Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G328350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S8T6
Pfam PF14303
Panther DB PTHR11260 PTHR11260:SF299
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G47680 : DNA binding
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g54440.1 : transposon protein, putative, Pong sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G102600 - -
2 Sobic.008G143400 - -
3 Sobic.001G112350 - -
4 Sobic.007G127900 DUF581 domain containing protein, expressed -
5 Sobic.007G069800 expressed protein -
6 Sobic.009G239400 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
7 Sobic.005G052100 expressed protein -
8 Sobic.004G111650 - -
9 Sobic.002G211400 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
10 Sobic.004G020150 - -
11 Sobic.006G077800 expressed protein -
12 Sobic.008G140500 expressed protein -
13 Sobic.003G137500 OsMADS87 - MADS-box family gene with M-gamma type-box, expressed -
14 Sobic.006G142925 - -
15 Sobic.007G127700 DUF581 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G090200 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.008G069100 expressed protein -
18 Sobic.002G069800 OsFBX221 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G104700 expressed protein -
20 Sobic.004G282200 DUF623 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic001G328350--Sobic004G102600 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic001G328350--Sobic008G143400 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic001G328350--Sobic001G112350 Sobic007G127900 Sobic007G127900 Sobic001G328350--Sobic007G127900 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic001G328350--Sobic007G069800 Sobic009G239400 Sobic009G239400 Sobic001G328350--Sobic009G239400 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic001G328350--Sobic005G052100 Sobic004G111650 Sobic004G111650 Sobic001G328350--Sobic004G111650 Sobic002G211400 Sobic002G211400 Sobic001G328350--Sobic002G211400 Sobic004G102600--Sobic001G328350 Sobic004G102600--Sobic007G127900 Sobic004G102600--Sobic009G239400 Sobic004G020150 Sobic004G020150 Sobic004G102600--Sobic004G020150 Sobic008G069100 Sobic008G069100 Sobic004G102600--Sobic008G069100 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic004G102600--Sobic006G142925 Sobic004G102600--Sobic004G111650 Sobic004G102600--Sobic008G143400 Sobic008G140500 Sobic008G140500 Sobic004G102600--Sobic008G140500 Sobic008G143400--Sobic001G112350 Sobic008G143400--Sobic007G069800 Sobic008G143400--Sobic001G328350 Sobic008G143400--Sobic005G052100 Sobic002G069800 Sobic002G069800 Sobic008G143400--Sobic002G069800 Sobic007G127700 Sobic007G127700 Sobic008G143400--Sobic007G127700 Sobic008G064100 Sobic008G064100 Sobic008G143400--Sobic008G064100 Sobic008G143400--Sobic002G211400 Sobic008G143400--Sobic004G102600 Sobic001G112350--Sobic008G143400 Sobic001G112350--Sobic007G069800 Sobic001G112350--Sobic005G052100 Sobic001G112350--Sobic002G069800 Sobic001G112350--Sobic007G127700 Sobic001G112350--Sobic001G328350 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic001G112350--Sobic004G090200 Sobic005G003100 Sobic005G003100 Sobic001G112350--Sobic005G003100 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic001G112350--Sobic009G013200 Sobic007G127900--Sobic009G239400 Sobic007G127900--Sobic004G102600 Sobic007G127900--Sobic008G069100 Sobic007G127900--Sobic006G142925 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic007G127900--Sobic002G069300 Sobic009G019400 Sobic009G019400 Sobic007G127900--Sobic009G019400 Sobic007G127900--Sobic004G020150 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic007G127900--Sobic010G143666 Sobic007G127900--Sobic008G140500 Sobic007G069800--Sobic005G052100 Sobic007G069800--Sobic001G112350 Sobic007G069800--Sobic007G127700 Sobic007G069800--Sobic002G069800 Sobic007G069800--Sobic008G143400 Sobic007G069800--Sobic005G003100 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic007G069800--Sobic009G051201 Sobic003G213100 Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic009G013200 Sobic009G239400--Sobic006G142925 Sobic009G239400--Sobic007G127900 Sobic009G239400--Sobic008G069100 Sobic009G239400--Sobic002G069300 Sobic009G239400--Sobic004G020150 Sobic009G239400--Sobic009G019400 Sobic009G239400--Sobic004G102600 Sobic009G239400--Sobic010G143666 Sobic003G165401 Sobic003G165401 Sobic009G239400--Sobic003G165401 Sobic005G052100--Sobic007G069800 Sobic005G052100--Sobic001G112350 Sobic005G052100--Sobic002G069800 Sobic005G052100--Sobic005G003100 Sobic005G052100--Sobic007G127700 Sobic005G052100--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic008G143400 Sobic005G052100--Sobic003G213100 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic005G052100--Sobic001G330600 Sobic004G111650--Sobic004G102600 Sobic004G111650--Sobic007G127900 Sobic004G111650--Sobic001G328350 Sobic004G111650--Sobic009G239400 Sobic001G371650 Sobic001G371650 Sobic004G111650--Sobic001G371650 Sobic004G282200 Sobic004G282200 Sobic004G111650--Sobic004G282200 Sobic004G111650--Sobic008G069100 Sobic004G111650--Sobic006G142925 Sobic004G111650--Sobic009G019400 Sobic002G211400--Sobic007G069800 Sobic002G211400--Sobic001G112350 Sobic002G211400--Sobic005G052100 Sobic002G211400--Sobic007G127700 Sobic002G211400--Sobic008G143400 Sobic007G091800 Sobic007G091800 Sobic002G211400--Sobic007G091800 Sobic002G211400--Sobic001G328350 Sobic002G211400--Sobic004G090200 Sobic007G064400 Sobic007G064400 Sobic002G211400--Sobic007G064400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.