Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G035500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5RHP5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G46580 : methyl-CPG-binding domain protein 5
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g11730.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G035500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G059500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G040101 - -
3 Sobic.007G025100 expressed protein -
4 Sobic.002G300900 - -
5 Sobic.006G004100 no apical meristem protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G111400 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
7 Sobic.002G058900 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.007G131100 jmjC domain containing protein, expressed K15601: [histone H3]-dimethyl-L-lysine9 demethylase
9 Sobic.003G266100 ESP4, putative, expressed K06100: symplekin
10 Sobic.008G159300 KUN1 - Kunitz-type trypsin inhibitor precursor, expressed -
11 Sobic.005G197000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi
12 Sobic.002G069800 OsFBX221 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.002G217000 expressed protein -
14 Sobic.001G297700 expressed protein -
15 Sobic.001G029700 ELM2 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G511400 BES1/BZR1 homolog protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G015400 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
18 Sobic.003G213100 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G161300 vacuolar-processing enzyme precursor, putative, expressed K01369: legumain
20 Sobic.002G172200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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