Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G069800.2
Synonym Sb07g005516
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R9C2
Pfam -
Panther DB PTHR12606 PTHR12606:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g16220.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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12 Sobic.004G090200 OsFBX46 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.003G225800 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
14 Sobic.002G211400 OsFBL33 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
15 Sobic.005G035500 expressed protein -
16 Sobic.005G197000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi
17 Sobic.008G064100 flavin monooxygenase, putative, expressed K11816: indole-3-pyruvate monooxygenase
18 Sobic.002G147500 early fruit mRNA, putative, expressed -
19 Sobic.010G111400 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
20 Sobic.002G234100 2-aminoethanethiol dioxygenase, putative, expressed K10712: cysteamine dioxygenase


Gene co-expression network
sample Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic007G069800--Sobic005G052100 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic007G069800--Sobic001G112350 Sobic007G127700 Sobic007G127700 Sobic007G069800--Sobic007G127700 Sobic002G069800 Sobic002G069800 Sobic007G069800--Sobic002G069800 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic007G069800--Sobic008G143400 Sobic005G003100 Sobic005G003100 Sobic007G069800--Sobic005G003100 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic007G069800--Sobic009G051201 Sobic003G213100 Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic003G213100 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic007G069800--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic007G069800 Sobic005G052100--Sobic001G112350 Sobic005G052100--Sobic002G069800 Sobic005G052100--Sobic005G003100 Sobic005G052100--Sobic007G127700 Sobic005G052100--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic008G143400 Sobic005G052100--Sobic003G213100 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic005G052100--Sobic001G330600 Sobic001G112350--Sobic008G143400 Sobic001G112350--Sobic007G069800 Sobic001G112350--Sobic005G052100 Sobic001G112350--Sobic002G069800 Sobic001G112350--Sobic007G127700 Sobic001G328350 Sobic001G328350 Sobic001G112350--Sobic001G328350 Sobic004G090200 Sobic004G090200 Sobic001G112350--Sobic004G090200 Sobic001G112350--Sobic005G003100 Sobic001G112350--Sobic009G013200 Sobic007G127700--Sobic007G069800 Sobic007G127700--Sobic009G051201 Sobic007G127700--Sobic005G052100 Sobic007G127700--Sobic002G069800 Sobic007G127700--Sobic003G213100 Sobic007G127700--Sobic001G112350 Sobic007G127700--Sobic009G013200 Sobic007G127700--Sobic005G003100 Sobic007G127700--Sobic001G330600 Sobic002G069800--Sobic003G213100 Sobic002G069800--Sobic005G003100 Sobic002G069800--Sobic009G051201 Sobic002G069800--Sobic005G052100 Sobic002G069800--Sobic007G069800 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic002G069800--Sobic005G035500 Sobic003G225800 Sobic003G225800 Sobic002G069800--Sobic003G225800 Sobic005G197000 Sobic005G197000 Sobic002G069800--Sobic005G197000 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic002G069800--Sobic002G217000 Sobic008G143400--Sobic001G112350 Sobic008G143400--Sobic007G069800 Sobic008G143400--Sobic001G328350 Sobic008G143400--Sobic005G052100 Sobic008G143400--Sobic002G069800 Sobic008G143400--Sobic007G127700 Sobic008G064100 Sobic008G064100 Sobic008G143400--Sobic008G064100 Sobic002G211400 Sobic002G211400 Sobic008G143400--Sobic002G211400 Sobic004G102600 Sobic004G102600 Sobic008G143400--Sobic004G102600 Sobic005G003100--Sobic003G213100 Sobic005G003100--Sobic002G069800 Sobic005G003100--Sobic009G051201 Sobic005G075000 Sobic005G075000 Sobic005G003100--Sobic005G075000 Sobic005G003100--Sobic003G225800 Sobic005G003100--Sobic009G013200 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic005G003100--Sobic002G101200 Sobic005G003100--Sobic002G217000 Sobic005G003100--Sobic005G052100 Sobic009G051201--Sobic003G213100 Sobic009G051201--Sobic003G225800 Sobic009G051201--Sobic002G101200 Sobic009G051201--Sobic002G217000 Sobic009G051201--Sobic005G197000 Sobic009G051201--Sobic002G069800 Sobic009G051201--Sobic005G003100 Sobic007G209700 Sobic007G209700 Sobic009G051201--Sobic007G209700 Sobic009G051201--Sobic009G013200 Sobic003G213100--Sobic003G225800 Sobic003G213100--Sobic005G197000 Sobic003G213100--Sobic002G217000 Sobic003G213100--Sobic009G051201 Sobic003G213100--Sobic002G069800 Sobic005G089101 Sobic005G089101 Sobic003G213100--Sobic005G089101 Sobic003G213100--Sobic005G003100 Sobic003G213100--Sobic009G013200 Sobic003G213100--Sobic002G101200 Sobic009G013200--Sobic001G330600 Sobic007G122932 Sobic007G122932 Sobic009G013200--Sobic007G122932 Sobic002G147500 Sobic002G147500 Sobic009G013200--Sobic002G147500 Sobic009G013200--Sobic003G213100 Sobic009G013200--Sobic005G075000 Sobic009G013200--Sobic005G003100 Sobic007G123000 Sobic007G123000 Sobic009G013200--Sobic007G123000 Sobic009G013200--Sobic009G051201 Sobic009G013200--Sobic003G225800
Octagon: transcription factors


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