Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G101850.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RHY2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G166000 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
2 Sobic.001G310166 - -
3 Sobic.005G218100 Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative, expressed -
4 Sobic.004G161650 - -
5 Sobic.005G203600 - -
6 Sobic.002G099401 - -
7 Sobic.005G112900 arginyl-tRNA synthetase, putative, expressed -
8 Sobic.002G023400 expressed protein -
9 Sobic.004G298400 WRKY36, expressed -
10 Sobic.010G221700 - -
11 Sobic.010G256300 acanthoscurrin-1 precursor, putative, expressed -
12 Sobic.002G144025 - -
13 Sobic.010G202700 AP2 domain containing protein, expressed K09284: AP2-like factor, euAP2 lineage
14 Sobic.002G216801 - -
15 Sobic.005G195700 ribonucleoside-diphosphate reductase small chain, putative, expressed K10808: ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2
16 Sobic.001G358900 myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
17 Sobic.007G037700 expressed protein -
18 Sobic.001G275800 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
19 Sobic.006G158500 short-chain dehydrogenase/reductase, putative, expressed K15095: (+)-neomenthol dehydrogenase
20 Sobic.008G167100 cycloartenol synthase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G101850 Sobic005G101850 Sobic001G166000 Sobic001G166000 Sobic005G101850--Sobic001G166000 Sobic001G310166 Sobic001G310166 Sobic005G101850--Sobic001G310166 Sobic005G218100 Sobic005G218100 Sobic005G101850--Sobic005G218100 Sobic004G161650 Sobic004G161650 Sobic005G101850--Sobic004G161650 Sobic005G203600 Sobic005G203600 Sobic005G101850--Sobic005G203600 Sobic002G099401 Sobic002G099401 Sobic005G101850--Sobic002G099401 Sobic005G112900 Sobic005G112900 Sobic005G101850--Sobic005G112900 Sobic002G023400 Sobic002G023400 Sobic005G101850--Sobic002G023400 Sobic004G298400 Sobic004G298400 Sobic005G101850--Sobic004G298400 Sobic001G166000--Sobic002G023400 Sobic001G166000--Sobic005G218100 Sobic001G166000--Sobic005G101850 Sobic001G275800 Sobic001G275800 Sobic001G166000--Sobic001G275800 Sobic002G144025 Sobic002G144025 Sobic001G166000--Sobic002G144025 Sobic008G167100 Sobic008G167100 Sobic001G166000--Sobic008G167100 Sobic007G037700 Sobic007G037700 Sobic001G166000--Sobic007G037700 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic001G166000--Sobic002G047100 Sobic002G316000 Sobic002G316000 Sobic001G166000--Sobic002G316000 Sobic001G310166--Sobic002G099401 Sobic003G035332 Sobic003G035332 Sobic001G310166--Sobic003G035332 Sobic010G221700 Sobic010G221700 Sobic001G310166--Sobic010G221700 Sobic009G113200 Sobic009G113200 Sobic001G310166--Sobic009G113200 Sobic007G104000 Sobic007G104000 Sobic001G310166--Sobic007G104000 Sobic007G038432 Sobic007G038432 Sobic001G310166--Sobic007G038432 Sobic005G195700 Sobic005G195700 Sobic001G310166--Sobic005G195700 Sobic005G218100--Sobic002G023400 Sobic005G218100--Sobic001G275800 Sobic001G229500 Sobic001G229500 Sobic005G218100--Sobic001G229500 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic005G218100--Sobic002G007600 Sobic005G218100--Sobic008G167100 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic005G218100--Sobic005G162300 Sobic005G218100--Sobic001G166000 Sobic005G142900 Sobic005G142900 Sobic005G218100--Sobic005G142900 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic005G218100--Sobic002G017000 Sobic004G161650--Sobic002G099401 Sobic004G161650--Sobic001G310166 Sobic004G161650--Sobic003G035332 Sobic004G161650--Sobic010G221700 Sobic004G180800 Sobic004G180800 Sobic004G161650--Sobic004G180800 Sobic004G161650--Sobic009G113200 Sobic009G161350 Sobic009G161350 Sobic004G161650--Sobic009G161350 Sobic005G203600--Sobic001G275800 Sobic007G090415 Sobic007G090415 Sobic005G203600--Sobic007G090415 Sobic005G020200 Sobic005G020200 Sobic005G203600--Sobic005G020200 Sobic008G130700 Sobic008G130700 Sobic005G203600--Sobic008G130700 Sobic006G001400 Sobic006G001400 Sobic005G203600--Sobic006G001400 Sobic002G190100 Sobic002G190100 Sobic005G203600--Sobic002G190100 Sobic005G203600--Sobic001G229500 Sobic007G123200 Sobic007G123200 Sobic005G203600--Sobic007G123200 Sobic005G121500 Sobic005G121500 Sobic005G203600--Sobic005G121500 Sobic002G099401--Sobic003G035332 Sobic002G099401--Sobic001G310166 Sobic002G099401--Sobic010G221700 Sobic002G099401--Sobic009G113200 Sobic002G099401--Sobic007G104000 Sobic004G043400 Sobic004G043400 Sobic002G099401--Sobic004G043400 Sobic002G099401--Sobic007G038432 Sobic005G112900--Sobic005G101850 Sobic003G184633 Sobic003G184633 Sobic005G112900--Sobic003G184633 Sobic010G113150 Sobic010G113150 Sobic005G112900--Sobic010G113150 Sobic001G184650 Sobic001G184650 Sobic005G112900--Sobic001G184650 Sobic010G006400 Sobic010G006400 Sobic005G112900--Sobic010G006400 Sobic005G112900--Sobic001G166000 Sobic002G216801 Sobic002G216801 Sobic005G112900--Sobic002G216801 Sobic005G112900--Sobic005G218100 Sobic005G112900--Sobic002G144025 Sobic002G023400--Sobic008G167100 Sobic002G023400--Sobic005G218100 Sobic002G023400--Sobic005G162300 Sobic002G023400--Sobic002G144025 Sobic002G023400--Sobic002G216801 Sobic007G104300 Sobic007G104300 Sobic002G023400--Sobic007G104300 Sobic002G023400--Sobic001G166000 Sobic010G161900 Sobic010G161900 Sobic002G023400--Sobic010G161900 Sobic004G166301 Sobic004G166301 Sobic002G023400--Sobic004G166301 Sobic004G298400--Sobic007G123200 Sobic002G348700 Sobic002G348700 Sobic004G298400--Sobic002G348700 Sobic004G298400--Sobic001G275800 Sobic003G420800 Sobic003G420800 Sobic004G298400--Sobic003G420800 Sobic007G210900 Sobic007G210900 Sobic004G298400--Sobic007G210900 Sobic009G102800 Sobic009G102800 Sobic004G298400--Sobic009G102800 Sobic003G029300 Sobic003G029300 Sobic004G298400--Sobic003G029300 Sobic004G154600 Sobic004G154600 Sobic004G298400--Sobic004G154600 Sobic003G038000 Sobic003G038000 Sobic004G298400--Sobic003G038000
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.