Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G170500.1
Synonym Sb01g014910
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WT66
Pfam PF04788
Panther DB PTHR31300 PTHR31300:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19540 : Protein of unknown function (DUF620)
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g39160.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017322
Brachypodium KQJ86133 , KQK14232 , KQK14231 , PNT74450 , PNT74451
Barley HORVU4Hr1G013190.12 , HORVU4Hr1G013190.10 , HORVU4Hr1G013190.11 , HORVU4Hr1G013190.4 , HORVU4Hr1G013190.5 , HORVU4Hr1G013190.6 , HORVU4Hr1G013190.7 , HORVU4Hr1G013190.1 , HORVU4Hr1G013190.2 , HORVU4Hr1G013190.3 , HORVU4Hr1G013190.8 , HORVU4Hr1G013190.9
Wheat TraesCS4D02G076200 , TraesCS4B02G077800 , TraesCS5D02G085100 , TraesCS4A02G237300 , TraesCS2A02G194900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G170500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G025100 transporter, putative, expressed -
2 Sobic.009G007500 DNA binding protein, putative, expressed -
3 Sobic.008G088450 - -
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6 Sobic.009G227000 expressed protein -
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11 Sobic.001G068200 - -
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20 Sobic.001G096500 phosphoesterase, putative, expressed K08073: bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase


Gene co-expression network
sample Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic009G025100 Sobic009G025100 Sobic001G170500--Sobic009G025100 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic001G170500--Sobic009G007500 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic001G170500--Sobic008G088450 Sobic010G118200 Sobic010G118200 Sobic001G170500--Sobic010G118200 Sobic009G253800 Sobic009G253800 Sobic001G170500--Sobic009G253800 Sobic009G227000 Sobic009G227000 Sobic001G170500--Sobic009G227000 Sobic004G294500 Sobic004G294500 Sobic001G170500--Sobic004G294500 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic001G170500--Sobic003G024700 Sobic001G518700 Sobic001G518700 Sobic001G170500--Sobic001G518700 Sobic009G025100--Sobic001G170500 Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic009G025100--Sobic008G039700 Sobic010G037200 Sobic010G037200 Sobic009G025100--Sobic010G037200 Sobic010G168500 Sobic010G168500 Sobic009G025100--Sobic010G168500 Sobic008G081700 Sobic008G081700 Sobic009G025100--Sobic008G081700 Sobic009G071600 Sobic009G071600 Sobic009G025100--Sobic009G071600 Sobic010G227400 Sobic010G227400 Sobic009G025100--Sobic010G227400 Sobic009G025100--Sobic008G088450 Sobic002G338600 Sobic002G338600 Sobic009G025100--Sobic002G338600 Sobic009G007500--Sobic008G088450 Sobic009G007500--Sobic004G294500 Sobic009G007500--Sobic001G518700 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic009G007500--Sobic006G062700 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic009G007500--Sobic008G103066 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic009G007500--Sobic001G112250 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic009G007500--Sobic001G249233 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic009G007500--Sobic005G174900 Sobic009G007500--Sobic003G024700 Sobic008G088450--Sobic009G007500 Sobic008G088450--Sobic006G062700 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic008G088450--Sobic010G109700 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic008G088450--Sobic005G056100 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic008G088450--Sobic007G025300 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic008G088450--Sobic008G081000 Sobic008G088450--Sobic001G249233 Sobic008G088450--Sobic008G103066 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic008G088450--Sobic010G200400 Sobic007G091200 Sobic007G091200 Sobic010G118200--Sobic007G091200 Sobic006G104800 Sobic006G104800 Sobic010G118200--Sobic006G104800 Sobic004G294100 Sobic004G294100 Sobic010G118200--Sobic004G294100 Sobic001G425900 Sobic001G425900 Sobic010G118200--Sobic001G425900 Sobic008G071900 Sobic008G071900 Sobic010G118200--Sobic008G071900 Sobic001G142600 Sobic001G142600 Sobic010G118200--Sobic001G142600 Sobic009G168300 Sobic009G168300 Sobic010G118200--Sobic009G168300 Sobic010G102900 Sobic010G102900 Sobic010G118200--Sobic010G102900 Sobic010G118200--Sobic001G170500 Sobic009G253800--Sobic004G294500 Sobic004G190200 Sobic004G190200 Sobic009G253800--Sobic004G190200 Sobic009G253800--Sobic009G007500 Sobic009G253800--Sobic007G091200 Sobic009G253800--Sobic001G518700 Sobic002G141450 Sobic002G141450 Sobic009G253800--Sobic002G141450 Sobic009G253800--Sobic001G170500 Sobic009G253800--Sobic008G088450 Sobic007G023600 Sobic007G023600 Sobic009G253800--Sobic007G023600 Sobic003G156100 Sobic003G156100 Sobic009G227000--Sobic003G156100 Sobic007G083300 Sobic007G083300 Sobic009G227000--Sobic007G083300 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic009G227000--Sobic007G070700 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic009G227000--Sobic003G247700 Sobic006G018400 Sobic006G018400 Sobic009G227000--Sobic006G018400 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic009G227000--Sobic008G064000 SobicK043500 SobicK043500 Sobic009G227000--SobicK043500 Sobic002G211700 Sobic002G211700 Sobic009G227000--Sobic002G211700 Sobic001G535900 Sobic001G535900 Sobic009G227000--Sobic001G535900 Sobic004G294500--Sobic009G007500 Sobic004G294500--Sobic001G518700 Sobic004G294500--Sobic008G088450 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic004G294500--Sobic008G088881 Sobic004G294500--Sobic009G253800 Sobic004G294500--Sobic006G062700 Sobic004G294500--Sobic001G112250 Sobic004G294500--Sobic003G024700 Sobic004G294500--Sobic008G103066 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic003G024700--Sobic010G219300 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic003G024700--Sobic010G034900 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic003G024700--Sobic010G148600 Sobic003G024700--Sobic001G249233 Sobic003G024700--Sobic005G174900 Sobic003G024700--Sobic006G062700 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic003G024700--Sobic005G140400 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic003G024700--Sobic001G096500 Sobic003G024700--Sobic010G109700 Sobic001G518700--Sobic009G007500 Sobic001G518700--Sobic004G294500 Sobic001G518700--Sobic001G112250 Sobic001G518700--Sobic008G088450 Sobic001G518700--Sobic008G103066 Sobic001G518700--Sobic007G091200 Sobic001G518700--Sobic003G156100 Sobic002G077600 Sobic002G077600 Sobic001G518700--Sobic002G077600 Sobic001G518700--Sobic007G070700
Octagon: transcription factors


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