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Transcriptome id Sobic.010G087000.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YI12
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G212500 - -
2 Sobic.002G053200 RNA recognition motif containing protein, expressed -
3 Sobic.004G217900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide domain containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G292932 - -
5 Sobic.002G042900 pentatricopeptide, putative, expressed -
6 Sobic.003G237100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CRR2, putative, expressed -
7 Sobic.001G299800 inducer of CBF expression 2, putative, expressed -
8 Sobic.002G059800 - -
9 Sobic.001G152360 - -
10 Sobic.006G250100 tRNA-specific adenosine deaminase 1, putative, expressed K15440: TAD1, tRNA-specific adenosine deaminase 1
11 Sobic.009G088575 - -
12 Sobic.008G007300 HIT zinc finger domain containing protein, expressed K11663: ZNHIT1, zinc finger HIT domain-containing protein 1
13 Sobic.004G148600 ankyrin, putative, expressed -
14 Sobic.004G149800 transcriptional derepression of gliadins and low-molecular-weight glutenins (LMWgs) by active demethylation of their promoters(PubMedID : 23184965)@hhH-GPD superfamily base excision DNA repair protein, expressed -
15 Sobic.001G466600 expressed protein -
16 Sobic.001G187800 aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
17 Sobic.003G067201 - -
18 Sobic.005G127300 expressed protein K14289: exportin-5
19 Sobic.007G077700 expressed protein -
20 Sobic.009G205400 RING-H2 finger protein ATL2M, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G087000 Sobic010G087000 Sobic006G212500 Sobic006G212500 Sobic010G087000--Sobic006G212500 Sobic002G053200 Sobic002G053200 Sobic010G087000--Sobic002G053200 Sobic004G217900 Sobic004G217900 Sobic010G087000--Sobic004G217900 Sobic003G292932 Sobic003G292932 Sobic010G087000--Sobic003G292932 Sobic002G042900 Sobic002G042900 Sobic010G087000--Sobic002G042900 Sobic003G237100 Sobic003G237100 Sobic010G087000--Sobic003G237100 Sobic001G299800 Sobic001G299800 Sobic010G087000--Sobic001G299800 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic010G087000--Sobic002G059800 Sobic001G152360 Sobic001G152360 Sobic010G087000--Sobic001G152360 Sobic006G212500--Sobic010G087000 Sobic005G202000 Sobic005G202000 Sobic006G212500--Sobic005G202000 Sobic002G019500 Sobic002G019500 Sobic006G212500--Sobic002G019500 Sobic009G205400 Sobic009G205400 Sobic006G212500--Sobic009G205400 Sobic002G103700 Sobic002G103700 Sobic006G212500--Sobic002G103700 Sobic003G009400 Sobic003G009400 Sobic006G212500--Sobic003G009400 Sobic004G148600 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Octagon: transcription factors


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