Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G212500.1
Synonym Sb06g028290
Functional annotation -
UniProt C5YFP7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G087000 - -
2 Sobic.005G202000 expressed protein -
3 Sobic.002G019500 OsFBX234 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.009G205400 RING-H2 finger protein ATL2M, putative, expressed -
5 Sobic.002G103700 - -
6 Sobic.003G009400 - -
7 Sobic.004G148600 ankyrin, putative, expressed -
8 Sobic.006G250100 tRNA-specific adenosine deaminase 1, putative, expressed K15440: TAD1, tRNA-specific adenosine deaminase 1
9 Sobic.008G155600 ankyrin-1, putative, expressed -
10 Sobic.001G129500 - -
11 Sobic.005G180800 thioredoxin domain-containing protein 9, putative, expressed -
12 Sobic.008G012700 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
13 Sobic.002G183300 GTP binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G032400 ASH-like SPRY domain containing protein, putative, expressed K14964: Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2
15 Sobic.009G254000 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@serine/threonine-protein kinase, putative, expressed -
16 Sobic.010G241600 RNASEH2A - Putative ribonuclease H2 large subunit, expressed K10743: ribonuclease H2 subunit A
17 Sobic.008G041000 expressed protein -
18 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
19 Sobic.002G244700 cytosolic phospholipase A2 beta, putative, expressed K19219: peptidyl-lysine (3S)-dioxygenase / protease
20 Sobic.006G268000 phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit P, putative, expressed K03861: PIGP, GPI19, phosphatidylinositol N-acetylglucosaminyltransferase subunit P


Gene co-expression network
sample Sobic006G212500 Sobic006G212500 Sobic010G087000 Sobic010G087000 Sobic006G212500--Sobic010G087000 Sobic005G202000 Sobic005G202000 Sobic006G212500--Sobic005G202000 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic006G212500--Sobic002G019500 Sobic009G205400 Sobic009G205400 Sobic006G212500--Sobic009G205400 Sobic002G103700 Sobic002G103700 Sobic006G212500--Sobic002G103700 Sobic003G009400 Sobic003G009400 Sobic006G212500--Sobic003G009400 Sobic004G148600 Sobic004G148600 Sobic006G212500--Sobic004G148600 Sobic006G250100 Sobic006G250100 Sobic006G212500--Sobic006G250100 Sobic008G155600 Sobic008G155600 Sobic006G212500--Sobic008G155600 Sobic010G087000--Sobic006G212500 Sobic002G053200 Sobic002G053200 Sobic010G087000--Sobic002G053200 Sobic004G217900 Sobic004G217900 Sobic010G087000--Sobic004G217900 Sobic003G292932 Sobic003G292932 Sobic010G087000--Sobic003G292932 Sobic002G042900 Sobic002G042900 Sobic010G087000--Sobic002G042900 Sobic003G237100 Sobic003G237100 Sobic010G087000--Sobic003G237100 Sobic001G299800 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Octagon: transcription factors


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