Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G129500.1
Synonym Sb01g011350
Functional annotation -
UniProt C5WNY2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007681
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G129500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G013000 expressed protein -
2 Sobic.007G078300 serine/threonine-protein kinase HT1, putative, expressed -
3 Sobic.002G103700 - -
4 Sobic.001G368900 IQ calmodulin-binding motif family protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G090100 OsSCP28 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K16297: serine carboxypeptidase-like clade II
6 Sobic.009G013400 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed -
7 Sobic.009G227000 expressed protein -
8 Sobic.010G207400 protein kinase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G216800 expressed protein -
10 Sobic.001G170500 expressed protein -
11 Sobic.001G037800 cinnamoyl CoA reductase, putative, expressed -
12 Sobic.005G032400 ASH-like SPRY domain containing protein, putative, expressed K14964: Set1/Ash2 histone methyltransferase complex subunit ASH2
13 Sobic.009G227201 - -
14 Sobic.003G412200 inducer of CBF expression 2, putative, expressed -
15 Sobic.009G071600 no apical meristem protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G153500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
17 Sobic.009G025100 transporter, putative, expressed -
18 Sobic.002G088000 cytokinin-N-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
19 Sobic.007G108000 - -
20 Sobic.001G259300 tran- scriptional repressor JASMONATE ZIM-DOMAIN(PubMedID : 25711704)@zinc-finger protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G129500 Sobic001G129500 Sobic008G013000 Sobic008G013000 Sobic001G129500--Sobic008G013000 Sobic007G078300 Sobic007G078300 Sobic001G129500--Sobic007G078300 Sobic002G103700 Sobic002G103700 Sobic001G129500--Sobic002G103700 Sobic001G368900 Sobic001G368900 Sobic001G129500--Sobic001G368900 Sobic009G090100 Sobic009G090100 Sobic001G129500--Sobic009G090100 Sobic009G013400 Sobic009G013400 Sobic001G129500--Sobic009G013400 Sobic009G227000 Sobic009G227000 Sobic001G129500--Sobic009G227000 Sobic010G207400 Sobic010G207400 Sobic001G129500--Sobic010G207400 Sobic010G216800 Sobic010G216800 Sobic001G129500--Sobic010G216800 Sobic005G188000 Sobic005G188000 Sobic008G013000--Sobic005G188000 Sobic003G156100 Sobic003G156100 Sobic008G013000--Sobic003G156100 Sobic008G013000--Sobic009G227000 Sobic002G088000 Sobic002G088000 Sobic008G013000--Sobic002G088000 Sobic003G350900 Sobic003G350900 Sobic008G013000--Sobic003G350900 Sobic004G085100 Sobic004G085100 Sobic008G013000--Sobic004G085100 Sobic008G064000 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Octagon: transcription factors


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