Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G183701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5REK8
Pfam -
Panther DB PTHR15663 PTHR15663:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g41840.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005258
Brachypodium PNT68488 , KQJ99110
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G090200 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.005G052100 expressed protein -
3 Sobic.001G112350 - -
4 Sobic.002G211400 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
5 Sobic.004G020150 - -
6 Sobic.008G140500 expressed protein -
7 Sobic.001G328350 - -
8 Sobic.007G069800 expressed protein -
9 Sobic.008G143400 - -
10 Sobic.009G029900 C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, expressed -
11 Sobic.006G279000 expressed protein -
12 Sobic.004G187200 ICE-like protease p20 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.004G102600 - -
14 Sobic.002G147500 early fruit mRNA, putative, expressed -
15 Sobic.001G330600 NAD dependent epimerase/dehydratase family protein, putative, expressed -
16 Sobic.003G363300 hydrolase, alpha/beta fold family protein, putative, expressed -
17 Sobic.008G122500 expressed protein -
18 Sobic.007G064400 glycosyl transferase 8 domain containing protein, putative, expressed K18819: inositol 3-alpha-galactosyltransferase
19 Sobic.004G090000 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.004G090300 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic006G183701 Sobic006G183701 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic006G183701--Sobic004G090200 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic006G183701--Sobic005G052100 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic006G183701--Sobic001G112350 Sobic002G211400 Sobic002G211400 Sobic006G183701--Sobic002G211400 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic006G183701--Sobic004G020150 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic006G183701--Sobic008G140500 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic006G183701--Sobic001G328350 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic006G183701--Sobic007G069800 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic006G183701--Sobic008G143400 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic004G090200--Sobic001G330600 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic004G090200--Sobic002G147500 Sobic004G090200--Sobic005G052100 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic004G090200--Sobic004G187200 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic004G090200--Sobic006G279000 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic004G090200--Sobic009G013200 Sobic004G090200--Sobic001G112350 Sobic004G090200--Sobic007G069800 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic004G090200--Sobic004G090300 Sobic005G052100--Sobic007G069800 Sobic005G052100--Sobic001G112350 Sobic002G069800 Sobic002G069800 Sobic005G052100--Sobic002G069800 Sobic005G003100 Sobic005G003100 Sobic005G052100--Sobic005G003100 Sobic007G127700 Sobic007G127700 Sobic005G052100--Sobic007G127700 Sobic005G052100--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic008G143400 Sobic003G213100 Sobic003G213100 Sobic005G052100--Sobic003G213100 Sobic005G052100--Sobic001G330600 Sobic001G112350--Sobic008G143400 Sobic001G112350--Sobic007G069800 Sobic001G112350--Sobic005G052100 Sobic001G112350--Sobic002G069800 Sobic001G112350--Sobic007G127700 Sobic001G112350--Sobic001G328350 Sobic001G112350--Sobic004G090200 Sobic001G112350--Sobic005G003100 Sobic001G112350--Sobic009G013200 Sobic002G211400--Sobic007G069800 Sobic002G211400--Sobic001G112350 Sobic002G211400--Sobic005G052100 Sobic002G211400--Sobic007G127700 Sobic002G211400--Sobic008G143400 Sobic007G091800 Sobic007G091800 Sobic002G211400--Sobic007G091800 Sobic002G211400--Sobic001G328350 Sobic002G211400--Sobic004G090200 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic002G211400--Sobic007G064400 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic004G020150--Sobic009G239400 Sobic004G020150--Sobic008G140500 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic004G020150--Sobic006G142925 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic004G020150--Sobic003G165401 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic004G020150--Sobic007G127900 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic004G020150--Sobic002G069300 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic004G020150--Sobic008G069100 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic004G020150--Sobic004G102600 Sobic003G137000 Sobic003G137000 Sobic004G020150--Sobic003G137000 Sobic008G140500--Sobic003G165401 Sobic008G140500--Sobic003G137000 Sobic008G140500--Sobic004G020150 Sobic008G140500--Sobic006G142925 Sobic004G055901 Sobic004G055901 Sobic008G140500--Sobic004G055901 Sobic002G124832 Sobic002G124832 Sobic008G140500--Sobic002G124832 Sobic010G192200 Sobic010G192200 Sobic008G140500--Sobic010G192200 Sobic008G140500--Sobic009G239400 Sobic008G140500--Sobic002G069300 Sobic001G328350--Sobic004G102600 Sobic001G328350--Sobic008G143400 Sobic001G328350--Sobic001G112350 Sobic001G328350--Sobic007G127900 Sobic001G328350--Sobic007G069800 Sobic001G328350--Sobic009G239400 Sobic001G328350--Sobic005G052100 Sobic004G111650 Sobic004G111650 Sobic001G328350--Sobic004G111650 Sobic001G328350--Sobic002G211400 Sobic007G069800--Sobic005G052100 Sobic007G069800--Sobic001G112350 Sobic007G069800--Sobic007G127700 Sobic007G069800--Sobic002G069800 Sobic007G069800--Sobic008G143400 Sobic007G069800--Sobic005G003100 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic007G069800--Sobic009G051201 Sobic007G069800--Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic009G013200 Sobic008G143400--Sobic001G112350 Sobic008G143400--Sobic007G069800 Sobic008G143400--Sobic001G328350 Sobic008G143400--Sobic005G052100 Sobic008G143400--Sobic002G069800 Sobic008G143400--Sobic007G127700 Sobic008G064100 Sobic008G064100 Sobic008G143400--Sobic008G064100 Sobic008G143400--Sobic002G211400 Sobic008G143400--Sobic004G102600
Octagon: transcription factors


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