 Sobic.010G160100 - -
17 Sobic.010G230900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
18 Sobic.010G231000 Protein O-methyltransferase ZRP4 (Zm)(PubMedID : 27208977)@O-methyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.008G106400 - -
20 Sobic.003G035801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G048350 Sobic010G048350 Sobic010G106800 Sobic010G106800 Sobic010G048350--Sobic010G106800 Sobic004G197100 Sobic004G197100 Sobic010G048350--Sobic004G197100 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic010G048350--Sobic007G005000 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic010G048350--Sobic005G043800 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic010G048350--Sobic004G166301 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic010G048350--Sobic002G144025 Sobic002G065700 Sobic002G065700 Sobic010G048350--Sobic002G065700 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic010G048350--Sobic008G045600 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic010G048350--Sobic007G104300 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic010G106800--Sobic005G043400 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic010G106800--Sobic009G101600 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic010G106800--Sobic010G068200 Sobic001G271000 Sobic001G271000 Sobic010G106800--Sobic001G271000 Sobic010G106800--Sobic005G043800 Sobic005G148400 Sobic005G148400 Sobic010G106800--Sobic005G148400 Sobic010G106800--Sobic008G045600 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic010G106800--Sobic005G210300 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic010G106800--Sobic004G196500 Sobic002G065500 Sobic002G065500 Sobic004G197100--Sobic002G065500 Sobic002G065600 Sobic002G065600 Sobic004G197100--Sobic002G065600 Sobic002G065800 Sobic002G065800 Sobic004G197100--Sobic002G065800 Sobic008G182400 Sobic008G182400 Sobic004G197100--Sobic008G182400 Sobic004G197100--Sobic002G065700 Sobic005G126100 Sobic005G126100 Sobic004G197100--Sobic005G126100 Sobic010G231000 Sobic010G231000 Sobic004G197100--Sobic010G231000 Sobic001G099400 Sobic001G099400 Sobic004G197100--Sobic001G099400 Sobic010G172800 Sobic010G172800 Sobic004G197100--Sobic010G172800 Sobic007G005000--Sobic008G045600 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic007G005000--Sobic009G159500 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic007G005000--Sobic003G429500 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic007G005000--Sobic008G106400 Sobic007G005000--Sobic005G043800 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic007G005000--Sobic001G261480 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic007G005000--Sobic001G184500 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic007G005000--Sobic010G101700 Sobic003G161700 Sobic003G161700 Sobic007G005000--Sobic003G161700 Sobic004G121000 Sobic004G121000 Sobic005G043800--Sobic004G121000 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic005G043800--Sobic010G164350 Sobic005G043800--Sobic001G261480 Sobic005G043800--Sobic008G045600 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic005G043800--Sobic001G305400 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic005G043800--Sobic002G221200 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic005G043800--Sobic005G142200 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic005G043800--Sobic010G144000 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic005G043800--Sobic003G366850 Sobic006G235650 Sobic006G235650 Sobic004G166301--Sobic006G235650 Sobic010G100432 Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic010G100432 Sobic004G166301--Sobic007G104300 Sobic006G033380 Sobic006G033380 Sobic004G166301--Sobic006G033380 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic004G166301--Sobic008G167100 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic004G166301--Sobic002G023400 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic004G166301--Sobic002G128400 Sobic004G166301--Sobic005G148400 Sobic004G166301--Sobic002G144025 Sobic002G144025--Sobic008G167100 Sobic002G144025--Sobic007G104300 Sobic002G144025--Sobic002G023400 Sobic006G268700 Sobic006G268700 Sobic002G144025--Sobic006G268700 Sobic001G181900 Sobic001G181900 Sobic002G144025--Sobic001G181900 Sobic010G160100 Sobic010G160100 Sobic002G144025--Sobic010G160100 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic002G144025--Sobic008G049000 Sobic002G144025--Sobic004G166301 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic002G144025--Sobic002G047100 Sobic002G065700--Sobic010G231000 Sobic002G065700--Sobic002G065600 Sobic002G065700--Sobic002G065500 Sobic010G230800 Sobic010G230800 Sobic002G065700--Sobic010G230800 Sobic002G065700--Sobic004G197100 Sobic006G117400 Sobic006G117400 Sobic002G065700--Sobic006G117400 Sobic002G065700--Sobic008G182400 Sobic010G230900 Sobic010G230900 Sobic002G065700--Sobic010G230900 Sobic002G065700--Sobic005G126100 Sobic008G045600--Sobic007G005000 Sobic008G045600--Sobic005G142200 Sobic005G061100 Sobic005G061100 Sobic008G045600--Sobic005G061100 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic003G436900 Sobic008G045600--Sobic004G121000 Sobic008G045600--Sobic010G144000 Sobic004G317600 Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic004G317600 Sobic008G045600--Sobic009G101600 Sobic008G045600--Sobic001G305400 Sobic007G104300--Sobic004G166301 Sobic007G104300--Sobic008G167100 Sobic007G104300--Sobic002G144025 Sobic007G104300--Sobic001G181900 Sobic007G104300--Sobic002G023400 Sobic007G104300--Sobic005G148400 Sobic007G104300--Sobic008G049000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic007G104300--Sobic008G013900 Sobic007G104300--Sobic002G128400
Octagon: transcription factors


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