Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G007500.1
Synonym Sb09g000860
Functional annotation DNA binding protein, putative, expressed
UniProt C5YY43
Pfam PF14303
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF299
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47680 : DNA binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g34410.1 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G088450 - -
2 Sobic.004G294500 expansin precursor, putative, expressed -
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13 Sobic.010G109700 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
14 Sobic.005G140400 - -
15 Sobic.005G056100 - -
16 Sobic.007G070700 OsFBX265 - F-box domain containing protein, expressed -
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19 Sobic.002G077600 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.003G156100 OsFBX117 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic009G007500--Sobic008G088450 Sobic004G294500 Sobic004G294500 Sobic009G007500--Sobic004G294500 Sobic001G518700 Sobic001G518700 Sobic009G007500--Sobic001G518700 Sobic006G062700 Sobic006G062700 Sobic009G007500--Sobic006G062700 Sobic008G103066 Sobic008G103066 Sobic009G007500--Sobic008G103066 Sobic001G112250 Sobic001G112250 Sobic009G007500--Sobic001G112250 Sobic001G249233 Sobic001G249233 Sobic009G007500--Sobic001G249233 Sobic005G174900 Sobic005G174900 Sobic009G007500--Sobic005G174900 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic009G007500--Sobic003G024700 Sobic008G088450--Sobic009G007500 Sobic008G088450--Sobic006G062700 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic008G088450--Sobic010G109700 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic008G088450--Sobic005G056100 Sobic007G025300 Sobic007G025300 Sobic008G088450--Sobic007G025300 Sobic008G081000 Sobic008G081000 Sobic008G088450--Sobic008G081000 Sobic008G088450--Sobic001G249233 Sobic008G088450--Sobic008G103066 Sobic010G200400 Sobic010G200400 Sobic008G088450--Sobic010G200400 Sobic004G294500--Sobic009G007500 Sobic004G294500--Sobic001G518700 Sobic004G294500--Sobic008G088450 Sobic008G088881 Sobic008G088881 Sobic004G294500--Sobic008G088881 Sobic009G253800 Sobic009G253800 Sobic004G294500--Sobic009G253800 Sobic004G294500--Sobic006G062700 Sobic004G294500--Sobic001G112250 Sobic004G294500--Sobic003G024700 Sobic004G294500--Sobic008G103066 Sobic001G518700--Sobic009G007500 Sobic001G518700--Sobic004G294500 Sobic001G518700--Sobic001G112250 Sobic001G518700--Sobic008G088450 Sobic001G518700--Sobic008G103066 Sobic007G091200 Sobic007G091200 Sobic001G518700--Sobic007G091200 Sobic003G156100 Sobic003G156100 Sobic001G518700--Sobic003G156100 Sobic002G077600 Sobic002G077600 Sobic001G518700--Sobic002G077600 Sobic007G070700 Sobic007G070700 Sobic001G518700--Sobic007G070700 Sobic006G062700--Sobic005G174900 Sobic006G062700--Sobic001G249233 Sobic006G062700--Sobic008G103066 Sobic006G062700--Sobic007G025300 Sobic005G140400 Sobic005G140400 Sobic006G062700--Sobic005G140400 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic006G062700--Sobic010G148600 Sobic006G062700--Sobic001G112250 Sobic006G062700--Sobic007G070700 Sobic006G062700--Sobic010G109700 Sobic008G103066--Sobic001G112250 Sobic009G001600 Sobic009G001600 Sobic008G103066--Sobic009G001600 Sobic008G103066--Sobic007G025300 Sobic003G247700 Sobic003G247700 Sobic008G103066--Sobic003G247700 Sobic009G245750 Sobic009G245750 Sobic008G103066--Sobic009G245750 Sobic001G253501 Sobic001G253501 Sobic008G103066--Sobic001G253501 Sobic001G535900 Sobic001G535900 Sobic008G103066--Sobic001G535900 Sobic002G211700 Sobic002G211700 Sobic008G103066--Sobic002G211700 Sobic008G103066--Sobic006G062700 Sobic001G112250--Sobic008G103066 Sobic001G112250--Sobic001G253501 Sobic001G112250--Sobic009G245750 Sobic001G112250--Sobic002G077600 Sobic001G112250--Sobic007G070700 Sobic001G112250--Sobic009G001600 Sobic001G112250--Sobic003G247700 Sobic001G112250--Sobic002G211700 Sobic001G112250--Sobic001G535900 Sobic001G249233--Sobic005G174900 Sobic001G249233--Sobic006G062700 Sobic001G249233--Sobic010G148600 Sobic001G249233--Sobic005G140400 Sobic001G249233--Sobic010G109700 Sobic001G249233--Sobic007G025300 Sobic001G249233--Sobic003G024700 Sobic001G249233--Sobic005G056100 Sobic001G249233--Sobic008G103066 Sobic005G174900--Sobic001G249233 Sobic005G174900--Sobic006G062700 Sobic005G174900--Sobic005G140400 Sobic005G174900--Sobic007G025300 Sobic005G174900--Sobic008G103066 Sobic005G174900--Sobic010G148600 Sobic005G174900--Sobic001G253501 Sobic005G174900--Sobic009G245750 Sobic005G174900--Sobic007G070700 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic003G024700--Sobic010G219300 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic003G024700--Sobic010G034900 Sobic003G024700--Sobic010G148600 Sobic003G024700--Sobic001G249233 Sobic003G024700--Sobic005G174900 Sobic003G024700--Sobic006G062700 Sobic003G024700--Sobic005G140400 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic003G024700--Sobic001G096500 Sobic003G024700--Sobic010G109700
Octagon: transcription factors


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