Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G069800.1
Synonym
Functional annotation OsFBX221 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1W0W2P9
Pfam PF08268 PF00646
Panther DB PTHR31790 PTHR31790:SF20
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G27520 : F-box and associated interaction domains-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g09814.1 : OsFBX221 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G213100 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G003100 expressed protein -
3 Sobic.009G051201 - -
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8 Sobic.005G197000 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed K14411: RNA-binding protein Musashi
9 Sobic.002G217000 expressed protein -
10 Sobic.007G127700 DUF581 domain containing protein, expressed -
11 Sobic.002G101200 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10638: UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1
12 Sobic.009G013200 - -
13 Sobic.010G111400 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
14 Sobic.002G058900 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.006G161300 vacuolar-processing enzyme precursor, putative, expressed K01369: legumain
16 Sobic.006G004100 no apical meristem protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G112350 - -
18 Sobic.003G076400 ZOS1-07 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
19 Sobic.005G075000 LTPL33 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
20 Sobic.002G059500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G069800 Sobic002G069800 Sobic003G213100 Sobic003G213100 Sobic002G069800--Sobic003G213100 Sobic005G003100 Sobic005G003100 Sobic002G069800--Sobic005G003100 Sobic009G051201 Sobic009G051201 Sobic002G069800--Sobic009G051201 Sobic005G052100 Sobic005G052100 Sobic002G069800--Sobic005G052100 Sobic007G069800 Sobic007G069800 Sobic002G069800--Sobic007G069800 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic002G069800--Sobic005G035500 Sobic003G225800 Sobic003G225800 Sobic002G069800--Sobic003G225800 Sobic005G197000 Sobic005G197000 Sobic002G069800--Sobic005G197000 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic002G069800--Sobic002G217000 Sobic003G213100--Sobic003G225800 Sobic003G213100--Sobic005G197000 Sobic003G213100--Sobic002G217000 Sobic003G213100--Sobic009G051201 Sobic003G213100--Sobic002G069800 Sobic005G089101 Sobic005G089101 Sobic003G213100--Sobic005G089101 Sobic003G213100--Sobic005G003100 Sobic009G013200 Sobic009G013200 Sobic003G213100--Sobic009G013200 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic003G213100--Sobic002G101200 Sobic005G003100--Sobic003G213100 Sobic005G003100--Sobic002G069800 Sobic005G003100--Sobic009G051201 Sobic005G075000 Sobic005G075000 Sobic005G003100--Sobic005G075000 Sobic005G003100--Sobic003G225800 Sobic005G003100--Sobic009G013200 Sobic005G003100--Sobic002G101200 Sobic005G003100--Sobic002G217000 Sobic005G003100--Sobic005G052100 Sobic009G051201--Sobic003G213100 Sobic009G051201--Sobic003G225800 Sobic009G051201--Sobic002G101200 Sobic009G051201--Sobic002G217000 Sobic009G051201--Sobic005G197000 Sobic009G051201--Sobic002G069800 Sobic009G051201--Sobic005G003100 Sobic007G209700 Sobic007G209700 Sobic009G051201--Sobic007G209700 Sobic009G051201--Sobic009G013200 Sobic005G052100--Sobic007G069800 Sobic001G112350 Sobic001G112350 Sobic005G052100--Sobic001G112350 Sobic005G052100--Sobic002G069800 Sobic005G052100--Sobic005G003100 Sobic007G127700 Sobic007G127700 Sobic005G052100--Sobic007G127700 Sobic005G052100--Sobic009G013200 Sobic008G143400 Sobic008G143400 Sobic005G052100--Sobic008G143400 Sobic005G052100--Sobic003G213100 Sobic001G330600 Sobic001G330600 Sobic005G052100--Sobic001G330600 Sobic007G069800--Sobic005G052100 Sobic007G069800--Sobic001G112350 Sobic007G069800--Sobic007G127700 Sobic007G069800--Sobic002G069800 Sobic007G069800--Sobic008G143400 Sobic007G069800--Sobic005G003100 Sobic007G069800--Sobic009G051201 Sobic007G069800--Sobic003G213100 Sobic007G069800--Sobic009G013200 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic005G035500--Sobic002G059500 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic005G035500--Sobic006G040101 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic005G035500--Sobic007G025100 Sobic002G300900 Sobic002G300900 Sobic005G035500--Sobic002G300900 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic005G035500--Sobic006G004100 Sobic010G111400 Sobic010G111400 Sobic005G035500--Sobic010G111400 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic005G035500--Sobic002G058900 Sobic007G131100 Sobic007G131100 Sobic005G035500--Sobic007G131100 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic005G035500--Sobic003G266100 Sobic003G225800--Sobic005G197000 Sobic003G225800--Sobic003G213100 Sobic003G225800--Sobic002G217000 Sobic003G225800--Sobic005G089101 Sobic002G100000 Sobic002G100000 Sobic003G225800--Sobic002G100000 Sobic003G225800--Sobic006G004100 Sobic003G225800--Sobic002G101200 Sobic003G307600 Sobic003G307600 Sobic003G225800--Sobic003G307600 Sobic007G037200 Sobic007G037200 Sobic003G225800--Sobic007G037200 Sobic005G197000--Sobic003G225800 Sobic005G197000--Sobic002G217000 Sobic005G197000--Sobic003G213100 Sobic005G197000--Sobic005G089101 Sobic005G197000--Sobic006G004100 Sobic005G197000--Sobic002G100000 Sobic004G220900 Sobic004G220900 Sobic005G197000--Sobic004G220900 Sobic005G197000--Sobic002G058900 Sobic005G197000--Sobic007G037200 Sobic002G217000--Sobic003G225800 Sobic002G217000--Sobic002G101200 Sobic002G217000--Sobic005G197000 Sobic002G217000--Sobic002G058900 Sobic002G217000--Sobic007G037200 Sobic002G217000--Sobic005G089101 Sobic005G032500 Sobic005G032500 Sobic002G217000--Sobic005G032500 Sobic002G217000--Sobic002G100000 Sobic002G217000--Sobic006G004100
Octagon: transcription factors


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