Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G013400.1,Sobic.009G013400.2
Synonym OEP16-1, ATOEP16-1, ATOEP16-L, OEP16, Sb09g001310
Functional annotation mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed
UniProt B3VTC0 , B3VTB6
Pfam PF02466
Panther DB PTHR15371 PTHR15371:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G28900 : outer plastid envelope protein 16-1
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g02060.1 : mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040943 , Zm00025a038263
Brachypodium KQK07975 , KQK07977
Barley HORVU1Hr1G005120.3 , HORVU1Hr1G005120.2 , HORVU1Hr1G005120.1 , HORVU1Hr1G005120.7 , HORVU1Hr1G005120.6 , HORVU1Hr1G005120.5 , HORVU1Hr1G005120.4 , HORVU1Hr1G005120.9 , HORVU1Hr1G005120.8 , HORVU1Hr1G005120.11 , HORVU1Hr1G005120.10
Wheat TraesCS1A02G033600 , TraesCS1A02G033500 , TraesCS1B02G042300 , TraesCS1D02G034700 , TraesCS1D02G034700
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cDNA sequences
Sobic.009G013400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G153500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
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18 Sobic.004G037300 cycloartenol synthase, putative, expressed -
19 Sobic.010G034900 expressed protein -
20 Sobic.003G105600 no apical meristem protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G013400 Sobic009G013400 Sobic003G153500 Sobic003G153500 Sobic009G013400--Sobic003G153500 Sobic007G082900 Sobic007G082900 Sobic009G013400--Sobic007G082900 Sobic005G187100 Sobic005G187100 Sobic009G013400--Sobic005G187100 Sobic008G013100 Sobic008G013100 Sobic009G013400--Sobic008G013100 Sobic003G323000 Sobic003G323000 Sobic009G013400--Sobic003G323000 Sobic004G254400 Sobic004G254400 Sobic009G013400--Sobic004G254400 Sobic001G394100 Sobic001G394100 Sobic009G013400--Sobic001G394100 Sobic009G022700 Sobic009G022700 Sobic009G013400--Sobic009G022700 Sobic008G013000 Sobic008G013000 Sobic009G013400--Sobic008G013000 Sobic003G153500--Sobic009G013400 Sobic008G088450 Sobic008G088450 Sobic003G153500--Sobic008G088450 Sobic009G227000 Sobic009G227000 Sobic003G153500--Sobic009G227000 Sobic009G007500 Sobic009G007500 Sobic003G153500--Sobic009G007500 Sobic010G227400 Sobic010G227400 Sobic003G153500--Sobic010G227400 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic003G153500--Sobic001G170500 Sobic005G056100 Sobic005G056100 Sobic003G153500--Sobic005G056100 Sobic010G109700 Sobic010G109700 Sobic003G153500--Sobic010G109700 Sobic001G096500 Sobic001G096500 Sobic003G153500--Sobic001G096500 Sobic010G219300 Sobic010G219300 Sobic007G082900--Sobic010G219300 Sobic007G082900--Sobic005G187100 Sobic004G196200 Sobic004G196200 Sobic007G082900--Sobic004G196200 Sobic010G034900 Sobic010G034900 Sobic007G082900--Sobic010G034900 Sobic003G024700 Sobic003G024700 Sobic007G082900--Sobic003G024700 Sobic005G153600 Sobic005G153600 Sobic007G082900--Sobic005G153600 Sobic005G225000 Sobic005G225000 Sobic007G082900--Sobic005G225000 Sobic005G199101 Sobic005G199101 Sobic007G082900--Sobic005G199101 Sobic010G153800 Sobic010G153800 Sobic007G082900--Sobic010G153800 Sobic005G187100--Sobic010G153800 Sobic005G187100--Sobic005G199101 Sobic005G187100--Sobic005G225000 Sobic005G187100--Sobic010G219300 Sobic005G187100--Sobic007G082900 Sobic002G091800 Sobic002G091800 Sobic005G187100--Sobic002G091800 Sobic002G344900 Sobic002G344900 Sobic005G187100--Sobic002G344900 Sobic005G187100--Sobic005G153600 Sobic010G148600 Sobic010G148600 Sobic005G187100--Sobic010G148600 Sobic003G105600 Sobic003G105600 Sobic008G013100--Sobic003G105600 Sobic006G059900 Sobic006G059900 Sobic008G013100--Sobic006G059900 Sobic008G013100--Sobic009G022700 Sobic001G326000 Sobic001G326000 Sobic008G013100--Sobic001G326000 Sobic003G438700 Sobic003G438700 Sobic008G013100--Sobic003G438700 Sobic009G186400 Sobic009G186400 Sobic008G013100--Sobic009G186400 Sobic008G013100--Sobic003G323000 Sobic004G313800 Sobic004G313800 Sobic008G013100--Sobic004G313800 Sobic008G013100--Sobic005G187100 Sobic001G259300 Sobic001G259300 Sobic003G323000--Sobic001G259300 Sobic003G323000--Sobic008G013100 Sobic003G323000--Sobic003G105600 Sobic003G350900 Sobic003G350900 Sobic003G323000--Sobic003G350900 Sobic005G188000 Sobic005G188000 Sobic003G323000--Sobic005G188000 Sobic003G323000--Sobic009G022700 Sobic003G323000--Sobic009G186400 Sobic008G064000 Sobic008G064000 Sobic003G323000--Sobic008G064000 Sobic003G323000--Sobic006G059900 Sobic004G254400--Sobic008G013100 Sobic004G254400--Sobic005G187100 Sobic010G031600 Sobic010G031600 Sobic004G254400--Sobic010G031600 Sobic004G254400--Sobic007G082900 Sobic004G254400--Sobic010G219300 Sobic004G254400--Sobic003G323000 Sobic004G254400--Sobic003G105600 Sobic004G254400--Sobic010G034900 Sobic010G136300 Sobic010G136300 Sobic004G254400--Sobic010G136300 Sobic002G143700 Sobic002G143700 Sobic001G394100--Sobic002G143700 Sobic010G142300 Sobic010G142300 Sobic001G394100--Sobic010G142300 Sobic006G034275 Sobic006G034275 Sobic001G394100--Sobic006G034275 Sobic001G394100--Sobic002G344900 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic001G394100--Sobic003G392500 Sobic005G223200 Sobic005G223200 Sobic001G394100--Sobic005G223200 Sobic005G140300 Sobic005G140300 Sobic001G394100--Sobic005G140300 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic001G394100--Sobic009G010000 Sobic006G031600 Sobic006G031600 Sobic001G394100--Sobic006G031600 Sobic009G022700--Sobic003G105600 Sobic009G022700--Sobic008G013100 Sobic009G022700--Sobic009G186400 Sobic009G022700--Sobic001G326000 Sobic009G022700--Sobic006G059900 Sobic002G077500 Sobic002G077500 Sobic009G022700--Sobic002G077500 Sobic009G022700--Sobic003G438700 Sobic009G022700--Sobic004G313800 Sobic009G022700--Sobic003G350900 Sobic008G013000--Sobic005G188000 Sobic003G156100 Sobic003G156100 Sobic008G013000--Sobic003G156100 Sobic008G013000--Sobic009G227000 Sobic002G088000 Sobic002G088000 Sobic008G013000--Sobic002G088000 Sobic008G013000--Sobic003G350900 Sobic004G085100 Sobic004G085100 Sobic008G013000--Sobic004G085100 Sobic008G013000--Sobic008G064000 Sobic001G362900 Sobic001G362900 Sobic008G013000--Sobic001G362900 Sobic001G037800 Sobic001G037800 Sobic008G013000--Sobic001G037800
Octagon: transcription factors


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