Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G009400.3,Sobic.003G009400.2
Synonym EDA35, Sb03g001000
Functional annotation -
UniProt C5XK84
Pfam PF07065
Panther DB PTHR15323 PTHR15323:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007049; cell cycle


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G05440 : temperature sensing protein-related
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023753
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G014766 - -
2 Sobic.006G212500 - -
3 Sobic.001G334100 1-5-phosphoribosyl-5-5-phosphoribosylaminomethylideneaminoimidazole-4-carboxamide isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed K01814: phosphoribosylformimino-5-aminoimidazole carboxamide ribotide isomerase
4 Sobic.004G025100 pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G039401 - -
6 Sobic.002G183300 GTP binding protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G240900 pentatricopeptide, putative, expressed -
8 Sobic.009G116400 pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.009G155400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide, putative, expressed -
10 Sobic.006G085900 pentatricopeptide, putative, expressed -
11 Sobic.006G069100 pentatricopeptide, putative, expressed -
12 Sobic.008G031200 pentatricopeptide, putative, expressed -
13 Sobic.006G109400 pentatricopeptide, putative, expressed -
14 Sobic.002G103700 - -
15 Sobic.005G013300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -
16 Sobic.003G352100 pentatricopeptide, putative, expressed -
17 Sobic.009G254000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.010G092801 - -
19 Sobic.007G088400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsFBX291 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G462401 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G009400 Sobic003G009400 Sobic003G014766 Sobic003G014766 Sobic003G009400--Sobic003G014766 Sobic006G212500 Sobic006G212500 Sobic003G009400--Sobic006G212500 Sobic001G334100 Sobic001G334100 Sobic003G009400--Sobic001G334100 Sobic004G025100 Sobic004G025100 Sobic003G009400--Sobic004G025100 Sobic008G039401 Sobic008G039401 Sobic003G009400--Sobic008G039401 Sobic002G183300 Sobic002G183300 Sobic003G009400--Sobic002G183300 Sobic002G240900 Sobic002G240900 Sobic003G009400--Sobic002G240900 Sobic009G116400 Sobic009G116400 Sobic003G009400--Sobic009G116400 Sobic009G155400 Sobic009G155400 Sobic003G009400--Sobic009G155400 Sobic003G014766--Sobic002G240900 Sobic003G014766--Sobic001G334100 Sobic006G109400 Sobic006G109400 Sobic003G014766--Sobic006G109400 Sobic006G208400 Sobic006G208400 Sobic003G014766--Sobic006G208400 Sobic010G032300 Sobic010G032300 Sobic003G014766--Sobic010G032300 Sobic003G014766--Sobic003G009400 Sobic005G059400 Sobic005G059400 Sobic003G014766--Sobic005G059400 Sobic002G427300 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Sobic002G172500 Sobic009G155400--Sobic002G172500 Sobic009G155400--Sobic006G262700 Sobic009G155400--Sobic005G210700
Octagon: transcription factors


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