Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G412600.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QNY5
Pfam -
Panther DB PTHR33889 PTHR33889:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g14710.1 : transposon protein, putative, Mariner sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G249200 expressed protein -
2 Sobic.008G106400 - -
3 Sobic.004G136800 - -
4 Sobic.002G059800 - -
5 Sobic.007G005000 expressed protein -
6 Sobic.009G121750 - -
7 Sobic.006G099501 - -
8 Sobic.005G079700 expressed protein -
9 Sobic.008G012700 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
10 Sobic.005G208950 - -
11 Sobic.003G429500 - -
12 Sobic.003G161700 expressed protein -
13 Sobic.008G045600 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
14 Sobic.001G355400 40S ribosomal protein S9-2, putative, expressed K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
15 Sobic.005G166300 Brix domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G181400 - -
17 Sobic.003G015100 "domain confirmed by Pfam database, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14487: auxin responsive GH3 gene family
18 Sobic.004G346200 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
19 Sobic.007G199300 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed -
20 Sobic.005G170700 OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G412600 Sobic001G412600 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic001G412600--Sobic006G249200 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic001G412600--Sobic008G106400 Sobic004G136800 Sobic004G136800 Sobic001G412600--Sobic004G136800 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic001G412600--Sobic002G059800 Sobic007G005000 Sobic007G005000 Sobic001G412600--Sobic007G005000 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic001G412600--Sobic009G121750 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic001G412600--Sobic006G099501 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic001G412600--Sobic005G079700 Sobic008G012700 Sobic008G012700 Sobic001G412600--Sobic008G012700 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic005G079700 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic006G249200--Sobic001G509400 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic009G121750 Sobic006G249200--Sobic008G106400 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic006G249200--Sobic002G431200 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic006G249200--Sobic003G233900 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic006G249200--Sobic002G171400 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic008G065400 Sobic008G106400--Sobic005G079700 Sobic008G106400--Sobic002G431200 Sobic001G355400 Sobic001G355400 Sobic008G106400--Sobic001G355400 Sobic008G045600 Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic008G045600 Sobic008G106400--Sobic002G059800 Sobic004G152601 Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic004G152601 Sobic008G106400--Sobic007G005000 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic008G106400--Sobic005G221550 Sobic002G017000 Sobic002G017000 Sobic004G136800--Sobic002G017000 Sobic002G007600 Sobic002G007600 Sobic004G136800--Sobic002G007600 Sobic006G085200 Sobic006G085200 Sobic004G136800--Sobic006G085200 Sobic003G090500 Sobic003G090500 Sobic004G136800--Sobic003G090500 Sobic004G136800--Sobic001G412600 Sobic004G136800--Sobic006G099501 Sobic005G162300 Sobic005G162300 Sobic004G136800--Sobic005G162300 Sobic002G059800--Sobic008G106400 Sobic002G059800--Sobic002G431200 Sobic002G344301 Sobic002G344301 Sobic002G059800--Sobic002G344301 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic002G059800--Sobic005G043400 Sobic002G059800--Sobic006G099501 Sobic007G199300 Sobic007G199300 Sobic002G059800--Sobic007G199300 Sobic002G059800--Sobic009G121750 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic002G059800--Sobic005G127300 Sobic008G007300 Sobic008G007300 Sobic002G059800--Sobic008G007300 Sobic007G005000--Sobic008G045600 Sobic009G159500 Sobic009G159500 Sobic007G005000--Sobic009G159500 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic007G005000--Sobic003G429500 Sobic007G005000--Sobic008G106400 Sobic005G043800 Sobic005G043800 Sobic007G005000--Sobic005G043800 Sobic001G261480 Sobic001G261480 Sobic007G005000--Sobic001G261480 Sobic001G184500 Sobic001G184500 Sobic007G005000--Sobic001G184500 Sobic010G101700 Sobic010G101700 Sobic007G005000--Sobic010G101700 Sobic003G161700 Sobic003G161700 Sobic007G005000--Sobic003G161700 Sobic009G121750--Sobic002G431200 Sobic009G121750--Sobic008G065400 Sobic009G121750--Sobic005G079700 Sobic009G121750--Sobic006G249200 Sobic005G166300 Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic005G166300 Sobic009G121750--Sobic003G429500 Sobic009G121750--Sobic008G106400 Sobic009G121750--Sobic002G171400 Sobic003G366850 Sobic003G366850 Sobic009G121750--Sobic003G366850 Sobic006G099501--Sobic005G043400 Sobic006G099501--Sobic002G059800 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic006G099501--Sobic010G143400 Sobic002G128400 Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic002G128400 Sobic006G099501--Sobic008G106400 Sobic005G148500 Sobic005G148500 Sobic006G099501--Sobic005G148500 Sobic005G085100 Sobic005G085100 Sobic006G099501--Sobic005G085100 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic006G099501--Sobic001G164200 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic006G099501--Sobic002G094500 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic008G044750 Sobic008G012700--Sobic007G199300 Sobic002G244700 Sobic002G244700 Sobic008G012700--Sobic002G244700 Sobic008G012700--Sobic006G249200 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic008G012700--Sobic002G019500 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic008G012700--Sobic002G019750 Sobic001G450300 Sobic001G450300 Sobic008G012700--Sobic001G450300 Sobic008G012700--Sobic002G059800 Sobic001G523100 Sobic001G523100 Sobic008G012700--Sobic001G523100 Sobic008G012700--Sobic005G079700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.