Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G012700.1
Synonym SCL-3, SCL3
Functional annotation GRAS family transcription factor containing protein, expressed
UniProt C5YQI6
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636:SF21 PTHR31636
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G50420 : scarecrow-like 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g04370.1 : GRAS family transcription factor containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.008G012700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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8 Sobic.001G523100 - -
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11 Sobic.002G431200 - -
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13 Sobic.001G412600 expressed protein -
14 Sobic.008G106400 - -
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16 Sobic.009G121750 - -
17 Sobic.001G204700 expressed protein -
18 Sobic.010G153000 expressed protein -
19 Sobic.007G070500 OsFBL41 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
20 Sobic.003G181400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G012700 Sobic008G012700 Sobic007G199300 Sobic007G199300 Sobic008G012700--Sobic007G199300 Sobic002G244700 Sobic002G244700 Sobic008G012700--Sobic002G244700 Sobic006G249200 Sobic006G249200 Sobic008G012700--Sobic006G249200 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic008G012700--Sobic002G019500 Sobic002G019750 Sobic002G019750 Sobic008G012700--Sobic002G019750 Sobic001G450300 Sobic001G450300 Sobic008G012700--Sobic001G450300 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic008G012700--Sobic002G059800 Sobic001G523100 Sobic001G523100 Sobic008G012700--Sobic001G523100 Sobic005G079700 Sobic005G079700 Sobic008G012700--Sobic005G079700 Sobic005G127300 Sobic005G127300 Sobic007G199300--Sobic005G127300 Sobic007G199300--Sobic002G059800 Sobic002G108200 Sobic002G108200 Sobic007G199300--Sobic002G108200 Sobic004G204400 Sobic004G204400 Sobic007G199300--Sobic004G204400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic007G199300--Sobic008G106400 Sobic005G221550 Sobic005G221550 Sobic007G199300--Sobic005G221550 Sobic002G431200 Sobic002G431200 Sobic007G199300--Sobic002G431200 Sobic009G121750 Sobic009G121750 Sobic007G199300--Sobic009G121750 Sobic007G199300--Sobic005G079700 Sobic002G244700--Sobic004G204400 Sobic002G244700--Sobic001G523100 Sobic004G180500 Sobic004G180500 Sobic002G244700--Sobic004G180500 Sobic002G244700--Sobic009G121750 Sobic002G244700--Sobic002G431200 Sobic004G332000 Sobic004G332000 Sobic002G244700--Sobic004G332000 Sobic002G105000 Sobic002G105000 Sobic002G244700--Sobic002G105000 Sobic001G119700 Sobic001G119700 Sobic002G244700--Sobic001G119700 Sobic002G244700--Sobic008G012700 Sobic008G044750 Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic008G044750 Sobic006G249200--Sobic005G079700 Sobic001G509400 Sobic001G509400 Sobic006G249200--Sobic001G509400 Sobic003G066900 Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic003G066900 Sobic006G249200--Sobic009G121750 Sobic006G249200--Sobic008G106400 Sobic006G249200--Sobic002G431200 Sobic003G233900 Sobic003G233900 Sobic006G249200--Sobic003G233900 Sobic002G171400 Sobic002G171400 Sobic006G249200--Sobic002G171400 Sobic002G019500--Sobic002G019750 Sobic006G223800 Sobic006G223800 Sobic002G019500--Sobic006G223800 Sobic008G155600 Sobic008G155600 Sobic002G019500--Sobic008G155600 Sobic002G106000 Sobic002G106000 Sobic002G019500--Sobic002G106000 Sobic006G212500 Sobic006G212500 Sobic002G019500--Sobic006G212500 Sobic010G153000 Sobic010G153000 Sobic002G019500--Sobic010G153000 Sobic002G059866 Sobic002G059866 Sobic002G019500--Sobic002G059866 Sobic004G313300 Sobic004G313300 Sobic002G019500--Sobic004G313300 Sobic001G489150 Sobic001G489150 Sobic002G019500--Sobic001G489150 Sobic002G019750--Sobic002G019500 Sobic007G070500 Sobic007G070500 Sobic002G019750--Sobic007G070500 Sobic002G019750--Sobic001G489150 Sobic006G199700 Sobic006G199700 Sobic002G019750--Sobic006G199700 Sobic002G019750--Sobic006G223800 Sobic002G019750--Sobic008G155600 Sobic005G170700 Sobic005G170700 Sobic002G019750--Sobic005G170700 Sobic002G019750--Sobic002G106000 Sobic005G064700 Sobic005G064700 Sobic002G019750--Sobic005G064700 Sobic004G174800 Sobic004G174800 Sobic001G450300--Sobic004G174800 Sobic003G277100 Sobic003G277100 Sobic001G450300--Sobic003G277100 Sobic001G450300--Sobic008G012700 Sobic008G007300 Sobic008G007300 Sobic001G450300--Sobic008G007300 Sobic004G159600 Sobic004G159600 Sobic001G450300--Sobic004G159600 Sobic001G450300--Sobic002G244700 Sobic001G450300--Sobic006G212500 Sobic003G009400 Sobic003G009400 Sobic001G450300--Sobic003G009400 Sobic001G450300--Sobic007G199300 Sobic002G059800--Sobic008G106400 Sobic002G059800--Sobic002G431200 Sobic002G344301 Sobic002G344301 Sobic002G059800--Sobic002G344301 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic002G059800--Sobic005G043400 Sobic006G099501 Sobic006G099501 Sobic002G059800--Sobic006G099501 Sobic002G059800--Sobic007G199300 Sobic002G059800--Sobic009G121750 Sobic002G059800--Sobic005G127300 Sobic002G059800--Sobic008G007300 Sobic007G089533 Sobic007G089533 Sobic001G523100--Sobic007G089533 Sobic007G051600 Sobic007G051600 Sobic001G523100--Sobic007G051600 Sobic003G015100 Sobic003G015100 Sobic001G523100--Sobic003G015100 Sobic001G523100--Sobic002G244700 Sobic004G245900 Sobic004G245900 Sobic001G523100--Sobic004G245900 Sobic003G361300 Sobic003G361300 Sobic001G523100--Sobic003G361300 Sobic003G429500 Sobic003G429500 Sobic001G523100--Sobic003G429500 Sobic001G523100--Sobic009G121750 Sobic001G450800 Sobic001G450800 Sobic001G523100--Sobic001G450800 Sobic008G065400 Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G065400 Sobic005G079700--Sobic008G106400 Sobic005G079700--Sobic006G249200 Sobic005G079700--Sobic002G431200 Sobic001G140200 Sobic001G140200 Sobic005G079700--Sobic001G140200 Sobic003G374500 Sobic003G374500 Sobic005G079700--Sobic003G374500 Sobic009G159300 Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G159300 Sobic005G079700--Sobic009G121750 Sobic005G079700--Sobic008G044750
Octagon: transcription factors


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