Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G211400.1
Synonym Sb02g025486
Functional annotation OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QCP8
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02910.1 : OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT60755 , PNT60756
Barley HORVU2Hr1G062360.1 , HORVU2Hr1G062360.3 , HORVU2Hr1G062360.2 , HORVU6Hr1G077450.1 , HORVU6Hr1G077450.3 , HORVU6Hr1G077450.4 , HORVU6Hr1G077450.7 , HORVU6Hr1G077450.2 , HORVU6Hr1G077450.6
Wheat TraesCS6D02G294100 , TraesCS2D02G258100 , TraesCS1B02G271200 , TraesCS2B02G276400 , TraesCS6A02G314800 , TraesCS1D02G260600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.007G220100 copine, putative, expressed K16280: E3 ubiquitin-protein ligase RGLG


Gene co-expression network
sample Sobic002G211400 Sobic002G211400 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic002G211400--Sobic007G069800 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic002G211400--Sobic001G112350 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic002G211400--Sobic005G052100 Sobic007G127700 Sobic007G127700 Sobic002G211400--Sobic007G127700 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic002G211400--Sobic008G143400 Sobic007G091800 Sobic007G091800 Sobic002G211400--Sobic007G091800 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic002G211400--Sobic001G328350 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic002G211400--Sobic004G090200 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic002G211400--Sobic007G064400 Sobic007G069800--Sobic005G052100 Sobic007G069800--Sobic001G112350 Sobic007G069800--Sobic007G127700 Sobic002G069800 Sobic002G069800 Sobic007G069800--Sobic002G069800 Sobic007G069800--Sobic008G143400 Sobic005G003100 Sobic005G003100 Sobic007G069800--Sobic005G003100 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic007G069800--Sobic009G051201 Sobic003G213100 Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic003G213100 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic007G069800--Sobic009G013200 Sobic001G112350--Sobic008G143400 Sobic001G112350--Sobic007G069800 Sobic001G112350--Sobic005G052100 Sobic001G112350--Sobic002G069800 Sobic001G112350--Sobic007G127700 Sobic001G112350--Sobic001G328350 Sobic001G112350--Sobic004G090200 Sobic001G112350--Sobic005G003100 Sobic001G112350--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic007G069800 Sobic005G052100--Sobic001G112350 Sobic005G052100--Sobic002G069800 Sobic005G052100--Sobic005G003100 Sobic005G052100--Sobic007G127700 Sobic005G052100--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic008G143400 Sobic005G052100--Sobic003G213100 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic005G052100--Sobic001G330600 Sobic007G127700--Sobic007G069800 Sobic007G127700--Sobic009G051201 Sobic007G127700--Sobic005G052100 Sobic007G127700--Sobic002G069800 Sobic007G127700--Sobic003G213100 Sobic007G127700--Sobic001G112350 Sobic007G127700--Sobic009G013200 Sobic007G127700--Sobic005G003100 Sobic007G127700--Sobic001G330600 Sobic008G143400--Sobic001G112350 Sobic008G143400--Sobic007G069800 Sobic008G143400--Sobic001G328350 Sobic008G143400--Sobic005G052100 Sobic008G143400--Sobic002G069800 Sobic008G143400--Sobic007G127700 Sobic008G064100 Sobic008G064100 Sobic008G143400--Sobic008G064100 Sobic008G143400--Sobic002G211400 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic008G143400--Sobic004G102600 Sobic007G091800--Sobic002G211400 Sobic007G091800--Sobic007G127700 Sobic002G104700 Sobic002G104700 Sobic007G091800--Sobic002G104700 Sobic003G048900 Sobic003G048900 Sobic007G091800--Sobic003G048900 Sobic007G091800--Sobic007G069800 Sobic003G149600 Sobic003G149600 Sobic007G091800--Sobic003G149600 Sobic007G091800--Sobic007G064400 Sobic001G297300 Sobic001G297300 Sobic007G091800--Sobic001G297300 Sobic007G091800--Sobic001G112350 Sobic001G328350--Sobic004G102600 Sobic001G328350--Sobic008G143400 Sobic001G328350--Sobic001G112350 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic001G328350--Sobic007G127900 Sobic001G328350--Sobic007G069800 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic001G328350--Sobic009G239400 Sobic001G328350--Sobic005G052100 Sobic004G111650 Sobic004G111650 Sobic001G328350--Sobic004G111650 Sobic001G328350--Sobic002G211400 Sobic004G090200--Sobic001G330600 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic004G090200--Sobic002G147500 Sobic004G090200--Sobic005G052100 Sobic004G187200 Sobic004G187200 Sobic004G090200--Sobic004G187200 Sobic006G279000 Sobic006G279000 Sobic004G090200--Sobic006G279000 Sobic004G090200--Sobic009G013200 Sobic004G090200--Sobic001G112350 Sobic004G090200--Sobic007G069800 Sobic004G090300 Sobic004G090300 Sobic004G090200--Sobic004G090300 Sobic001G234000 Sobic001G234000 Sobic007G064400--Sobic001G234000 Sobic007G064400--Sobic004G187200 Sobic007G064400--Sobic004G090300 Sobic007G064400--Sobic006G279000 Sobic007G064400--Sobic004G090200 Sobic002G059100 Sobic002G059100 Sobic007G064400--Sobic002G059100 Sobic007G156400 Sobic007G156400 Sobic007G064400--Sobic007G156400 Sobic007G064400--Sobic001G297300 Sobic007G064400--Sobic002G147500
Octagon: transcription factors


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