Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G299800.1
Synonym Sb01g029192, ATICE1, SCRM, ICE1
Functional annotation inducer of CBF expression 2, putative, expressed
UniProt C5WSD8
Pfam -
Panther DB PTHR31945 PTHR31945:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G65640 : beta HLH protein 93
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g04310.1 : BHLH transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026188
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G299800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G312800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14841: NSA1, ribosome biogenesis protein NSA1
2 Sobic.001G466600 expressed protein -
3 Sobic.003G089200 expressed protein -
4 Sobic.004G020150 - -
5 Sobic.003G349000 ruvB-like, putative, expressed K04499: RUVBL1, RVB1, RuvB-like protein 1 (pontin 52)
6 Sobic.009G088575 - -
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8 Sobic.009G239400 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
9 Sobic.008G140500 expressed protein -
10 Sobic.002G154400 MIM, putative, expressed -
11 Sobic.006G183701 - -
12 Sobic.004G102600 - -
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14 Sobic.006G142925 - -
15 Sobic.007G018700 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G165401 - -
17 Sobic.004G282200 DUF623 domain containing protein, expressed -
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19 Sobic.009G062701 - -
20 Sobic.005G119300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G299800 Sobic001G299800 Sobic002G312800 Sobic002G312800 Sobic001G299800--Sobic002G312800 Sobic001G466600 Sobic001G466600 Sobic001G299800--Sobic001G466600 Sobic003G089200 Sobic003G089200 Sobic001G299800--Sobic003G089200 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic001G299800--Sobic004G020150 Sobic003G349000 Sobic003G349000 Sobic001G299800--Sobic003G349000 Sobic009G088575 Sobic009G088575 Sobic001G299800--Sobic009G088575 Sobic010G087000 Sobic010G087000 Sobic001G299800--Sobic010G087000 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic001G299800--Sobic009G239400 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic001G299800--Sobic008G140500 Sobic002G312800--Sobic001G466600 Sobic006G095400 Sobic006G095400 Sobic002G312800--Sobic006G095400 Sobic002G312800--Sobic003G349000 Sobic002G312800--Sobic001G299800 Sobic002G154400 Sobic002G154400 Sobic002G312800--Sobic002G154400 Sobic010G241600 Sobic010G241600 Sobic002G312800--Sobic010G241600 Sobic009G042100 Sobic009G042100 Sobic002G312800--Sobic009G042100 Sobic003G282700 Sobic003G282700 Sobic002G312800--Sobic003G282700 Sobic007G053700 Sobic007G053700 Sobic002G312800--Sobic007G053700 Sobic001G466600--Sobic002G312800 Sobic001G466600--Sobic010G241600 Sobic001G466600--Sobic006G095400 Sobic001G466600--Sobic001G299800 Sobic002G046300 Sobic002G046300 Sobic001G466600--Sobic002G046300 Sobic002G329700 Sobic002G329700 Sobic001G466600--Sobic002G329700 Sobic001G152360 Sobic001G152360 Sobic001G466600--Sobic001G152360 Sobic001G466600--Sobic003G089200 Sobic009G228900 Sobic009G228900 Sobic001G466600--Sobic009G228900 Sobic005G050600 Sobic005G050600 Sobic003G089200--Sobic005G050600 Sobic010G009250 Sobic010G009250 Sobic003G089200--Sobic010G009250 Sobic007G018700 Sobic007G018700 Sobic003G089200--Sobic007G018700 Sobic003G089200--Sobic002G046300 Sobic004G200400 Sobic004G200400 Sobic003G089200--Sobic004G200400 Sobic009G122375 Sobic009G122375 Sobic003G089200--Sobic009G122375 Sobic003G089200--Sobic001G299800 Sobic003G089200--Sobic009G042100 Sobic003G089200--Sobic001G466600 Sobic004G020150--Sobic009G239400 Sobic004G020150--Sobic008G140500 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic004G020150--Sobic006G142925 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic004G020150--Sobic003G165401 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic004G020150--Sobic007G127900 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic004G020150--Sobic002G069300 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic004G020150--Sobic008G069100 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic004G020150--Sobic004G102600 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic004G020150--Sobic003G137000 Sobic003G349000--Sobic002G154400 Sobic003G349000--Sobic002G312800 Sobic001G141700 Sobic001G141700 Sobic003G349000--Sobic001G141700 Sobic003G349000--Sobic003G282700 Sobic003G349000--Sobic007G053700 Sobic010G237800 Sobic010G237800 Sobic003G349000--Sobic010G237800 Sobic003G349000--Sobic009G042100 Sobic003G349000--Sobic010G241600 Sobic002G056000 Sobic002G056000 Sobic003G349000--Sobic002G056000 Sobic009G088575--Sobic007G127900 Sobic009G088575--Sobic004G102600 Sobic009G088575--Sobic008G069100 Sobic003G137500 Sobic003G137500 Sobic009G088575--Sobic003G137500 Sobic009G088575--Sobic009G239400 Sobic009G088575--Sobic006G142925 Sobic010G206501 Sobic010G206501 Sobic009G088575--Sobic010G206501 Sobic009G088575--Sobic004G020150 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic009G088575--Sobic001G328350 Sobic006G212500 Sobic006G212500 Sobic010G087000--Sobic006G212500 Sobic002G053200 Sobic002G053200 Sobic010G087000--Sobic002G053200 Sobic004G217900 Sobic004G217900 Sobic010G087000--Sobic004G217900 Sobic003G292932 Sobic003G292932 Sobic010G087000--Sobic003G292932 Sobic002G042900 Sobic002G042900 Sobic010G087000--Sobic002G042900 Sobic003G237100 Sobic003G237100 Sobic010G087000--Sobic003G237100 Sobic010G087000--Sobic001G299800 Sobic002G059800 Sobic002G059800 Sobic010G087000--Sobic002G059800 Sobic010G087000--Sobic001G152360 Sobic009G239400--Sobic006G142925 Sobic009G239400--Sobic007G127900 Sobic009G239400--Sobic008G069100 Sobic009G239400--Sobic002G069300 Sobic009G239400--Sobic004G020150 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic009G239400--Sobic009G019400 Sobic009G239400--Sobic004G102600 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic009G239400--Sobic010G143666 Sobic009G239400--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G137000 Sobic008G140500--Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic006G142925 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic004G055901 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic008G140500--Sobic002G124832 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic008G140500--Sobic010G192200 Sobic008G140500--Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic002G069300
Octagon: transcription factors


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