Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G450300.1
Synonym
Functional annotation PPR repeat containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6QPI5
Pfam PF13041 PF01535 PF13812
Panther DB PTHR24015:SF615 PTHR24015
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G47360 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g12430.1 : PPR repeat containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001388
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G174800 expressed protein -
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5 Sobic.004G159600 - -
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13 Sobic.003G119100 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
14 Sobic.004G346200 tetratricopeptide-like helical, putative, expressed -
15 Sobic.008G009000 pentatricopeptide, putative, expressed -
16 Sobic.002G057050 - -
17 Sobic.003G181400 - -
18 Sobic.005G079700 expressed protein -
19 Sobic.004G276133 - -
20 Sobic.010G004400 septum site-determining protein minD, putative, expressed K03609: septum site-determining protein MinD


Gene co-expression network
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Sobic007G199300--Sobic002G108200 Sobic007G199300--Sobic004G204400 Sobic008G106400 Sobic008G106400 Sobic007G199300--Sobic008G106400 Sobic007G199300--Sobic005G221550 Sobic007G199300--Sobic002G431200 Sobic007G199300--Sobic009G121750 Sobic007G199300--Sobic005G079700
Octagon: transcription factors


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