Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G013000.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PAX0
Pfam -
Panther DB PTHR34567
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G51940 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g58700.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G188000 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G156100 OsFBX117 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G227000 expressed protein -
4 Sobic.002G088000 cytokinin-N-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
5 Sobic.003G350900 homeobox domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G085100 mitochondrial carrier protein, putative, expressed -
7 Sobic.008G064000 LTPL36 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
8 Sobic.001G362900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 71D7, putative, expressed -
9 Sobic.001G037800 cinnamoyl CoA reductase, putative, expressed -
10 Sobic.006G018400 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@Up-reguralion under drought(PubMedID : 24916767)@protein phosphatase 2C, putative, expressed K14497: protein phosphatase 2C
11 Sobic.004G116200 expressed protein -
12 Sobic.010G034900 expressed protein -
13 Sobic.007G083300 paired amphipathic helix repeat-containing protein, putative, expressed -
14 Sobic.001G297800 expressed protein -
15 Sobic.K043500 MYB family transcription factor, putative, expressed -
16 Sobic.002G417900 nucleotidyltransferase, putative, expressed -
17 Sobic.004G171500 basic helix-loop-helix, putative, expressed -
18 Sobic.001G535900 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
19 Sobic.002G077600 LTPL169 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.002G211700 storage protein(PubMedID : 16668596)@"kafirin seed storage protein, delta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@PROLM23 - Prolamin precursor, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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